德川幕府的十幾萬討逆軍除被俘虜的五萬餘人，其餘均被擊斃。高級將領、各藩藩主全被處死，無一幸免。
因為，明朝不需要這些垃圾。
五月二十日，明軍不費吹灰之力，攻占五島列島，五島藩滅。
六月初一，明軍徹底占據肥前。
長崎城，原奉行府。
重新被修繕一新的奉行府如今成為了征東大將軍戚金的臨時營地。
政務廳內，座無虛席，包括孫傳庭、秦良玉、潭弘業以及各師師長。與此之外，還有一個十幾歲的小娃娃，天草時貞也出現在了廳內。
此時的天草軍已經發展到了十萬人，成為了一股不小的勢力。
之所以時貞出現在這裡，那便是朱由校的聖旨被送到了此處。讓戚金頭疼不已，不知該如何處理天草軍的大事，已然有了結果。
聖旨上，朱由校先是肯定了各支隊伍的戰績，同時又表達了自己的不滿。
原來，對於數萬明軍精銳，二十多天才堪堪拿下肥前，殺敵十萬，俘虜五萬，自身卻付出了兩千的傷亡，朱由校是非常不滿意的。
更彆提，兩千傷亡中，由日本平民造成的傷亡便占了三成。
如果朱由校能親臨此處，此時應該是指著戚金的腦袋，破口大罵了。
拜托大哥！咱們不是來郊遊的，咱們是侵略軍好不好？仗打的如此文明，給誰看？朝中文官？
那些讀書人壓根不會因為明軍文明行為而交手稱讚好吧。
不到一個月，朱由校就已經動了換帥的念頭。隻不過臨陣換將乃兵家大忌，而且，他還是希望戚金能學學戚繼光，對倭寇毫不手軟的作風的。
不過，活罪能免，稍稍提點幾句還是需要的，於是朱由校便有了下麵的安排。
第一，宣告日本全境，天草時貞真實的身份。其乃太閣豐臣秀吉之親孫、右大臣豐臣秀賴的遺腹子，本名為羽柴秀綱，此時其真實歲數為十八歲，而非十二歲。
第二，正式收編天草軍，並改編其為日本第一集團軍脅從軍），下轄五個軍，十個師。隨後，集團軍中高級將領均被替換成了那五百野人軍的士兵。
第三，正式發布德川家倒行逆施的執政理念，比如，閉關鎖國政策，輕慢日本天皇等等。
第四，向日本全國發布公告，介紹明軍之所以踏上日本國土，蓋因是受到了羽柴秀綱的邀請，是以打倒德川幕府，以及解救日本底層百姓於水火的目的而來，是一支代表光明的隊伍。
對於自己又當又立，作為始作俑者，朱由校對自己的行為自然是嗤之以鼻的。
但沒辦法，既然在古代，那就要按照古代的玩法去玩，師出有名方為上策，也是減少明軍傷亡的良策。
七月，整編完成的日本第一集團軍便跨上了征服九州島的征程。
七月五日，在明軍的配合下，十萬脅從軍攻破了佐賀藩的鹿島城。
七月十日，脅從軍一鼓作氣拿下了佐賀藩的佐賀城，處死了剛就任沒多久的第二代藩主鍋島忠直，佐賀藩被滅。