僅僅一個月後，美軍將領約翰·d·斯洛特率軍到達索諾馬，宣布當地為美國領土。麵對這一形勢，加利福尼亞共和國不得不放棄獨立，選擇加入美國。
至此，存在僅一個月的加利福尼亞共和國便宣告解體。美軍隨後繼續向上加利福尼亞各地推進，很快便占領了整個上加利福尼亞地區。
但由於南北戰爭的戰場遠離加利福利亞，在這裡，西班牙等殖民者撤離之後，美國人也沒有天然的敵人，所以在內戰期間，北方也沒有多少兵力在此駐紮。
加利福利亞處在曆史上混亂的時期，移民自行組織著村鎮建設，屠殺印第安人，蠶食他們的土地然後開礦和種植。
攻占舊金山灣在戰爭上的難度不大，關鍵是要守住這一片土地，因為一旦占領之後，勢必會迎來美國人的瘋狂反撲。好不容易將歐洲其他殖民者趕出北美，大力攫取土地的美國人絕不會容忍這時候突然插進一隻手，而且是他們一貫認為孱弱的中國人的手。
軍事行動還必須等著寧波後續船隻的到來，這些船隻將滿載陸戰士兵和糧食在夏威夷基地登陸。
不過，夏威夷不是阿拉斯加那種極北之地，來往的商船會在這裡補充給養，占領夏威夷的消息隱瞞不了多長時間，所以，不可能等到李秀成調來大部分兵力才動手，於是軍事行動在一個多月後，兩班次船隻到達後開始了。
電報機在此時的戰爭中起到了非常大的作用，讓來自四個方向的軍隊協調一致的出現在舊金山灣的海陸方向。
美國海軍大部分的軍艦都在大西洋，這裡隻有幾艘蒸汽機炮艦和一艘風帆戰列艦。
陸上，隻有2000多人的西北軍，還有一些自治的武裝。這已經很多了，要知道美國獲得加利福尼亞的聖帕斯誇爾戰役雙方都隻有幾百人參戰，美軍死了31人。
相比之下，李秀成的太平軍是從屍山血海的戰爭磨盤裡走出戰爭集團，無論陳玉成、李世賢，還是黃呈忠，見過的死人堆起來都是一座山。
黃呈忠從北方南下攻打馬林半島，從夏威夷領軍的是陳炳文，他負責攻打舊金山半島。
陳玉成負責攻打瓦列霍，然後拿下卡基尼斯海峽，待海上軍隊進入後，再北上掃蕩。
李世賢則負責掃蕩整個灣區內部的城市從費列蒙到奧克蘭，從匹茲堡到裡士滿。
一天之內，美國在舊金山灣區的海軍全部覆滅，黃呈忠突破金門海峽進入舊金山灣，配合陸軍開始挨個轟炸內部的城鎮。
陳炳文則在舊金山半島兩側沿岸轟炸城鎮。
第二天，黃呈忠的軍艦到達卡基尼斯海峽之後，陳玉成立即掉頭北上，帶領軍隊向斯帕克斯和卡森城一帶進軍，拿下那裡作為防線。
李世賢繼續在灣區進行掃蕩，戰事雖然不膠著，這些城鎮都不是太平軍的一合之敵，但是城鎮的居民大多數都是傾家蕩產來西部的，百分之八十都是男性，都是來賭博命運的，還有一些就是彆的國家的逃犯，在這裡洗白藏匿，他們抵抗的決心也是很強。
無論他們抵抗的決心多強，也比不上太平軍要在這裡立足的決心，一支沒有回頭路的戰爭機器遇到抵抗注定是要靠殺戮開道。
李世賢在灣區殺了三天，可以說是血流成河，幾乎殺了所有抵抗的白人男性，隻放過了一些女性和從屬的印第安人仆役。
阮文海沒有參與灣區之戰，隻是近距離觀察，隻要太平軍海上沒有遇到對手，他就不會下場，畢竟這是屬於太平軍的戰爭。
三天之後，舊金山灣區所有城鎮基本被戰爭機器犁了一遍，從夏威夷和阿拉斯加開始運送家屬到灣區打掃戰場，維修房屋，接手金礦。
黃呈忠上岸開始帶領陸軍南下，陳炳文則率艦隊南下，進攻洛杉磯和拉斯維加斯一帶，構築南方防線。
李世賢則居中開始調度，對占領區開始調度和經營。首先是安置家屬，然後是會見各印第安部落首領討論領地問題。
此時，北線已經進入深秋，庫頁島也不可能再向阿拉斯加移民，黃呈忠南下的時候，留下了1萬士兵和5000家屬，還有三艘軍艦，糧食也留了足夠渡過冬天的數量。
但南線依舊開始跨洋運送人口和士兵，大量的土地需要人耕種，漫長的防線需要士兵守衛。
還有蒸汽機等機器要運送到灣區，首當其衝的就是建設造船廠和軍工廠，蒸汽炮艦無法渡過廣袤的太平洋，必須重新修造。
科羅拉多河、薩克拉門托河、聖華金河這些河流都需要蒸汽炮艇來巡弋，而且在灣區之戰中，一艘蒸汽機艦船因為擱淺也受到了損傷需要修複。
李秀成性格比較果斷，早就決定將帶不過去的蒸汽炮艦以後還給“豐南號”，已經跟不上時代的風帆戰列艦全部改為商船。所以主力就是發展蒸汽機艦船，所以，在工業上的第一步就是建設造船廠。
灣區有美國人的造船廠，有一些底子，因陋就簡，都是可以用的。
後麵運送士兵和家屬的船隊中已經分批安排礦產勘探人員和各類工匠，這些人都是在“豐南號”精心培養出來的，是未來太平軍開拓事業的重要人才。
兩個月後，太平軍餘部基本將加利福利亞和內華達州的土地收入囊中，運送到北美的士兵已經高達20萬，隨遷的家屬和百姓也有25萬。
這期間，這裡的白人不是在反抗中被殺，就是聞風而逃，備受欺辱的印第安人也趁機反殺。
已經快到過年了，阮文海將要回台灣，東海艦隊將留下5艘鋼鐵艦在夏威夷作為太平軍海上的後援，帶著2艘鋼鐵艦和5艘貨船回台灣。
李世賢帶著幾名太平軍將領送彆阮文海，將殺戮中繳獲的大量金銀交給阮文海帶回，算作還一筆欠的“豐南號”債務。
同時，需要“豐南號”支持的彈藥數量和蒸汽機數量也通過電報機發給了李秀成。
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