洪武二十年4084年）五月初一庚戌日），撤銷四川成都府的保寧縣，將其地域歸屬威州。
癸醜這一天），朝廷）設置龍山千戶所。
庚申日，皇帝）派遣使者攜帶敕書諭告西平侯沐英、吉安侯陸仲亨、平涼侯費聚、南安侯俞通源、四川都指揮使寧正、楚雄衛指揮袁義、大理衛指揮鄭祥、品甸衛指揮賴鎮、金齒衛指揮李觀、儲傑等人說：“最近禦史李原名從平緬回來，朕聽他陳述的內容，知曉了百夷狡詐的詳情，他們）即使說千言萬語，也沒有一句是可信的。由此看來，蠻夷反而想要窺探中原，成為我們的邊患。兵符一到，就可以立即修繕營壘。金齒、楚雄、品甸以及瀾滄江中部的道路沿途）必須建造高大的城牆和很深的護城河，加固軍營的柵欄，多多設置火銃用來防守戒備。如果有賊寇來犯，不要輕易和他們交戰，要觀察時機再行動。往年雲南軍中派人前來，百夷大多貪圖財物，不審察事情形勢的輕重，虛張聲勢，恃勇逞強，被各蠻部所譏笑。又因為靖江王沒有才能，用大理寺的印章頒布命令，這些都不符合常理，導致他輕慢朝廷，給朝廷帶來了麻煩。從今往後，不許再派人前往平緬，隻需靜靜等待。他們如果有公文送來，就大致回複一下，否則就不要回複。應該有他們）按規定進貢的物品，我們）都不能索取。像這樣過了幾年之後，那麼麓川那個地方就可以歸入國家的版圖了。你們一定要堅守朕的旨意，不要懈怠。”
甲子日，皇上曉諭戶部左侍郎楊靖說：‘京城軍隊儲備的征收已經確定，那在京城之外的各司、府、州、縣的糧食儲備，有軍隊衛所的地方，應該留存兩年的糧食），沒有軍隊衛所的就留存辦學用糧和官府供給的糧食），其餘的都折算成鈔幣、布帛、絹匹征收）。你們再重新考慮考慮吧。’
楊靖說：“如今四川的糧食儲備，每年的供給都不夠，雲南尤其嚴重，應該命令商人繳納糧食，而用官鹽來補償他們。如果北平、山東的糧食，用來救濟漠北、遼東的糧食匱乏，那麼山西、陝西的邊地，應該多儲備糧食，也很難限製年數，都應該全部收儲。隻有河南、浙江、江西、湖廣、福建、廣東、廣西以及直隸的府、州、縣可以都儲存兩年的糧食，其餘的都在折收的範圍內。”皇帝聽從了他的建議。
又擔心有關部門加重征收賦稅，損害百姓利益，特意命令一石米隻折合一貫鈔，布和絹都按照往年的規定征收。
丙寅日，派使者帶著敕令去告誡大將軍、宋國公馮勝等人說：“此前在慶州打了勝仗，俘虜被送到京城後，都說北元皇帝已經向北逃去，從遼東送來的投降者，所說的情況也相同。五月五日，收到軍中派來投降的胡人帶來的消息又說：納哈出放棄了金山的巢穴，在新泰州紮營，距離遼陽一千八百裡。朕估計那些胡人雖然在營北起兵遠行，看起來好像是遠遠地逃走了，但還是擔心他們暗中施展詭詐的計謀，尤其不能不對此有所防備。何況如今水火星相犯，到了八月，天象屢次發出警告，各位將領應當嚴格號令，整頓軍隊，讓士兵遠出偵察，以逸待勞，就一定會有能抵禦敵人的將領。”
丁卯日，皇上駕臨華蓋殿，侍從大臣進呈講讀經典等內容），於是談論起人的善惡與所受的報應，也有不符合常理的情況。皇上說：“作惡有時會免於災禍，但道理上沒有什麼惡事是可以做的；行善有時沒有得到福澤，但道理上沒有什麼善事是不可以做的。”人隻需要修養自身的品德，禍福的降臨，就聽從上天的安排。那些做了善事卻沒有得到福氣，做了惡事卻沒有遭受禍患的人，隻是因為時間還沒有到罷了。
戊辰日，皇陵祠祭署令汪文去世。汪文世家住在濠梁，與皇上是同鄉，他家境富裕而且注重禮儀，從小就和皇上關係很好。皇上即位後，提拔汪文為文皇陵祠祭署令，使他不用離開自己的家鄉，就能親身享有平安榮耀的尊貴地位）。等到他去世，皇上親自撰寫祭文，派遣內侍和儀曹官前往吊唁祭祀，贈送助喪的財物非常豐厚。
庚午日，大將軍、宋國公馮勝留下五萬士兵鎮守大寧，率領大軍奔赴金山。
辛未日，皇上又派遣使者秘密告誡大將軍、宋國公馮勝等人說：“前些日子因為天象發生變化，告誡你們等人）有關軍中的事務，要嚴密地做好防備。現在看所征伐的對象，其過錯在於敵人，從人事上揣度，正好與天意相合，應該乘機進軍攻取，不可拖延。我估計納哈出逃到金山還沒有多遠，用兵去追趕他，從形勢上看他必定會來投降。況且胡人首領認為我們達到目的後，沒有心思窮追不舍，他們）必定會順著水草，在黑山、魚海之間往來活動），趁他們猶豫不前時，攻打他們沒有防備之處），胡人的部眾就可以全部謀取了。”
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壬申日，朝廷派遣禮部主事高惟善帶著詔書去招撫長河西、魚通、寧遠等地。
癸酉日。皇上告諭兵部大臣說：“士兵每月的糧食有一石，僅夠維持生活，士兵去世以後，朝廷就不再發放糧食，有些士兵的父母年老無人依靠，有些士兵的兒女年幼無人撫養，他們將如何生存呢？處於困厄之中而不去體恤是不仁愛，有功勞而不報答是不道義。士兵們都曾經為國家效力，怎麼可以忘記他們呢！你們兵部要全麵檢查軍隊各衛所，凡是士兵死亡，有父母年老、兒女幼小沒有依靠的，都要從優供給他們），不要讓他們）流離失所。”
甲戌日，儀禮司官員、蠻子鎮撫張允恭把他護送的乃剌吾送到大將軍馮勝的營地，馮勝又派人把乃剌吾送到納哈出的營地。
丙子日，朝廷征召山西朔州衛指揮孫彥入京擔任後軍都督僉事，任命鷹揚衛指揮僉事孫傑代理朔州衛事務。
安南陳煒派他的臣子杜日墩進貢檳榔、波羅蜜、香蕉，皇帝賞賜杜日墩鈔錠。
丁醜日，日、月、星三辰在白晝出現
戊寅這一天，皇上臨朝聽政，對刑部尚書唐鐸等人說：‘近來有關部門的官員）觸犯法律的，朕）想要完全按照法律來懲治他們，人們卻說朝廷用刑太重，如果）不懲治他們）就會使他們）無所忌憚。古人說：‘書寫文字）是用來記錄標識）的呀，是想要與生命一起長存呀。’朕常常想到這件事，想要讓犯錯的人都記錄過錯後恢複原職，希望他們能夠改過自新。’鐸等人回答說：‘聖上的心懷如此寬厚仁愛，臣下怎敢不儘心來謀求報答聖上的恩德）呢？’於是下令將所有犯輕罪的人全部赦免，被判服勞役、流放以及各種當判死罪的犯人，都讓他們帶著罪名恢複原來的職位。如果有官員兩次三次地犯錯，也會將他的罪行記錄下來，再恢複他的官職。
六月己卯日初一，沂州衛的軍官和士兵抓獲本地盜賊七十多人，給他們戴上刑具押送到京城，皇帝下令誅殺其中的首惡分子，其餘的人都被流放到金齒去戍邊。
廣西潯州府知府沈信說：‘潯州府與柳州、象州、梧州、藤州等州接壤，山溪地勢險峻，瑤族人的賊寇經常出沒。最近，廣西布政使司的參議湯敬恭被大享老鼠、羅碌山的生瑤未歸化的瑤族人）所殺害，官軍前去討伐他們生瑤），賊寇生瑤）於是登上懸崖峭壁，攀緣樹木，敏捷得像猿猴一樣，官軍）追趕不上。如果長期駐紮軍隊，那麼瘴氣疫病會時常發作，軍隊中會有很多人生病，這樣就很難再進攻了，等到軍隊撤退，敵人就會再次出來作亂。臣下我愚昧地認為，掛平、平南這兩個縣過去歸附的瑤民，都擅長使用弓弩，習慣於經曆艱難險阻。如果挑選其中一千多年輕力壯的人，免除他們的徭役賦稅，供給他們兵器和衣服裝備，使他們各自聚集在村落山寨，設置烽火台），和巡檢司的民兵互相聲援，協同追捕盜匪之類），就可以殲滅他們）。’
皇上說：“蠻夷違抗教化，他們向來如此。假使守衛疆土的官員能夠招撫他們，哪裡用得著殺戮呢？如果沒有事情發生，隻應當謹慎地進行防禦，使他們不成為禍患罷了。如果他們不斷騷擾，百姓無法忍受，就發兵征討，何必建立村寨。”
壬午日，提升保寧衛鎮撫呂旺為千戶。在此之前，呂旺說他的部下士兵征戰戍守很辛苦，千戶穀興卻不能體恤，還迫害他們。皇帝下詔書逮捕法辦穀興。到這時，右軍斷事官判定穀興的罪應當處以杖刑，皇上命令將他貶謫戍守大寧。因為呂旺能夠了解士兵的艱苦，說話沒有隱瞞實情），君主）特意提升他，來表彰他的正直。
四川雅州、碉門茶馬司用十六萬三千六百斤茶葉換取了一百七十多匹駱駝、馬和騾駒。
甲申日，留守衛的士兵搬運官磚，與漁人乘坐的船隻相撞而溺死。官員拘捕了這個捕魚的人，要懲處他的罪過。皇上說：“兩條船相碰，是士兵不謹慎，導致溺水死亡，難道是漁夫故意謀害他們嗎？”命令釋放他。
把廣西都指揮使耿良降職為馴象衛指揮僉事。當初，耿良在任上有很多不法行為，軍士薛原、桂向朝廷告發，不久鎮撫張原又列舉了他二十多條不法行為。皇上命令錦衣衛查訪審問，得到了實情，因此貶黜了他。
詔令凡是被謫罰發配到遼東戍守的官吏百姓，各自按時從事耕種和講習武事，不得再上書議論申訴是非，違反的人要治罪。
乙酉日，惠州博羅縣的山賊發動叛亂，殺死巡檢官員，焚毀官府，攻打惠州城。廣東都指揮使司調派軍隊討伐他們，抓獲首要賊人應仲華等十一人，押送到京城，將他們誅殺，其餘的黨羽全部被平定。
丁亥日，廢除寧波府的昌國縣，將那裡的百姓遷徙，讓他們成為寧波衛的士兵，因為昌國縣靠近大海的百姓曾經跟隨倭寇做海盜，所以要遷徙他們。
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己醜日，遼東一渡河故元將領高八思帖木兒、洪伯顏帖木兒等人率領他們的部落前來歸降。皇帝下詔選擇其中有才能的人，授予百戶之職，其餘的人擔任總旗、小旗，賜予他們冠帶、衣服和糧食，以安撫他們。
壬辰日，皇帝的第二十五個孫子濟煥出生，他是晉王的第五個兒子。
癸巳日，兵部主事王暹擔任兵部代理右侍郎，監察禦史李原名擔任禮部代理尚書。
乙未日，皇帝下詔免除直隸應天府、浙江、嘉興、江西、九江等府州今年的馬草。
丁酉日。大將軍、宋國公馮勝等人到達遼河以東，抓獲納哈出的三百多個屯卒，四十多匹馬，於是進軍駐紮在金山的西邊。這時，乃剌吾回到鬆花河，見到了納哈出。納哈出非常吃驚地說：‘我以為你死了，沒想到今天還能再見到你。’
拉著他的手，殷切地慰勞問候。於是剌吾趁機向納哈出說明了朝廷送還他妻子兒女的原因，納哈出非常高興，立即派遣他的左丞劉探馬赤、參政張德裕跟隨使者張允恭等人到勝軍獻馬，想要借此窺探我軍。馮勝派人把他送到京城。
不久，納哈出把乃剌吾送到漠北，元主想要殺了他，左右大臣勸諫說：‘乃剌吾被俘虜很久了，現在能夠活著回來，為什麼要殺了他呢？’因此得以幸免。又回到納哈出那裡，把朝廷撫恤的恩德全部告訴了他的部眾，因此很多蒙古人都有了投降的意願。
袁州府宜春縣百姓李某，妄稱彌勒佛的毛發、九十九等紙號，於是聚集眾人謀劃發動叛亂。戍卒楊寅向袁州衛告發了這件事，袁州衛派兵將他們逮捕並斬首，還繳獲了偽造的木印、龍鳳袍、日月袍、黃綠羅掌扇、令旗、劍戟等物品，一共一百多件。
戊戌日，命令京城衛所的武官年老患病或有傷殘，且沒有子孫承襲職位的人，全部給予俸祿優厚對待。太白星白天出現在天空。
己亥日。派遣使者帶著皇帝的詔書告知金齒衛指揮儲傑、嚴武、李觀等人說：‘金齒遠在邊境，當地百姓不遵守法律禮儀，倚仗險要地勢堅守，人人各自保全自己，不是中原地區的百姓能比得上的。凡是戍守邊疆或重要地方）的將領，如果不是向來德高望重，就不足以鎮守那個地方和安撫那裡的百姓。你的指揮使李觀，處理事情寬容厚道，名聲在蠻地傳播，被各個少數民族喜愛。然而他下麵的指揮、千百戶、鎮撫等人，大多倚仗功勞放縱肆意行事），違背了軍紀。所以我特意命令你和儲傑、嚴武輔助他。這是因為用李觀的寬容來安撫遠方的人，一定要用儲傑、嚴武的嚴厲來治理群臣。詔書下達後，你就率領指揮、千百戶、鎮撫所統率的舊軍，嚴加訓練，讓他們各自堅守領地，觀察平緬的動靜。膽敢有肆意頑抗、不遵守軍法的人，就給其治罪。’
庚子日，派遣通政使司經曆楊大用前往雲南訓練軍隊。當時百夷多次成為邊境的禍患，皇帝想要發兵平定，之前已經下令讓西平侯沐英、指揮儲傑等人籌劃邊境事務，到了這時又派楊大用到雲南練兵。楊大用到了沅江等府，當地的土官請求率領五萬士兵聽從調遣。
臨江侯陳鏞跟隨軍隊征討納哈出，死在了軍中。陳鏞，是臨江侯陳德的兒子，年少時以功臣之子的身份練習武藝。九年，陳鏞被任命為散騎舍人。十四年，陳鏞繼承了父親的爵位。十七年，朝廷）任命他）為右副將軍，與申國公鄧鎮、濟寧侯顧時一起討伐龍泉山的賊寇。
不久，他和宋國公馮勝一起在汴梁練兵。十九年，駐兵通州，巡視邊境，俘獲番將王脫顏。這一年，藍玉和靖海侯吳禎一起修建會州城，然後跟隨馮勝向北進發。即將到達金山的時候，朱鏞所率領的部隊與大將軍的部隊走散了，朱鏞陷入了敵人的包圍，戰死了。這件事傳到皇帝那裡，皇帝非常惋惜，命令用米和布賜給他的家人。
癸卯日，大將軍、宋國公馮勝等人率領軍隊越過金山，到達女直苦屯，納哈出的部將全國公觀童前來投降。
甲辰日，遷移福建海洋中孤山、斷嶼上的居民到沿海的新城，官府分給他們田地讓他們耕種。這是聽從了左參議王鈍的請求。
丁未日，大將軍、宋國公馮勝在金山東北駐軍，派遣右副將軍藍玉前往納哈出的營地，使納哈出的部眾歸降。
當初，納哈出把軍隊分成三個營，一個叫榆林深處，一個叫養鵝莊，一個叫龍安一禿河，物資充足，牲畜繁殖眾多。
北虜的首領多次招降他，他都沒有前往。
到了這個時候，大軍逼近納哈出，納哈出無計可施，乃剌吾就勸他投降，納哈出猶豫不決。
恰好大將軍馮勝派遣指揮馬某前去曉諭他，納哈出於是派遣使者到大將軍營中，表麵上作出歸降的樣子，而實際上是窺視兵勢。
藍玉於是被馮勝派往一禿河接受投降的敵人，藍玉）讓投降的使者拜見大將軍馮勝，之後藍玉）回來向納哈出報告。
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納哈出聽說以後，指著天嘖嘖歎息說：‘上天不再給我這些人了！’
於是率領幾百名騎兵親自到藍玉那裡約定投降。
藍玉非常高興，拿出酒來和他一起喝，非常歡樂融洽。
納哈出於是斟酒酬謝藍玉，藍玉請他先喝，納哈出就喝完了，又斟酒遞給藍玉，藍玉脫下衣服給納哈出穿上，對他說：請穿上這件衣服然後再喝酒。
納哈出不肯屈服，藍玉也拿著酒不喝，爭執推讓了很久，納哈出拿過他藍玉）的酒澆在地上，回頭看著他的部下惡狠狠地說著話，想要脫身離去。