命令頒布之初，軍中並非沒有阻力。一些老派頭領對繁瑣的軍階等級不以為然，認為不如“大哥”、“兄弟”稱呼來得親切；部分悍卒對嚴格的隊列操練和紀律約束感到不適；來自各方的兵卒混編，也難免產生摩擦。
王淩峰對此早有預料。他以身作則，率先佩戴上代表“聯邦元帥”的嶄新肩章，要求所有頭領必須遵守新軍製。他每日親臨校場，觀看操練，對表現優異者當場擢升賞賜，對違反軍紀者嚴懲不貸。一次，一名田虎部下的驍將因不服梁山籍教官管教，酒後鬨事，王淩峰得知後，不顧其戰功，當即下令重責軍棍五十，降職三等，並通報全軍。此舉極大震懾了全軍，樹立了新軍紀的權威。
同時，新製度的優越性也逐漸顯現。統一的號令和嚴整的陣型，使得部隊調動和戰術執行效率大增；軍銜製讓普通士卒看到了憑軍功晉升的希望，士氣高漲；後勤體係的完善，確保了將士們能吃飽和穿暖，裝備得到及時維護；軍校的建立，更讓那些有抱負的年輕人看到了成為職業軍官的光明前景。
數月之後，聯邦大校場上的景象已煥然一新。火器師的炮陣齊射，聲震四野，彈著點密集；騎兵師的集群衝鋒，蹄聲如雷，陣型變幻莫測；水師艦隊的編隊航行，帆檣如林，炮口森然。各兵種之間的協同演練也日益熟練。一種迥異於以往綠林山寨的、充滿紀律性和專業化的軍人氣質，開始在這支軍隊中孕育成型。
這一日，王淩峰與吳用並肩站在講武堂的山坡上，看著台下學員們刻苦演練戰術，隊列整齊，口號響亮。
吳用撚須感歎：“頭領，老夫編撰《聯邦軍略》，觀此新軍氣象，方知以往所謂謀略，多是權宜之計。如今這般，方是真正的王者之師根基啊！假以時日，此軍一成，天下何人能敵？”
王淩峰目光深遠，答道：“學究，強軍非僅為一戰。更是為了有朝一日，能滌蕩舊世汙濁，守護我等想要建立的新天。這講武堂中，將來走出的，不應隻是善戰之將，更應是明理、知義、心懷天下的棟梁之材。”
他深知，軍事改革的意義，遠超出戰爭本身。它是在重塑一個集團的靈魂，為那個“直指東京”的終極目標，鍛造最鋒利的劍，也為劍指之後的新世界，奠定最堅實的秩序基礎。
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