於匡說：“馮帥，隴軍新勝，士氣正高，此時和他們正麵作戰，會不會不是時機？”
馮異說：“所謂驕兵必敗，正是要利用他們輕敵的想法，才能大敗他們。如若不然他們固守城寨，咱們一時半刻也難以有所突破。”
分道揚鑣後，馮異帶領十九萬大軍繞行安定，盧芳得知馮異大軍入境，嚇得龜縮城中，馮異繞安定一周後，向西南入隴。
盧芳看著城下漢軍，少說二三十萬，嚇得腿都軟了，正準備向匈奴求援，哪知漢軍並未攻城，竟絕塵而去。
盧芳見漢軍勢大，放棄了漁翁得利的打算。
鄧曄、於匡二人率領十一萬漢軍星夜兼程，於深夜突然對涇源發起攻擊今寧夏回族自治區固原市境內）。
涇源隴軍倉猝應戰，激戰至淩晨，終究不敵，被漢軍奪下了城池。
行巡得知涇源失守，也全速進軍，至正午時分，趕到涇源城下。
由於漢軍深夜攻城，隴軍並不知道漢軍到底有多少人馬，看到城上漢軍並不多，以為漢軍沒有多少兵馬，於是下令攻城。
事情的發展和行巡想的差不多，漢軍的守衛的確薄弱，沒多久，隴軍便攻破了西門。
行巡指揮大軍入城，城內的漢軍見到隴軍入城，並未潰退，而是且戰且退，和隴軍爭奪著每一個製高點。
待到隴軍全部入城後，城中埋伏的漢軍傾巢而出，從四麵八方圍殺隴軍。
起初行巡還不在意，以為是漢軍小股部隊的反擊，可隨著越來越多的戰報傳回來，行巡才終於反應過來，中了漢軍的詭計，於是下令全軍突圍。
可漢軍已將涇源東西兩座城門圍的水泄不通，又哪裡能讓行巡如此輕易的突圍？
一個時辰之後，鄧曄覺得差不多了，令漢軍稍微鬆了鬆口子。
行巡抓住機會，率領殘部殺出西門，沒有殺出來的，都做了漢軍的俘虜。
來時的三萬部隊，此時也隻剩了不到一萬。
剛出虎穴，又入龍潭。
於匡率領大軍就埋伏在隴軍西逃的必經之路的山穀之中，待到隴軍一到，漢軍頃刻殺出。
剛從城中逃出來的隴軍驚魂還未定，又遭伏擊，哪裡還有軍心？尤是行巡已經竭儘全力的組織，仍然無法避免隴軍潰逃的結局。
得虧親兵奮力護衛，行巡才得以殺出重圍，隻可惜三萬大軍卻隻帶回去了不足一千。
馮異軍得勝的同時，祭遵也繞到了王元屯駐的山路的後方，前後都被漢軍堵上，三日後王元軍糧斷，不得已向西突圍。馬武、蓋延看準時機，從後掩殺，王元大敗，三萬隴軍也隻突圍了半數。
漢軍兩路開花，隴地震動，加之馬援的遊說，一些原本依靠隗囂的豪強紛紛倒戈投靠漢軍，其中包含隗囂的上將軍高峻、任禹。
竇融也因為漢軍打穿了隴西北部地區今甘肅省東南部地區），得以重新遣使正式歸降劉秀。
隗囂看漢軍勢如破竹，征調歸附於他的羌族、義渠兩部前來共同禦敵。
羌族大軍剛出動，就被竇融偷了老家，羌兵連忙回救，卻被竇融殺的大敗而逃。此戰竇融斬首羌兵數千，繳獲牛羊十萬隻，糧食四十萬石，羌族從此一蹶不振。
義渠的部隊還未到指定彙合地點，便遭到了馮異部的迎頭痛擊，義渠將領少卿陣前反水，配合馮異部擊殺義渠首領賈覽，並斬首數千級，至此義渠也歸順了大漢。
延岑的三十萬大軍也被吳漢連勝三陣所擊潰，延岑隻得退守漢中今陝西省漢中市境內）。
此時開戰不到半年，隗囂便已捉襟見肘，隨時都有滅國的危險。漢軍連戰連捷，先後擊潰王元、行巡、義渠、羌族，南邊攻打漢軍的延岑也被吳漢擊退。再加上馬援又在後院點火，招降了隗囂數員上將，那些沒有被招降的將軍們也不如之前那般戰意高漲。
於是隗囂決定采用緩兵之計，向劉秀謝罪，獻上乞降書：
陛下，我下麵的將軍們看到您的天兵到來，驚恐萬分，所以自發的和您的大軍交戰，這並不是我的本意，都怪我沒能好好的約束部下。
如今我已斥責了他們，並都一一施行了軍法。
但是他們都是我的手下，我自知罪責難逃，如何發落我全憑陛下一句話，陛下要殺便殺，要罰便罰，我絕無怨言。
此時太傅卓茂已經病重無法入宮麵聖，於是將劉秀請入府中。
劉秀坐在床邊，看著憔悴的卓茂心疼的說：“太傅，幾日不見，怎麼老成這樣？”
卓茂欲起身行禮，劉秀連忙將他按住說：“太傅不必多禮，你且躺下。”
卓茂說：“那就容老臣失禮了，陛下，之前老臣建議的削減官吏雖然已經見效，但是如今國家連年征戰，國庫已然空虛。如今攻伐隗囂和公孫述，勢必比以往任何一仗都要困難，國家的錢已經很難堅持了，由於連年征戰，很多縣的人口已經少了許多了，官吏體製還是過於冗雜，臣建議再次縮減官吏體製。隻是臣的身子已經不行了，不能再為陛下分憂了，具體的方案臣已經擬好了，陛下看看如果沒有問題，就按照這麼執行吧。”
卓茂說這句話的時候，好像用儘了全身的力氣，話音一落便出去多，進氣少，沒多久便一口氣沒上來，撒手人寰。
卓茂，東漢初年著名的大儒，精通《詩經》、《禮記》及算術，博學多才，號稱“通儒”。劉秀稱帝後，卓茂出山輔佐劉秀，被劉秀尊為老師，他提出一係列治國大策，對文臣匱乏的東漢初年起到了至關重要的作用。他提倡並主導的精簡官吏體製，是我國有記錄的最早的一次對政府部門的優化，對經濟、農業尚未恢複到正常水平的東漢初期起到了決定性的幫助，讓劉秀能夠有源源不斷的資金支持來統一全國。
對於卓茂的去世，劉秀深感惋惜，命太常以國禮葬之。
隨後劉秀按照卓茂生前的建議，將全國範圍內的郡縣合並，全國一千六百個縣，縮減為一千二百個縣，地方官吏精簡為原有的約十分之一。
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