西班牙帝國才慌忙再次派來全權代表議和，洪旭表示拒絕單方麵與西班牙議和。
西班牙又派出特使前往邀請葡萄牙王國政府共同參與和談。
洪旭拿出了朱天明製定的最新版本停戰條件：除接受之前的全部條款外，西班牙政府還須永久割讓安達盧西亞地區和巴利阿裡群島；
西班牙政府還須要向葡萄牙王國永久割讓加利西亞地區。
經過兩天的反複拉鋸，在洪旭準備終止談判重新開戰的時候，西班牙的全權代表終於屈服，在停戰和約上簽了字，史稱為“科爾多瓦合約”。
之後，洪旭和甘輝第一時間派出軍隊，前往接管安達盧西亞各地及巴利阿裡群島的所有島嶼。
如此一來，大明帝國不但在歐洲、北非有了根據地，還在地中海裡麵打下了一顆釘子。
得知簽約和完成接管的消息，朱天明和崇禎興奮的痛飲了一場。
隨後更是加大了向占領區的物資運輸力度，並再次精心挑選了20艘戰鬥型的改進型樓船和福船派往葡萄牙，加入公海第一艦隊。
並正式將原公海第一艦隊改組為大明帝國皇家海軍地中海艦隊，艦隊司令部及艦隊母港設於加的斯，並於馬略卡島的帕爾馬建立海軍基地。
崇禎還從本土派來了一批官員，建立了一整套殖民地官吏係統。
將法魯地區及後從西班牙割讓而來的地區合並在一起成立了直布羅陀總督區，在從西班牙手中奪占的摩洛哥成立了北非總督區。
殖民地最高長官為地區總督，總督作為大明帝國皇帝的代表，執行大明帝國皇帝的旨意；
履行大明帝國本土的相關命令；管理殖民地行政事務；指揮殖民地駐軍及地方部隊；負責殖民地對外交往。
殖民地內的海軍部隊及相關設施不在總督管轄範圍之內，海軍艦隊由帝國海軍部直接管轄指揮，但在取得海軍部許可的前提下，艦隊可以配合殖民地總督的行動。崇禎十年元月，大明帝國直布羅陀總督區首任總督馬祥麟及大明帝國北非總督區首任總督李性忠抵達。
這位李性忠乃是一代名將李如鬆的次子，曾任薊遼總督中軍副將，頗有其父遺風。
兩位總督到達治所後，立即搭建起了管理體係。
開始丈量土地，勘探下去礦產資源，政治法度，並在大明帝國駐總督區的正規軍之外，各自組建了一支3、4萬人規模，由親明的當地人組成的治安部隊。
並開辦教育，在當地精英階層中推行漢化教育。由於有了大明的正規軍和地方治安軍的駐守，萬勝才得以率領海軍陸戰隊撤回國內。
崇禎十年冬月十六日直布羅陀要塞、鴿島要塞和休達要塞先後建成，
大批從本土運來的150毫米岸防炮、130毫米岸防炮、75毫米速射岸防炮、35毫米機關炮被布置在要塞的各個火力點位上。
為求萬無一失，就連反斜麵都布置了相當數量的火炮及重機槍，以防止陸軍從岸上奪取要塞。
從三大要塞建設完成後，兩大總督區分彆開始向地中海沿岸的所有國家、城邦發出公告，
所有途經直布羅陀海峽的船舶，必須事先前往駐伊維薩島的大明帝國駐地中海海事行署進行報備，經行署審批並繳納通行費用後方可通航。
如不進行報備，未經批準擅自通過海峽的一律擊沉。
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