太康十年公元289年）
夏天四月，太廟建成。乙巳日，舉行合祭大典，並大赦天下。
慕容廆派人前來請求歸降。五月，晉武帝下詔書封慕容廆為鮮卑都督。慕容廆去拜見何龕，起初他穿著士大夫的服飾，戴著頭巾，以文人的裝扮登門。但何龕卻全副武裝、大張旗鼓地接見他，見狀，慕容廆就換成了軍裝進去。有人問他為什麼換衣服，慕容廆說：“主人不以禮相待，客人又何必講究禮節呢！”何龕聽說後，十分慚愧，也對慕容廆越發敬重和刮目相看。當時，鮮卑的宇文氏和段氏勢力正強盛，多次侵犯掠奪慕容廆的地盤，慕容廆隻能用謙卑的言辭和豐厚的財物來討好他們。段國單於段階把女兒嫁給了慕容廆，婚後生下了慕容皝、慕容仁、慕容昭。慕容廆覺得遼東地方偏遠，就把部落遷到了徒河的青山。
冬天十月，恢複了明堂祭祀以及南郊祭祀五帝的禮儀。
十一月丙辰日，尚書令、濟北成侯荀勖去世。荀勖很有才華和心思，特彆擅長揣摩皇帝的心意，所以一直深受皇帝寵信。他長期在中書省任職，專門掌管機密要事。等到被調任尚書令時，心裡非常失落。有人來祝賀他升官，荀勖說：“奪走了我的中書省，你們有什麼好祝賀的！”
晉武帝沉迷於酒色，最終把身體搞垮生病了。楊駿忌憚汝南王司馬亮，想把他排擠走。甲申日，晉武帝任命司馬亮為侍中、大司馬，授予假黃鉞，讓他擔任大都督，都督豫州諸軍事，鎮守許昌；把南陽王司馬柬改封為秦王，都督關中諸軍事；始平王司馬瑋改封為楚王，都督荊州諸軍事；濮陽王司馬允改封為淮南王，都督揚州、江州諸軍事，並且都授予假節，讓他們前往各自的封國。又封皇子司馬乂為長沙王，司馬穎為成都王，司馬晏為吳王，司馬熾為豫章王，司馬演為代王，皇孫司馬遹為廣陵王。還封淮南王的兒子司馬迪為漢王，楚王的兒子司馬儀為毗陵王，把扶風王司馬暢改封為順陽王，司馬暢的弟弟司馬歆為新野公。司馬暢是楊駿的兒子。琅邪王司馬覲的弟弟司馬澹為東武公，司馬繇為東安公。司馬覲是司馬伷的兒子。
當初，晉武帝把才人謝玖賜給太子，謝玖生下了皇孫司馬遹。有一次宮中夜裡失火，晉武帝登上高樓查看火情，當時司馬遹才五歲，他拉著晉武帝的衣角，把他拽到暗處說：“夜裡情況緊急，應該防備意外，不能讓火光暴露皇上的位置。”晉武帝從此覺得這個皇孫很不一般。晉武帝還曾在群臣麵前誇讚司馬遹像晉宣帝司馬懿，所以天下人都對司馬遹寄予厚望。晉武帝知道太子司馬衷才能平庸，但因為有聰明的皇孫司馬遹，所以一直沒有廢太子的想法。他又采用王佑的計謀，讓太子同父同母的弟弟司馬柬、司馬瑋、司馬允分彆鎮守重要地區。又擔心楊家勢力太強大，就任命王佑為北軍中候，掌管禁軍。晉武帝還為皇孫司馬遹精心挑選屬官，因為散騎常侍劉寔誌向品行高潔，就任命他為廣陵王傅。
劉寔看到當時社會風氣不好，人們都熱衷於追名逐利，很少有廉潔謙讓的品德，就寫了一篇《崇讓論》。他主張新任命的官員呈遞謝章時，必須推舉賢能之人，這樣謝章才能通過。一個官職空缺了，就選擇大家推舉最多的人來擔任。他認為：“人要是爭強好勝，就會詆毀比自己強的人；要是懂得謙讓，就會爭著推薦比自己優秀的人。所以大家都爭的時候，誰優誰劣很難分清；大家都謙讓的時候，賢能的人就自然凸顯出來了。這個時候，要是能退身修養自己，謙讓你的人就會很多，想一直過貧賤日子都難。但要是一門心思往上爬，還想彆人把機會讓給你，就好比倒退著走路卻想向前一樣。”
淮南相劉頌給晉武帝上書說：“陛下因為過去法令寬鬆，這種情況由來已久，所以不能一下子就嚴格執法約束下麵的人，這確實符合當下的情況。但要想矯正不良風氣、挽救社會弊病，還是得慢慢讓社會風氣變得清正起來。這就好比行船，雖然不能直接橫衝直撞地逆著急流行駛，但也得一點點地朝著目標前進，這樣才能到達彼岸。從泰始年間到現在，快三十年了，各項事業都不如從前興盛。以陛下的聖明，都還沒能扭轉末世的弊病，恢複開國初期的繁榮，要是傳給後代，能不讓人擔憂嗎？將來國家要是出了問題，責任還是在陛下身上。我覺得，為國家長遠考慮，不如分封皇室宗親、賢能之人。但要仔細斟酌形勢，讓那些遵守道義的諸侯，有足夠的力量拱衛京城；要是有包藏禍心的，他們的勢力又不足以獨自作亂。想要達到這種平衡很難，陛下應該和通曉古今的有識之士好好商量。周朝的諸侯，要是犯了罪，隻是懲罰他本人，封國還能繼續存在；漢朝的諸侯，要是犯了罪或者沒有子嗣，封國就會被廢除。現在應該改變漢朝的弊端，遵循周朝的舊製，這樣下麵的封國穩固，朝廷也就安穩了。天下這麼大，事情這麼多，而皇帝隻有一個，就像天上的太陽一樣。所以聖明的君主治理天下，自己掌握關鍵，把具體事務交給下麵的人去辦，這不是因為害怕勞累、貪圖安逸，實在是治理國家就應該這樣。在事情剛開始的時候，很難判斷一個人的才能；但根據事情的成敗來區分功勞和罪過，就很容易分辨了。現在陛下往往在事情開頭的時候很用心，但卻不注重最終的結果，這就是政務不能達到完美的原因。陛下要是能掌握關鍵，在事情成敗之後再考核功勞罪過，那麼下麵的人就無法逃避賞罰了。古時候六卿各有職責，塚宰是他們的首領；秦漢以來，九卿負責具體事務，丞相總攬全局。現在尚書決斷事務，各卿隻是奉命執行，和古代製度相比，尚書的權力太重了。可以把很多事務交給各部門，讓他們有自主處理的權力；尚書隻負責統領大事，就像丞相那樣，到了年底考核功績，根據記錄進行賞罰，這樣就可以了。現在凡事都要聽從上麵的命令，上麵決策失誤，又不能怪罪下麵的人，到了年底要是事情沒辦好，都不知道該追究誰的責任。小的過錯和失誤，是人之常情，要是都依法追究，那朝廷和民間就沒有能立足的人了。近年來，擔任監察的官員，大多是不抓大事，專挑小毛病。這是因為他們害怕豪強，又擔心自己失職，就用細密的法網去搜羅小過錯，使得彈劾的奏章一個接一個，表麵上看起來很公正，實際上卻破壞了法律。所以聖明的君主不喜歡處理瑣碎細密的案件，而是要求官員舉報真正的大奸大惡，這樣危害政治的壞人自然就會被抓住。開創基業的功勳，在於確立教化、製定製度，讓遺留下來的風氣凝聚人心，讓前人的功績庇護年幼弱小的後人。這樣，後代就算遇到昏庸的君主，國家也能保持清明；就算君主比較愚笨，國家也能正常運轉，這才值得推崇。至於修繕官府等各種工程，常常過於奢華，這些事不用擔心做不起來，將來就算陛下不做，後人也能自己完成。現在在這些不必要的事情上花費精力，卻損害了國家的根本，我覺得這是不對的。”但晉武帝對這些建議都沒有采納。
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晉武帝下詔書任命劉淵為匈奴北部都尉。劉淵不看重錢財，喜歡施舍，真誠地對待他人，匈奴五部的豪傑以及幽州、冀州的有名文人，很多都來投奔他。
奚軻部落男女十萬人前來歸降。
永熙元年公元290年）
春天正月初一辛酉日），改年號為太熙。
己巳日，任命王渾為司徒。
司空、侍中、尚書令衛瓘的兒子衛宣，娶了繁昌公主。衛宣愛喝酒，經常犯錯。楊駿討厭衛瓘，想把他排擠走，就和黃門官合謀詆毀衛宣，還勸說晉武帝讓公主和衛宣離婚。衛瓘又慚愧又害怕，就上書告老還鄉，辭去官職。晉武帝下詔書，晉升衛瓘為太保，讓他以公爵的身份回家養老。
劇陽康子魏舒去世。
三月甲子日，任命右光祿大夫石鑒為司空。
晉武帝病情越來越重，還沒來得及留下遺詔，朝廷裡的老臣大多已經去世了。當時隻有侍中、車騎將軍楊駿在皇宮裡伺候晉武帝。其他大臣都不能靠近皇帝身邊，楊駿就趁機按照自己的想法調換了皇帝身邊的重要官員，安插自己的心腹。有一次晉武帝病情稍有好轉，看到新換的官員，就嚴肅地對楊駿說：“怎麼能這樣做！”當時汝南王司馬亮還沒出發去許昌，晉武帝就讓中書省起草詔書，打算讓司馬亮和楊駿一起輔佐朝政，還想挑選幾個在朝廷裡有聲望的大臣一起幫忙。楊駿從中書省借走詔書看了之後，就趁機藏了起來。中書監華弇很害怕，親自去要，楊駿就是不給。這時晉武帝又陷入昏迷。皇後上奏說讓楊駿輔佐朝政，晉武帝點頭同意了。夏天四月辛醜日，皇後把華弇和中書令何劭召來，口述晉武帝的旨意，起草詔書，任命楊駿為太尉、太子太傅、都督中外諸軍事、侍中、錄尚書事。詔書起草好後，皇後拿給華弇、何劭，又一起呈給晉武帝看，晉武帝看了之後，什麼也沒說。華弇是華歆的孫子，何劭是何曾的兒子。隨後，朝廷就催促汝南王司馬亮趕緊去許昌赴任。過了一會兒，晉武帝又清醒了些，問：“汝南王來了沒有？”身邊的人說還沒到。之後，晉武帝病情急劇惡化，己酉日，在含章殿去世。晉武帝氣量宏大寬厚，聰明通達又善於謀略，能夠接納大臣們的直言進諫，從來沒有對人發過脾氣。
晉武帝去世後，太子順利登基做了皇帝，隨後下令大赦天下，還更改了年號。他尊稱父親的皇後為皇太後，又冊封自己的妃子賈氏為皇後。
楊駿趁著新帝即位，住進了太極殿。晉武帝的靈柩即將入殮時，後宮嬪妃們都出來辭彆，可楊駿卻賴在殿中不走，還安排了一百名武士保護自己。
朝廷下詔，讓石鑒和中護軍張劭負責監督建造晉武帝的陵墓。
汝南王司馬亮害怕楊駿，都不敢進宮參加晉武帝的喪禮，隻能在大司馬門外痛哭。之後，他跑到城外紮營，還上奏請求等晉武帝下葬後就前往自己的封地許昌。有人向楊駿告密，說司馬亮打算起兵討伐他。楊駿嚇得不輕，趕緊告訴太後，讓皇帝親自下詔書給石鑒和張劭，命令他們率領修建皇陵的士兵去攻打司馬亮。張劭是楊駿的外甥，接到命令後，馬上帶著自己的部下，催促石鑒趕緊出兵。但石鑒覺得事情不對勁，一直拖著沒行動。司馬亮沒辦法，隻好向廷尉何勖請教對策，何勖說：“現在朝廷上下、民間百姓都支持您，您不主動去討伐彆人，反而害怕彆人來討伐您嗎？”可司馬亮還是膽小，不敢發兵，連夜逃往許昌，這才躲過一劫。楊駿的弟弟楊濟和外甥河南尹李斌都勸楊駿把司馬亮留下來，楊駿不聽。楊濟對尚書左丞傅鹹說：“我哥哥要是把大司馬召回來，自己再主動退讓，我們楊家或許還能保全。”傅鹹卻認為：“皇室宗親與外戚，本就該相互依靠才能安穩。隻要把大司馬召回來，大家秉持公正一起輔佐朝政，根本不用避讓。”楊濟又讓侍中石崇去勸楊駿，楊駿依舊我行我素。
五月辛未日，晉武帝被安葬在峻陽陵。
楊駿心裡清楚，自己平時沒什麼好名聲，就想效仿魏明帝即位時的做法，給大家普遍加封爵位，以此來討好眾人。左軍將軍傅祗提議，讓所有大臣都晉升一級，參與喪事辦理的人晉升兩級；俸祿兩千石以上的官員都封為關中侯，還免除他們一年的田租賦稅。散騎常侍石崇和散騎侍郎何攀一起上書反對，他們說：“太子在東宮做了二十多年儲君，如今繼承皇位，這時候行賞封爵，賞賜力度竟然比當初晉朝建立以及將領們平定東吳時還要優厚，實在不合情理。況且大晉國運長久，現在製定的製度是要流傳後世的，如果以後有爵位就晉升，那幾代人之後，大家不都成公侯了！”但楊駿根本不聽。
朝廷又下詔書，任命太尉楊駿為太傅、大都督，授予假黃鉞，讓他處理朝廷政務，百官都要聽從他的指揮。傅鹹勸楊駿說：“皇帝居喪期間不理政事的製度，已經很久沒人遵守了。現在皇上謙虛，把政事托付給您，可天下人並不認可，我擔心您很難承擔這份重任。周公那麼聖明，還遭人非議，更何況現在皇上年紀可比當年的成王大，情況不一樣啊！我覺得皇陵修建完成後，您應該好好考慮是繼續掌權還是退隱，隻要能表明您的忠誠，不用多說什麼大家也能明白！”可楊駿根本聽不進去。傅鹹多次進諫，楊駿漸漸對他不滿，甚至想把他外放到地方當郡守。李斌勸阻說：“趕走正直的人，會失去人心的。”楊駿這才作罷。楊濟給傅鹹寫信說：“俗話說‘生個傻兒子，才能遠離官場是非’，官場的事兒可不好處理。我怕你想破腦袋也想不明白，所以特意寫信提醒你。”傅鹹回信說：“衛瓘曾說‘沉迷酒色殺人，比正直處世更厲害’。因酒色而死，人們不會後悔，可有些人卻害怕因正直招來災禍，這是因為他們內心不堅定，想靠敷衍了事來假裝明智。自古以來，因正直招來災禍的，要麼是矯枉過正，要麼是不夠忠誠，想用激烈的言行博取名聲，所以才招人怨恨。哪有真心實意、一心為國卻被人怨恨的道理！”
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楊駿深知賈後性格凶狠、詭計多端，心裡十分忌憚她。於是，他安排自己的外甥段廣擔任散騎常侍，負責掌管朝廷機密；又讓張劭擔任中護軍，統領禁軍。此後，隻要有詔書命令，都得先由皇帝看過，再呈給太後，最後才能執行。
楊駿處理政務時，既嚴厲苛刻又獨斷專行，朝廷內外很多人都討厭他。馮翊太守孫楚勸他說：“您作為外戚，身負伊尹、霍光那樣輔佐朝政的重任，應該秉持公正，待人誠信，為人謙遜。可現在皇室宗親勢力強大，您卻不和他們共同處理國事，對內猜忌，對外任用親信，大禍很快就要臨頭了！”楊駿還是不聽。孫楚是孫資的孫子。
弘訓少府蒯欽是楊駿姑姑的兒子，他多次直言批評楊駿，旁人都替他捏把汗。蒯欽卻淡定地說：“楊文長楊駿字文長）雖然糊塗，但還知道不能隨便殺無罪之人，頂多疏遠我。我被疏遠了，反而能免禍，不然以後楊家出事，我也得跟著遭殃！”
楊駿征召匈奴東部的王彰擔任司馬，王彰卻直接拒絕，躲了起來。朋友新興人張宣子覺得奇怪，就問他原因。王彰說：“自古以來，一個家族出兩個皇後，沒有不滅亡的。更何況楊太傅親近小人，疏遠君子，獨斷專行，很快就要完蛋了。我就算漂洋過海、遠走塞外躲避，都怕被牽連，怎麼還能接受他的征召呢？而且晉武帝沒為國家長遠打算，繼位的太子根本挑不起大梁，接受遺命輔佐的人又不行，天下大亂馬上就要來了！”
秋天八月壬午日，朝廷立廣陵王司馬遹為皇太子，還任命中書監何劭為太子太師，衛尉裴楷為少師，吏部尚書王戎為太傅，前太常張華為少傅，衛將軍楊濟為太保，尚書和嶠為少保，又封太子的母親謝氏為淑媛。但賈後卻把謝氏安排在彆的地方居住，不讓她和太子見麵。當初，和嶠曾不慌不忙地對晉武帝說：“皇太子為人太過老實，可如今世道人心複雜，恐怕他難以處理好陛下的家事。”晉武帝聽了沒說話。後來，和嶠與荀勖等人一起侍奉晉武帝，晉武帝說：“太子最近上朝表現有進步，你們可以一起去看看他，順便和他聊聊國事。”回來後，荀勖等人都誇讚太子聰明有見識、氣度不凡，和皇上說的一樣。可和嶠卻說：“太子的本性還是和以前一樣。”晉武帝聽了很不高興，起身離開了。晉惠帝即位後，和嶠陪著太子司馬遹入朝，賈後讓晉惠帝問和嶠：“你以前說我處理不好家事，現在覺得怎麼樣？”和嶠回答：“我以前侍奉先帝時，確實說過這樣的話。要是我說的話沒應驗，那可是國家的福氣啊！”
冬天十月辛酉日，朝廷任命石鑒為太尉，隴西王司馬泰為司空，還封劉淵為建威將軍、匈奴五部大都督。
元康元年公元291年）
春天正月初一乙酉日），改年號為永平。
當初賈後做太子妃的時候，就因為嫉妒心強，親手殺了好幾個人。有一次，她甚至用戟擲向懷有身孕的妾室，導致胎兒隨刃落地。晉武帝得知後勃然大怒，命人修繕金墉城，打算廢掉賈妃。荀勖、馮紞、楊珧和充華趙粲一起為賈妃求情，說：“賈妃年輕，女人嫉妒很正常，等她長大了就好了。”楊皇後也說：“賈充對國家有大功，賈妃是他女兒，就算善妒，也不能忘了賈家的功勞啊！”賈妃這才沒被廢掉。楊皇後還多次告誡賈妃，可賈妃不知道楊皇後是在幫她，反而以為楊皇後在晉武帝麵前說她壞話，心裡更加記恨。晉惠帝即位後，賈後不願以兒媳的身份侍奉太後，還想乾預朝政，但都被太傅楊駿壓製。殿中中郎渤海人孟觀、李肇，平時就不受楊駿待見，於是他們暗中誣陷楊駿，說他圖謀不軌，危害國家。黃門官董猛，以前一直在東宮做事，擔任寺人監，賈後秘密派他和孟觀、李肇謀劃誅殺楊駿，廢掉太後。他們又讓李肇聯係汝南王司馬亮，讓他起兵討伐楊駿，司馬亮沒答應。李肇又去聯係都督荊州諸軍事的楚王司馬瑋，司馬瑋一聽就答應了，還請求入朝。楊駿平時就忌憚司馬瑋勇猛，一直想把他召到身邊又不敢，這次司馬瑋主動請求入朝，楊駿就同意了。二月癸酉日，司馬瑋和都督揚州諸軍事的淮南王司馬允一同入朝。
三月辛卯日，孟觀、李肇上奏晉惠帝，連夜偽造詔書，誣陷楊駿謀反，朝廷內外隨即宣布戒嚴。他們派使者拿著詔書，要把楊駿廢為侯爵，讓他回家待著。又命令東安公司馬繇率領四百名殿中士兵去討伐楊駿，楚王司馬瑋則在司馬門屯兵駐守，還任命淮南相劉頌為三公尚書，讓他帶兵守衛宮殿。段廣得知消息後，跪在晉惠帝麵前求情：“楊駿孤家寡人又沒有兒子，怎麼會謀反呢？希望陛下仔細調查！”晉惠帝卻沒有回應。
當時楊駿住在曹爽以前的府邸，位於武庫南邊。他聽說宮中有變，趕緊召集官員商議。太傅主簿朱振勸他：“如今宮內生亂，用意很明顯，定是宦官為賈後設謀陷害您。您該火燒雲龍門震懾對方，逼他們交出主謀；再打開萬春門，調集東宮和外營兵力保護皇太子入宮，清除奸人。宮中一旦恐慌，定會斬下叛賊首級送來。不然您難逃此劫！”楊駿向來怯懦，猶豫不決：“雲龍門是魏明帝所建，耗費巨大，怎麼能燒呢？”侍中傅祗請求和尚書武茂入宮查看情況，下階時對百官說：“宮中不能沒人主持！”眾人紛紛逃散，武茂卻坐著不動。傅祗回頭喝道：“您不是天子的臣子嗎？如今內外隔絕，不知皇上安危，怎能安坐？”武茂才慌忙起身。
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楊駿黨羽左軍將軍劉豫在門前陳兵，遇見右軍將軍裴顀，問太傅在哪。裴顀騙他：“剛才在西掖門見他乘素車，帶兩人向西走了。”劉豫問：“那我該去哪？”裴顀說：“去廷尉自首吧。”劉豫信以為真，棄軍而去。不久朝廷下詔讓裴顀代領左軍將軍，駐守萬春門。裴顀是裴秀之子。
皇太後把帛書綁在箭上射出城外，寫著“救太傅者有賞”。賈後趁機宣稱太後同謀。很快殿中士兵衝出，焚燒楊駿府第，又讓弩手在閣樓上向府中射箭，楊駿的兵無法出城。他逃到馬廄，被士兵搜出殺死。孟觀等人隨即逮捕楊駿弟弟楊珧、楊濟，以及張劭、李斌、段廣、劉豫、武茂、散騎常侍楊邈、中書令蔣俊、東夷校尉文鴦，全部夷滅三族，數千人被殺。
楊珧臨刑前對東安公司馬繇喊：“我當年的表章存在石函裡，可問張華！”眾人認為應像當年為鐘毓申理那樣為他辯護，司馬繇不聽。賈後黨羽催促行刑，楊珧號叫不止，被劊子手用刀劈開腦袋。司馬繇是諸葛誕外孫，因忌恨文鴦，誣陷他是楊駿黨羽將其誅殺。當晚生殺賞罰全由司馬繇決斷，權勢震動內外。王戎勸他：“大事過後，應遠離權勢。”他不聽。
三月壬辰日，朝廷大赦天下，改元元康。賈後偽造詔書，派後軍將軍荀悝將太後送往永寧宮囚禁，特赦太後之母高都君龐氏，允許她與太後同住。不久又暗示公卿百官上奏：“皇太後暗中參與奸謀，企圖危害社稷，用飛箭係書招募將士，與叛黨同惡相濟，自絕於天。魯侯斷絕與文薑的關係，《春秋》都讚許。陛下應奉祖宗之靈，以天下至公為念，雖有不舍之情，臣下不敢奉詔。”皇帝下詔：“此事重大，再詳議。”百官又奏：“應廢皇太後為峻陽庶人。”