劇烈震動的地下空間裡，暗物質如潮水般翻湧，在首領權杖的操控下化作猙獰巨獸，張牙舞爪地撲向星羽三人。星羽將三種力量注入時序齒輪殘片後，杖身光芒大盛，她大喝一聲，金色的齒輪虛影如風車般飛旋而出，與暗物質巨獸正麵相撞。齒輪虛影切割著暗物質，卻在觸及巨獸核心時被強大的反震力彈回。
“小心！這些暗物質凝聚體裡有時間枷鎖！”林淵的機械義眼快速掃描，發現暗物質巨獸的動作雖遲緩，但其每一次攻擊都能讓周圍的時間流速產生變化。他立即啟動熵核的時間校準功能，在三人周身形成時間防護罩，抵消了部分時間扭曲的影響。
聖女的調和之杖深深插入地麵，以杖為中心，聖潔的淨化光環向四周擴散。被淨化之光觸及的暗物質，紛紛發出刺耳的嘶鳴，化作虛無。然而，首領卻發出一陣狂笑：“淨化之力？在暗星教團的終極計劃麵前，不過是蚍蜉撼樹！”隨著他的話語，能量核心上方的時序齒輪殘片突然迸發暗紫色光芒，與維序齒輪虛影產生更加強烈的共鳴。
整個地下空間的牆壁開始扭曲變形，顯現出一幅幅詭異的畫麵：宇宙中無數星球被暗物質吞噬，暗星教團的旗幟在破碎的星係中飄揚，而在畫麵深處，一個巨大的、布滿齒輪紋路的黑色球體緩緩轉動。“那是......”星羽瞳孔驟縮，她在平衡齒輪的記憶中見過類似的場景，那是宇宙誕生初期的混沌狀態。
林淵的機械手臂突然發出警報：“能量核心的功率正在突破臨界值！如果繼續這樣下去，整個星域都會被暗物質吞噬！”他一邊說，一邊快速拆解著身邊的機械裝置，試圖組裝出能夠乾擾能量核心的設備。
就在這時，首領猛地扯下麵具，露出一張布滿暗物質紋路的臉。他的雙眼空洞無神，卻散發著令人心悸的威壓：“你們以為我是暗星教團的首領？太天真了！我不過是被選中的容器，真正的主宰，即將蘇醒！”話音未落，他的身體開始膨脹，暗物質能量瘋狂湧入，化作一個高達百米的暗物質巨人，與曾經的暗物質巨人極為相似，卻又更加恐怖。
星羽感受到永恒齒輪杖的震動愈發強烈，杖身上的三種紋路已經完全融合，形成一個全新的、閃爍著三色光芒的齒輪圖案。她心中一動，嘗試與時序齒輪殘片建立更深層次的共鳴。刹那間，一股龐大的記憶湧入她的腦海：在遠古的齒輪戰爭中，五大齒輪並非簡單破碎，而是被一股神秘力量封印，這股力量來自宇宙誕生前的混沌，企圖將宇宙重新拉回無序的黑暗。
“原來暗星教團背後是混沌之力！”星羽大喊著分享這一發現。聖女聞言，立即將全部淨化之力彙聚於調和之杖，杖頭綻放出九道金色光柱，直刺暗物質巨人。林淵則將組裝好的乾擾器投向能量核心，同時啟動星艦的最大功率引力場，試圖將暗物質巨人牽製住。
暗物質巨人揮舞著巨大的手臂，輕易拍碎了聖女的光柱，又一拳轟向林淵的乾擾器。千鈞一發之際，星羽將永恒齒輪杖插入地麵，調動平衡齒輪的力量，在乾擾器周圍形成一個能量屏障。乾擾器成功命中能量核心，引發一陣劇烈的爆炸。
然而，這並未對暗物質巨人造成實質性傷害。巨人張開血盆大口，一道暗物質激光射向三人。危急時刻，時序齒輪殘片突然脫離能量核心，懸浮在星羽麵前。殘片散發出的金色光芒與永恒齒輪杖的三色光芒相互呼應，形成一個巨大的時間旋渦。
星羽集中精神，引導著時間旋渦迎向暗物質激光。兩種強大的力量碰撞在一起，爆發出的能量將整個地下空間撕裂。在劇烈的能量風暴中，星羽、林淵和聖女被衝散。星羽在混亂中抓住時序齒輪殘片，她的意識再次被拉入神秘空間。
在這裡，她看到了創世齒輪、湮滅齒輪、平衡齒輪、時序齒輪和維度齒輪的完整形態，五大齒輪圍繞著一個發光的原點旋轉，維持著宇宙的平衡。而混沌之力正試圖打破這個平衡，將宇宙重新拖入黑暗。“我們必須讓五大齒輪重新共振！”星羽在心中呐喊。
當她從神秘空間回歸現實時，發現自己身處一片陌生的星域。林淵和聖女就在不遠處，他們同樣握著各自的武器，眼神堅定。三人對視一眼，無需言語，便開始調動各自的力量。星羽手中的時序齒輪殘片、林淵身上蘊含的熵核之力、聖女杖中的淨化之力，與永恒齒輪杖的力量相互融合。
在他們的努力下，虛空中漸漸浮現出五大齒輪的虛影。儘管還不完整，但齒輪的力量已經開始共振。暗物質巨人感受到這股力量，發出憤怒的咆哮，它不顧一切地衝向齒輪虛影，試圖阻止共振的完成。
星羽三人咬緊牙關，全力維持著齒輪的共振。隨著共振的加強，暗物質巨人的身體開始出現裂痕，暗物質能量不斷外泄。而能量核心處，維度齒輪虛影也開始逐漸實體化，與其他齒輪產生共鳴。
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