宗藩大會的落幕並不意味著整個宗室問題就立即得到完美的解決。
其中最重要的是，要解決世襲罔替親王的問題。皇室必須有宗室屏藩，作為平衡勳貴、文官之外的第三股勢力。此前的曆代皇帝因為靖難之亂的心理陰影，將宗室完全排除在政治生活之外，實際上造成了皇權的自限。
如今，朱翊鈞通過讓宗室開辦工廠、分配殖民地礦藏的方式，讓他們在經濟上不完全依賴宗祿；同時，開放宗室科舉之禁，讓他們能夠進入中下層行政管理體係；最後，還需要確定世襲罔替的親王，來確定將來“保皇黨”的核心力量。
因為李太後的原因，潞王這個世襲罔替在所有人的預料之中；周王因為在宗藩問題上全力支持皇帝，初代周王作為成祖的同母弟弟，也獲得了世襲罔替的尊榮；鄭王儘管在宗室裡麵算是小宗，但鄭王世子是格物院首任院長，鄭王本人被任命宗人府宗正，這個世襲罔替誰也挑不出理來。
除了上述三家之外，其餘大宗對世襲罔替也都眼熱的很。這時候去年聽了鄭王世子傳出來的話，削減自家田地的幾位王爺有福了——他們將自家土地或賣或送，最後保留的土地都在兩萬畝以內，而朱皇帝必須對支持自己政策的宗室給予表彰。
於是，去年差點被家人罵成傻子的靖江王、晉王、魯王、秦王、蜀王被皇帝冊封為世襲罔替親王——也讓其他二十多位無動於衷的親王差點把腸子悔青了。
在私下的聚會中，他們不敢罵皇帝，但大肆攻擊這些“舔溝子”的親王卻免不了——殊不知晉王、魯王、秦王三位親王並沒有這麼高的覺悟，而是被皇帝派出內臣悄悄做了警告。隻有蜀王和靖江王兩位是主動減地的，因此在冊封儀式上，又得賜白表黃裡大帶——其餘親王用的是白表紅裡大帶。
用自家數萬畝的土地換了一個世襲罔替的王爵，晉、魯、秦三位親王雖然是喜出望外，但也肉疼的很。然而隨後朝廷頒發的《爵位冊封條令》，則讓他們扶額稱慶。
萬曆六年六月十六，朝廷頒發了《爵位冊封條令》，將已經改的七零八落的宗藩製度用法律的形式加以固定。
條令中首先明確了宗室和勳貴的政治地位。具體如下親王分為世襲罔替和親王兩種；郡王分三級，而且起名簡單粗暴一等郡王、二等郡王、三等郡王。
然後宗室將進入公候伯子男的勳貴序列，和非宗室走同樣的降襲路子。起名同郡王，例如公爵直接一等公、二等公、三等公，以此類推。
宗室降到三等男爵的時候，不管往下傳多少代，不再降等。候爵以下，解除與勳貴聯姻的禁令；伯爵以上，得朝廷議政權；三等男爵以上，得地方議政權；為此，朝廷將設議政院，議政院成員可對朝廷和地方政策提出建議和意見。
其次條令規定了降襲的規則每代宗室或勳貴，嫡長子可降襲一等承爵；家主可另選一子降二等襲爵；其餘諸子平頭百姓。
即便降襲，還需要參加宗學考試，考試分文、武、格物三途，可自選任意一途獲得合格等次方能襲爵；連續兩次不合格的，嫡長子也要降兩等。
再次規定了宗祿的發放郡王以上的，仍得宗祿，作為他們不能進入行政機構的補償。其餘宗室按級彆得“宗室商社”股份，有爵位、分紅，無宗祿。
條令另行規定，郡王以下宗室幼子，從出生到十五周歲，按級彆不同得宗祿補貼——這一條是避免某一代敗家宗室將股份交易出賣之後，其幼子衣食無著。凡儀賓（即宗室女婿），宗祿一律剝奪。
除了這些條款外，還有大量解禁條款除宗室科舉之禁，宗室參加科舉得官的，不得襲郡王爵位，公爵以下隨意；除宗室任官限製，宗室公爵以下，除不得入閣和入樞密院外，其餘任命不受限製；除宗室“四民之業”禁令，凡宗室無論貴賤，都可在士、農、工、商等百業自食其力。