英、俄、德、日等國隨即采取行動，首先派駐京的部隊在通衢的大道上巡邏，又借口保護使館，把外地的部隊調入京城。完全證實了袁世凱的那句話“內訌外患，遞引互牽，若因凱一走，一切變端立見”。
北洋軍的大小頭目紛紛通電，臨時政府必須留在北京，袁大總統不能離開北京，向接袁世凱的南下專使示威。
梁士詒反複對蔡元培等人說“現在全國倡行革命，人心動蕩，北方的秩序很難維持。像目前的這種情形，如果不能及時的調度彈壓，確保地方安謐，就很容易引起外國對我國用兵的禍事，這一點是切實需要注意的。”
蔡元培眼見這一切，思想與來時本就有了很大的變化。加之汪精衛從中大力渲染，更使他認定袁世凱離開北京，北方肯定出大亂子。
就給南京參議院發電“北京兵變，外人極為激昂，日本已派多人入京。設使再有此等事變發生，外人自由行動恐不可免。培等睹此情況，集議以為速建統一政府，為今日最要問題，餘儘可遷就，以定大局。”以專使身份，要求參議院在袁世凱南下之事讓步。
袁世凱也在兵變後致電孫中山，請他通融。南方臨時政府信以為真，以為北京的局勢不知有多糟，黃興竟提出要帶兵北上，幫袁世凱彈壓兵變，並保護袁世凱。
袁世凱真怕黃興率兵北上，急忙回電“頃此事變，該兵匪等事後儘數潰走，絕無政治上意見。鄙人連日嚴飭軍警彈壓麵，撫恤被害商民??，現人心已定，秩序漸次恢複。……毋庸遠勞軍旅，請停止出發。”
袁世凱還因此而通告全國“專使到時，決意南下，組織聯合政府，統一南北，用慰國民之厚望。今遇此變，實行維艱，公等幸諒。且駐京外交圖案及吾國駐外各代表等，均雲方今欲鞏固民國，保全共和，舍速建設統一政府，彆無他法。想全國心理，均表同情，因茲事變，南行無期，組織政府，勢必從緩，凱實焦灼萬狀。”
緊接著，北京商民強烈要求，堅決反對遷都南京。有人到歡迎代表處請願，他們是真怕了這當兵沒人管束，更加幫了袁世凱的大忙。
袁世凱建議由副總統黎元洪赴南京代受職權，黎元洪複電不能前往。
為了做通南京方麵的工作，他還派出幾個人到南京，分頭去做疏通工作。親身感受到北京民眾的強烈呼聲，本來是專程來接袁世凱的專使蔡元培等人，現在反過來為袁世凱說話，反複做南京參議院和孫中山的工作。
孫中山感到在堅持下去未免理虧，也隻能同意袁世凱在北京受職。
三月六日，南京參議院通過了統一政府組織辦法六條的決議。
（一）由參議院電知袁世凱，允其在北京受職。
（二）袁世凱接電後，即電參議院宣誓。
（三）參議院接宣誓電後，即複電認為受職，並通告全國。
（四）袁世凱受職後，即將擬排國務總理及各國務員姓名電告參議院，求通過。
（五）國務總理及國務員任定後，即在南京接收交待事宜。
（六）孫中山於交代之日始行辭職。
三月七日，孫中山電告蔡元培轉告袁世凱，按參議院所開六條辦法，在北京正式受職。
一身輕鬆的袁世凱三月八日即電告參議院，完全承認所列六條辦法??，並將誓詞電告。
三月九日，參議院電告袁世凱，承認其受職，在電文中強調“《臨時約法》七章五十六條，倫比憲法，其守之維謹！勿逆輿情，勿鄰專斷，勿狎非德，勿登非才！”
表達了參議院對袁世凱還不是很放心的，也算是約法三章。
一九一二年三月十日，袁世凱誌得意滿的如願在北京就任臨時大總統，儀式在北京石大人胡同前清外務部公署舉行。與會者百餘人，“內有洋服者，有中服者，有有辮者，有無辮者，有紅衣之喇嘛，有新剃之光頭，五光十色，不一而足”。英國公使朱爾典也親臨觀禮。
袁世凱著軍服，佩長劍，精神抖擻，誌得意滿。