在第一階段的氣候工程取得階段性成功後，科學家們的下一個目標是改善火星土壤的生態結構。
火星地表土壤的成分主要是礦物質和細沙，不具備足夠的營養元素支持大規模植被的生長。科學家們意識到，若要火星真正實現生態複蘇，必須改善土壤，使其能夠自給自足地支持植物和微生物的生長。
艾倫帶領團隊決定嘗試生物修複技術，將經過改良的微生物菌群引入火星土壤中，這些菌群能夠從礦物質中提取必要的元素，為植物提供養分，同時促進有機質的累積。這樣一來，火星的土壤將逐漸形成一個自我維持的微生態係統，為未來的生物多樣性提供基礎。
“艾倫，這項實驗如果成功，將徹底改變火星的土壤環境，使之具備生長更多種類植物的潛力。”一位研究員說道，眼中充滿了期待。
艾倫點頭，“我們還需要逐步觀察菌群的適應情況，確保它們能夠穩定生存並且與植物根係共生。隻有這樣，火星的土壤生態才能逐漸成形。”
生物修複實驗啟動後，火星的土壤開始出現明顯變化，菌群的引入加速了土壤中的有機質積累，第一批引入的植物生長狀態良好。然而，隨著菌群的擴散，艾倫逐漸發現菌群的分布不均，有些區域的菌群迅速擴展，甚至形成了單一菌落，抑製了其他微生物的生長。
“諾亞，菌群的生長速度超出了我們的預期，它們在某些區域的擴散已經打破了微生態的平衡。”艾倫憂心忡忡地說道，意識到菌群失控可能帶來土壤的生態失衡，甚至導致植被衰退。
諾亞分析道，“這可能是菌群之間的競爭性擴散。我們需要找到調控方法，使菌群的擴展保持在適當的平衡狀態。”
為了重新控製菌群的擴散，艾倫帶領團隊通過在土壤中引入第二層菌群，試圖抑製單一菌群的擴展，保持土壤生態的多樣性。經過反複調試，他們成功平衡了菌群的比例，逐步恢複了土壤的微生態平衡。
在土壤生態逐步穩定之際，火星的氣候係統突然出現了劇烈波動。伴隨著氣流調控係統的運作，一股強勁的氣流在火星表層聚集，氣壓迅速下降，烏雲密布，整個地表被紅色沙塵籠罩。科學家們驚訝地發現，火星的天氣係統正經曆一場前所未有的暴風雨。
“這是火星的第一場暴風雨！但這場暴風雨的強度遠超我們預料，可能會對植被和土壤造成極大的破壞。”艾倫在觀測台上看著遠處的風暴，臉上寫滿了擔憂。
暴風雨肆虐火星的赤道區域，強勁的氣流卷起塵沙，將剛剛紮根的植物連根拔起，雨水衝刷著脆弱的土壤，破壞了新建立的菌群生態。艾倫立刻組織人員前往受災區域，嘗試保護植物樣本，並儘可能減少土壤流失。
“這場暴風雨是氣流係統失衡的結果，我們的人工調控還不夠成熟。火星的氣候係統太過複雜，我們的控製設備可能需要進一步優化。”艾倫對團隊成員說道，內心清楚火星的自然力量依舊難以掌控。
在暴風雨結束後，科學家們統計損失，發現植被覆蓋麵積減少了近30，土壤中菌群的數量也顯著下降。艾倫意識到，火星的天氣係統比地球更為極端，任何調控措施都必須小心謹慎，否則將導致生態崩潰。
為了避免再次發生暴風雨破壞，艾倫和諾亞決定對火星的天氣調控係統進行優化。經過反複試驗，他們發現火星的氣候調控需要遵循一個穩態循環——即保持氣流、濕度和氣溫之間的平衡，不讓任何一個變量過度波動，以免引發極端天氣。
諾亞提出了一種反饋調節機製，利用傳感器實時監測火星的氣候參數，自動調整氣流和溫度，確保整個係統始終處於穩定的循環狀態。這樣可以減緩極端天氣的出現概率，為火星的生態複蘇提供更安全的環境。
在新的調控機製下，火星的天氣逐漸趨於平穩，暴風雨的頻率顯著下降，雲層逐漸均勻分布，地表溫度也相對穩定，植物的生長環境得到顯著改善。艾倫鬆了一口氣，意識到他們的調控係統終於找到了火星生態的穩態節奏。
隨著火星氣候逐漸穩定，科學家們觀察到引入的植物開始發生微妙的變異，出現了一些地球上從未見過的特征。某些植物的葉片變得更加厚實，根係更為發達，適應性顯著增強，能夠紮根於火星乾燥的土壤中，抵禦強風和沙塵。
“這些植物在火星環境中發生了自發進化，它們的生存能力遠超我們的預期。”諾亞驚歎道。
艾倫觀察到，這種進化可能是火星土壤中菌群的影響，也可能是氣候係統帶來的自然選擇結果。科學家們決定繼續監測這些變異植物的適應過程，以便在未來引入更多適應火星氣候的物種，逐步豐富火星的生態多樣性。
“如果這些植物能夠穩定地在火星上繁衍，我們的氣候工程將進入一個全新的階段——自我維持的生態係統。”艾倫說道，眼中充滿了期待。
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