仙武學院的演武場危機解除後，王丹與淩辰等人意識到，聖域殘餘勢力如同附骨之疽，若不徹底剿滅，終將成為心腹大患。學院長老會經過商議，決定賦予他們“肅清特使”的身份，允許他們調動學院半數資源，在一年內徹底清除仙武大陸上的聖域餘孽。這一年，成了仙武學院眾人從“賽場強者”蛻變為“大陸守護者”的關鍵曆程。
剿滅行動的第一站，是位於大陸西部的“黑風要塞”——這裡曾是蘭青琳的秘密據點，如今被聖域殘餘的“蝕魂衛”占據，衛隊長是化神初期的邪修林煞，手中握著蘭青琳遺留的“蝕魂魔鏡”，能操控數萬怨靈發動攻擊。
當王丹一行人抵達要塞時，隻見要塞上空籠罩著黑紫色的怨靈霧，無數平民被囚禁在要塞內，生命力正被怨靈霧緩慢吞噬。“不能等，必須速戰速決！”淩辰率先發動攻擊，九元龍血槍泛著金色光芒，“丹械合一?神械滅世”的槍芒刺破怨靈霧，在要塞牆壁上轟出一道缺口。
王丹則召出天啟神將?無雙與天罰者，兩具機甲同時發動技能：“天啟領域”展開，金色光芒淨化著周圍的怨靈；“天道裁決”的光柱直衝要塞核心，擊碎了蝕魂魔鏡的防禦屏障。“項羽英魂，出戰！”項羽手持翡翠龍紋槍，霸王槍芒橫掃，將衝來的蝕魂衛儘數擊潰。
白靈兒、墨泉、銀星嵐也同時發力：白靈兒的“符陣?萬符歸一”引爆，金色符籙光雨驅散怨靈；墨泉的墨眉劍融入滅神陣，玄鐵鎖鏈纏住林煞的四肢；銀星嵐操控三具機魂軍神將，曙光神將的淨化光焰灼燒怨靈，海靈神將的水龍彈衝擊要塞防禦，鬼毒神將的毒霧則封住蝕魂衛的退路。
林煞見狀，瘋狂催動蝕魂魔鏡，數萬怨靈凝聚成一頭“怨靈魔神”，朝著眾人撲來。“祖龍血脈，完全爆發！”王丹體內金色龍氣暴漲，祖龍虛影環繞周身，“龍皇十絕?第六式?龍隕滅世！”黑色龍形能量體帶著祖龍威壓，與怨靈魔神碰撞，金色龍威瞬間淨化了半數怨靈。“三大法器?渾天寂滅！”天星、龍晶、天羅珠融合成一道三色光柱，徹底擊潰怨靈魔神，林煞也被光柱擊中，化作黑紫色能量消散。
接下來的半年裡，王丹等人輾轉大陸各地，先後肅清了“毒瘴沼澤”的毒係餘孽、“雷霆峽穀”的異化獸群、“幽冥窟”的邪修據點。每一場戰鬥，他們的配合都越發默契：淩辰的三大神位之力逐漸融合，能同時操控丹火、機甲與陣法；白靈兒的符籙術與靈犀的輔助能力結合，能繪製出“靈犀符陣”，大幅提升團隊戰力；墨泉的墨眉劍解鎖了“墨家禁術?天地同寂”，可短暫封印對手靈力；銀星嵐的機魂軍神將則新增了“機魂合體”能力，三具機甲能融合成一具“混元神將”，戰力堪比化神中期。
當最後一處聖域餘孽據點“血色祭壇”被摧毀時，仙武大陸的天空終於恢複了往日的清澈，而王丹等人的修為，也在無數場戰鬥中積累到了突破的臨界點。
肅清行動結束後，王丹等人返回仙武學院，進入學院深處的“悟道閣”閉關修煉。悟道閣內靈氣濃鬱，還蘊含著上古傳承的能量，是突破境界的絕佳之地。
王丹獨自坐在悟道閣頂層，身前懸浮著觀星局的傳承令牌——這是他在血色祭壇深處發現的，令牌上刻著“觀星局主司”的字樣。他將祖龍血脈與輪回者機甲的能量注入令牌，令牌瞬間綻放出金色光芒，一道浩瀚的信息流湧入他的腦海：“觀星局，星魂軍直屬機構，負責監察大陸安危，主司擁有調動全局勢力的權限，配備十二台‘星辰戰鎧’……”
隨著信息流的融入，王丹的周圍浮現出十二道金色光團，光團逐漸凝實，化作十二台通體銀白、刻有星辰符文的戰鎧。每一台戰鎧都有專屬能力：“重坦戰鎧”擅長防禦，“星雲戰鎧”可操控星辰之力，“黎明戰鎧”能加速靈力恢複……這正是專屬於觀星局主將的“十二星辰戰鎧”。王丹意念一動，一台“龍皇戰鎧”自動穿戴在他身上，戰鎧與祖龍血脈、機甲完美共鳴，他的氣息瞬間暴漲，丹田內的元嬰逐漸破碎、重組，最終形成一道金色的元神——他成功突破到化神境初期！
與此同時，悟道閣中層的淩辰也迎來了突破。他體內的“丹武神”“械神”“陣禦神”三大神位種子同時發光，丹爐、機甲核心、陣法符文環繞在他周身。突然，丹武神的種子爆發出耀眼的金色光芒，一道古老的傳承虛影浮現——這是丹武神的完整傳承，包含“丹道本源”“丹火滅世”“丹魂不滅”三大奧義。淩辰沉浸在傳承中，體內的靈力瘋狂運轉，元神逐漸被金色丹火包裹，最終突破到化神境中期，丹武神的傳承也徹底覺醒，他能僅憑意念煉製出“神階丹藥”，丹火還能淨化一切邪祟能量。
白靈兒則在靈犀的輔助下，將符籙術與自然之力融合，突破到化神境初期，她繪製的“自然符陣”能操控草木生長，形成防禦屏障或攻擊藤蔓，靈犀也同步突破到化神初期，能釋放“靈犀淨化”，驅散一切負麵狀態。
墨泉的墨眉劍在悟道閣的能量加持下，徹底覺醒了墨子的傳承，他突破到化神境初期，解鎖了“墨家終極陣法?諸天星鬥陣”，可借星辰之力形成絕對防禦，墨眉劍也能化作“墨龍”，發動“墨龍滅世”的強力攻擊。
銀星嵐則在魯班秘盒的指引下，領悟了“機關本源”，突破到化神境初期，她的機魂軍神將新增了“自主靈智”，能獨立判斷戰場局勢，十二神將的設計圖紙也在她的腦海中浮現，距離完成全部機魂軍神將僅差一步。
當一年的時光結束，王丹等人走出悟道閣時，整個仙武學院都被他們身上的氣息震撼——五人皆是化神境初期修為，周身環繞著不同的傳承光芒，王丹的十二星辰戰鎧、淩辰的丹武神火、白靈兒的自然符光、墨泉的墨家陣法、銀星嵐的機關靈光，相互交織，形成一道耀眼的光幕。
學院長老會的長老們紛紛上前，眼中滿是欣慰：“你們不僅肅清了聖域餘孽，還突破到化神境，仙武學院的未來，就交給你們了！”
王丹握著白靈兒的手，望著身邊的夥伴們，眼中滿是堅定：“我們的目標，不僅是守護仙武學院，更是守護整個仙武大陸。未來，無論遇到什麼挑戰，我們都會並肩作戰！”
話音落下，天空中突然降下金色的霞光，霞光中浮現出觀星局與星魂軍的虛影——這是大陸意誌對他們的認可，也是新的使命的召喚。他們知道，屬於他們的傳奇，才剛剛開啟新的篇章，而未來的征程，將比以往更加波瀾壯闊。