很快，原本由柳生十兵衛安排在各處的倭寇士兵都被毛利秀元重新安排。
防守僅留下其中的一支五萬人的倭寇部隊，這些人也在毛利秀元的命令下，被分成了每五百人一隊的小股人馬，他們被安排在了勝山城通往指月城的沿路山道路旁，另外毛利秀元命令其中一萬人負責炸毀通道，控製明軍的行程。
其餘八萬多人都被召集回來，連同指月城的十萬步兵一同負責地道的挖掘工作。
“還有我手下的一些忍者小隊，還有一些武士、劍士也可以埋伏在地道中，短距離的作戰中，這些武士的武藝還是有用的。特彆是我最近又招到了一批曾在伊賀派學習的忍者，他們也投靠了我，不過我還沒有接見。”柳生十兵衛道。
“伊賀派？”
德川家光聽到這個詞有些敏感道：“伊賀城不是肥前藩的主城麼？他們不是投靠明軍了麼？”
“不，將軍。”
柳生十兵衛一臉自信道：“忍者和普通人，甚至普通武士都不一樣，伊賀流、甲賀流、柳生家，望月家都是我們倭寇國最古老的忍術流派。這些忍者的必須要得到肉體和身心的雙重考驗，才能成功地選為忍者，不是明軍的一點點小利益就能收買的。”
聽到柳生十兵衛如此自信，德川家光也隻好同意道：“既然這樣，就由你自己決定。”
此時三位毛利家的將領也被招了回來，毛利元知看到一位中年人竟
然出現在了毛利秀元的上首位置，剛準備發作。
卻看見了毛利秀元的眼神，以及中年人身邊站著的柳生十兵衛，這才明白了中年人的身份。
恭敬地跪在地上道：“見過德川大將軍。”
“你起來吧。”
“謝大將軍。”
毛利元知接著問道：“我有一點疑問，我帶領的五萬人，原本在鬆嶽山潛伏得很好，為什麼要讓我們撤回來。而且那些登錄的明軍也很奇怪，他們已經到達了我們的埋伏點前，卻突然撤兵回到了勝山城。”
“哈哈，”
德川家光指向一旁的柳生十兵衛說道：“明軍撤兵自然是因為柳生十兵衛在小倉城的大勝，至於叫你回來，自然是因為改變了戰術。”
毛利元知剛準備繼續問下去，卻看到毛利秀元犀利的眼神後，放棄了追問的打算。
“毛利家主無需如此，我們同齡之人多交流幾句也是好事。”德川家光和藹地說道。
毛利元知也是明顯平時不受毛利秀元待見，此時聽見德川家光的話，也是趕緊高興地應和道：“是啊，父親，您總是這樣管束我，我怎麼才能進步。”
不過德川家光也隻是客套一番，他接著說道：“好了，你們幾人都清楚指月城的地勢，這些布置的任務就交給你們來辦。記住一點結硬寨，打呆仗，消耗明軍，這才是上策。”
“是大將軍。”
指月城前共有五公裡左右的丘陵平地，按照柳生十兵衛的計劃，縱
向每四十米布置一條戰壕，除去指月城前預留的一公裡距離，也就是一百條左右；橫向戰壕的寬度為五十米，間隔二十米布置，數量在十五到四十條不等；每處戰壕間布置兩隊十人的士兵，共計八萬餘人。
而剩餘的十萬人，一部分在指月城附近的水溝、窪地裡埋伏，等到明軍經過他們，他們再出現偷襲明軍。
另一部分由於武器匱乏，用作了後勤部隊，開始從益田、津和野、櫻尾等城征集糧草，提前為這場惡戰做好準備。
而德川家光也覺得指月城的位置太危險了，命令柳生十兵衛找來了一位形似他的倭寇士兵穿上了他的衣服駐守在了指月城，而德川家光本人卻秘密前往了高嶺城。
當然這些情況並不能讓這些幕府聯軍的士兵知道，每日這位偽裝的“德川家光”，都會露麵，告訴這些士兵，他本人就在他們的身後，一定不能退縮，守護好每一寸戰場。
為了防止明軍的大炮，對戰壕造成損失，柳生十兵衛又在毛利秀元的幫助下，指派士兵用布袋裝載泥土，在壕溝裡布置了防禦炮火的區域。