米花町的冬日清晨總是帶著幾分慵懶，陽光透過薄霧灑在街道上，給積著殘雪的屋頂鍍上一層暖金色。小蘭剛把洗好的衣服晾在陽台，就看到便利店門口貼著一張醒目的廣告——“新佛尼號豪華遊輪免費海豚旅行招募”，廣告上印著碧藍的大海和躍出水麵的海豚，下方還標注著“全程免費，含三餐住宿”的字樣。
“免費海豚旅行？”小蘭眼睛一亮，立刻取下廣告紙跑回屋裡。柯南正坐在沙發上看偵探小說，毛利小五郎則捧著報紙打哈欠，小蘭把廣告紙放在兩人麵前：“爸爸，柯南，你們看！新佛尼號的免費海豚旅行，我們去報名吧！”
毛利小五郎湊過來看了一眼，立刻坐直身子：“免費？豪華遊輪？還有三餐住宿？這好事怎麼會輪到我們？不會是騙局吧？”柯南也放下書，仔細看了看廣告：“上麵寫著需要填寫申請表，抽中就能參加，看起來不像假的。而且新佛尼號是知名的豪華遊輪，應該靠譜。”
小蘭興奮地說：“我再問問夜一和灰原，要是她們也去，我們正好湊一隊！”她拿出新手機，先給工藤夜一打了電話。夜一剛整理完上周的案件記錄，聽到免費遊輪旅行，立刻答應：“好啊！最近正好沒什麼案子，去海上放鬆一下也好。”隨後小蘭又打給灰原，灰原猶豫了一下，想起阿笠博士說最近解藥研究需要調整節奏，便點頭同意：“我也去，順便看看海上的環境，或許對研究有幫助。”
第二天，小蘭帶著柯南、毛利小五郎去旅行社提交申請表，沒想到運氣出奇地好，五個人全被抽中了。一周後，眾人提著簡單的行李來到東京港，新佛尼號豪華遊輪就停在碼頭，白色的船身在陽光下閃閃發光，像一頭蟄伏在海麵的巨鯨。
“哇！好大好漂亮！”小蘭忍不住感歎，拿出手機拍照。夜一穿著黑色風衣，手裡拿著筆記本，正在記錄遊輪的外觀細節：“新佛尼號全長180米，排水量2萬噸，有五層甲板，頂層是觀景台，底層是機房和儲物間。”灰原則站在一旁，看著海麵，手裡的保溫杯冒著熱氣。
毛利小五郎已經迫不及待地往船上走：“快走快走！我聽說遊輪上的自助餐特彆豐盛，還有高級威士忌！”柯南無奈地搖搖頭，跟在後麵。剛踏上甲板，就看到一個穿著深藍色西裝、頭發花白的老人站在入口處，手裡拿著一個舊相冊，眼神嚴肅地看著來往的乘客。
“那位是……”柯南覺得老人有些眼熟，夜一湊過來小聲說：“是前搜查一課的鮫崎島治警視，二十年前退休的，據說他當年破過很多大案，尤其是銀行搶劫案。”正說著，鮫崎島治似乎察覺到他們的目光，轉過頭看了過來，目光在柯南和夜一身上停留了幾秒，又移開了。
登船後，船員給每個人發了房卡，小蘭和灰原住一間海景房，柯南和毛利小五郎住隔壁，夜一則單獨住一間。放好行李後，眾人來到二樓的餐廳吃午飯，餐廳裡已經坐了不少乘客，小蘭很快注意到幾個眼熟的人——一個穿著花襯衫、身材微胖的男人，一個戴著眼鏡、看起來很斯文的中年男人，還有一個穿著紅色連衣裙的女人，以及一個留著絡腮胡、神情嚴肅的男人。
“那些人也是參加免費旅行的嗎？”小蘭小聲問。夜一拿出筆記本，快速記錄：“穿花襯衫的是龜田照吉，做水產生意的；戴眼鏡的是海老名稔，自由職業者；穿紅裙子的是磯貝渚，服裝店老板；留絡腮胡的是鯨井定雄，開運輸公司的。他們都是這次抽中的乘客，而且……”夜一頓了頓，壓低聲音，“他們都和二十年前的‘葉才三團夥4億元銀行搶劫案’有關。”
柯南心裡一緊：“葉才三團夥？就是那個搶了銀行後分贓不均，主謀被同夥殺害的案子？”夜一點點頭：“沒錯，當年葉才三帶著四個同夥搶了4億元現金，後來據說被同夥殺死，贓款至今沒找到。鮫崎警視的女兒，當年就是在搶劫案現場被流彈擊中身亡的，他退休後一直沒放棄追查凶手。”
就在這時，餐廳門口傳來一陣熟悉的聲音：“柯南！小蘭姐姐！夜一！”眾人回頭，隻見服部平次提著行李箱走進來，身後還跟著一個船員。服部快步走過來，笑著說：“沒想到你們也來了！我收到一封署名‘古川大’的信，說有關於二十年前搶劫案的線索，讓我來新佛尼號，沒想到一來就看到你們。”
“古川大？”柯南皺了皺眉，“這個名字沒聽過，會不會是陷阱？”服部聳聳肩：“不知道，但既然有線索，我肯定要來看看。對了，我剛才在甲板上看到鮫崎警視了，他也在船上，看來這次旅行不簡單。”
午飯快結束時，船員突然走到餐廳中央，拿著一個名單說：“各位乘客，請問有沒有一位叫‘葉才三’的先生？您的行李已經送到房間，但一直沒看到您登船。”
“葉才三？”餐廳裡瞬間安靜下來，鮫崎島治猛地站起來，快步走到船員麵前：“你說誰？葉才三？他還活著？”船員被鮫崎的反應嚇了一跳，連忙說：“名單上確實有這個名字，是這次抽中的乘客之一，但我們沒看到他登船，房間也是空的。”
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龜田照吉臉色發白，手裡的筷子掉在地上：“不可能……葉才三二十年前就死了，怎麼會來參加旅行？”蟹江是久推了推眼鏡，聲音發顫：“難道是……是他的鬼魂？”鯨井定雄皺著眉，沒說話，隻是端起酒杯喝了一口酒。
小蘭拉了拉柯南的衣角，小聲說：“柯南，葉才三是誰啊？他們怎麼這麼害怕？”柯南小聲解釋：“葉才三是二十年前銀行搶劫案的主謀，據說被同夥殺了，現在突然出現他的名字，大家肯定會害怕。”
鮫崎島治盯著船員手裡的名單，眼神銳利：“帶我去葉才三的房間！”眾人也跟著站起來，紛紛表示要一起去。船員沒辦法，隻好帶著眾人來到三樓的306房間，打開房門，裡麵果然空無一人，隻有一個黑色的行李箱放在床邊。
鮫崎島治打開行李箱，裡麵隻有幾件換洗衣物和一本舊日記，日記的封麵已經泛黃，第一頁寫著“葉才三”三個字。他快速翻了幾頁，裡麵記錄的都是二十年前搶劫案的細節，還有對同夥的怨恨。“這日記是真的……”鮫崎的手微微發抖，“葉才三可能真的沒死，他這次來，是為了複仇。”
服部平次湊過去看了看日記：“不對，這日記的字跡雖然模仿了葉才三的風格，但墨水是新的，應該是最近才寫的。有人故意用葉才三的名字，把我們騙到船上。”柯南點點頭：“而且剛才船員說葉才三是抽中的乘客，說明‘古川大’和這次旅行的主辦方有關，他故意把當年的同夥和鮫崎警視都引來，肯定有目的。”
接下來的幾個小時，眾人各懷心事。小蘭和灰原在甲板上散步，看著遠處的大海，小蘭擔心地說：“灰原，你說會不會真的有危險？”灰原搖搖頭：“彆擔心，有柯南、服部和夜一在，不會有事的。而且，我總覺得那個鯨井定雄有點奇怪，他剛才聽到葉才三的名字時，反應太冷靜了，不像其他人那麼害怕。”
柯南和服部則在船上四處調查，他們發現船上的船員大多是臨時招聘的，對“古川大”和葉才三的事一無所知。夜一則去找鮫崎島治，了解當年搶劫案的更多細節。鮫崎拿出女兒的照片，聲音低沉：“我女兒當年才15歲，去銀行給我送便當，正好遇到搶劫，被流彈擊中……我一定要找到凶手，為她報仇。”
時間慢慢過去，很快到了午夜0點。餐廳裡的時鐘敲響，鮫崎島治看著時鐘，歎了口氣：“二十年了……搶劫案的追訴時效已經過了，我再也不能用法律製裁他們了。”他收起女兒的照片，轉身準備回房間。
就在這時，上層甲板突然傳來一聲“砰”的巨響，像是槍聲。眾人立刻跑上去，隻見甲板中央的旗子被燒著了，冒著黑煙，旗子下麵放著一個黑色的箱子，箱子上用刀插著一張一萬元的紙鈔。
“是槍聲！還有火光！”毛利小五郎大喊，“難道是葉才三來了？”服部平次立刻檢查周圍：“沒有彈殼，也沒有子彈孔，這聲音可能不是槍聲。”柯南蹲下身，看著箱子上的紙鈔：“這張紙鈔是舊的，上麵有磨損的痕跡，而且箱子上的刀，是餐廳裡的水果刀。”
夜一拿出手電筒，照向海麵：“剛才聽到聲音時，我看到船尾有火光，可能有人在那裡。”眾人立刻往船尾跑，剛跑到船尾，就聽到“轟隆”一聲爆炸，船尾的儲物間冒出大火。船員們趕緊拿來滅火器，好不容易才把火撲滅，這時大家發現，儲物間裡有一具被燒焦的屍體，已經看不清樣貌，隻能通過衣服判斷是個男人。
“死人了！”磯貝渚尖叫起來，躲到一旁。鮫崎島治皺著眉，戴上手套檢查屍體：“屍體已經燒得麵目全非，但手裡攥著一個金屬牌，上麵寫著‘蟹江’。”蟹江是久聽到自己的名字，嚇得腿軟：“不……不是我！我還活著！那不是我！”
柯南和服部對視一眼，開始各自調查。柯南蹲在屍體旁，注意到屍體的手指關節有老繭，像是經常搬運東西的人；服部則在儲物間外發現了一個香煙盒，裡麵有一根沒抽完的香煙，煙頭上有口紅的痕跡。
“我覺得凶手是磯貝渚。”服部平次找到柯南，小聲說，“煙頭上有口紅，船上隻有她用口紅，而且她當年是葉才三的情人，可能因為分贓不均殺了人。”柯南搖搖頭：“不對，屍體手指上的老繭，磯貝渚作為服裝店老板，不可能有這麼厚的老繭。而且，爆炸是用香煙引發的，磯貝渚不抽煙，怎麼會用香煙設置陷阱？”
兩人各執一詞，爭論起來。夜一則在船尾的欄杆上發現了一個腳印，腳印的尺碼很大，應該是男人的，而且腳印上有海水的痕跡，說明凶手可能從海上過來，或者去過海邊。
服部平次不服氣，決定自己去找證據。他想起剛才在葉才三的房間裡看到的日記，覺得裡麵肯定有線索，便悄悄來到306房間。房間裡還是和之前一樣，空無一人，服部翻了翻日記，突然發現最後一頁夾著一張紙條，上麵寫著“機房有贓款”。
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“贓款？”服部眼睛一亮，立刻往機房跑。機房裡很暗，隻有應急燈亮著，服部剛走進來，就聽到身後有腳步聲。他轉身，看到一個黑影拿著鐵棍朝他打來，服部來不及躲閃，被打暈在地。黑影扛起服部，準備往船尾的大海裡扔，就在這時，一個聲音傳來：“站住！”
黑影回頭，看到工藤夜一站在機房門口，手裡拿著手電筒，眼神銳利。“你是誰？”黑影問道，聲音沙啞。夜一笑了笑：“工藤夜一，偵探。你以為把他扔去海裡，就能毀屍滅跡嗎？”
黑影立刻朝夜一撲過來，手裡的鐵棍揮向夜一的頭部。夜一側身躲開，同時伸出右腿，絆倒黑影。黑影摔倒在地，鐵棍掉在地上，夜一趁機上前，按住黑影的肩膀，另一隻手抓住他的手腕，兩招就把黑影製服了。