如果任由穆托繁衍，將會是全人類的災難！
但軍方領導卻並不著急，反正已經決定要用核彈炸了，一頭也是炸，兩頭也是炸，沒什麼區彆。
就在這時，哥斯拉趕到了！
仇人相見，分外眼紅。
被打擾了好事，兩頭穆托一擁而上，就對哥斯拉發起了進攻。
三頭巨獸開啟了一番混戰，整個核電站已經被夷為平地。
雖然是二打一，可哥斯拉卻並沒有落下風，反而直接擊殺了雄穆托，將它的腦袋咬了下來。
雌穆托見狀，悲鳴一聲，就飛了起來，逃向了東南方天際。
軍方領導見它要逃跑，也顧不上等核彈了，立即下達了攻擊指示。
一個戰鬥機群組追趕了上去，發射了導彈轟擊雌穆托。
但導彈對雌穆托並沒有造成多大的傷害，而雌穆托的電磁脈衝則直接讓戰鬥機失去了控製，從空中落下，紛紛墜毀，隻有戰鬥機駕駛員跳傘存活了下來。
雌穆托逃脫，哥斯拉憤怒的衝著天空吼叫了聲，將其餘幾個發電機組的燃料棒全部吞吃，然後向著雌穆托逃離的方向追了過去。
軍方領導再次拍出了兩個戰鬥機群組，分彆跟蹤穆托和哥斯拉的位置，詳細數據。
但在看到地圖上雌穆托的飛行，軍方領導卻發現，它飛行的方向，正好是運送核彈的運輸機飛來的方向。
軍方領導猜到到了它的意圖，馬上向運輸機發出警告。
但警告已經晚了，運輸機已經進入了雌穆托的視野。
雌穆托擊落了運輸機，並且把其中的核彈取了出來，咬著核彈，向著京都東市的方向飛了過去，並且降落在了市區裡。
因為穆托的電磁脈衝可以乾擾核彈的引爆裝置，運來的核彈被改造成了傳統倒數器控製，而核彈設置的最遲引爆時間是三十分鐘後，也就是說，三十分鐘過後，核彈就會自行爆炸了。
城市中的市民並沒能完全撤離，還有很多市民滯留在市區裡。
如果核彈爆炸，將會有大量民眾喪生。
時間已經來到了夜晚，因為核電站被摧毀，城市內一片黑暗。
為了阻止核彈爆炸，軍隊領導派遣了特種戰術小隊，通過空投進入城市，希望能將核彈拆解。
但在黑暗中，特種小隊無法確定雌穆托的位置。
這個時候，張龍出現了。
他是驅車趕回京都東市的，他親眼看到了雌穆托藏身的位置。
原來，雌穆托降落在了城市中心的體育場裡，並且開始產了卵，核彈則被放在卵的中央。
因為張龍展現出的戰術素養和掌握的信息，戰術小隊領導邀請張龍加入小隊，並將指揮的位置讓給了他。
張龍帶領著戰術小隊潛入了體育場，找到了那頭雌穆托。
雌穆托已經產完了卵，正在休憩，而核彈就在穆托卵的上方。
但在雌穆托的眼皮子底下，怎樣拿到核彈卻成了個難題。
就在張龍決定挺身而出，吸引穆托注意力的時候，哥斯拉出現了！