以映雪市為目標的小智一行人，離開了水漣鎮後就抵達了終結洞窟。
廢棄的軌道延伸進入洞窟，小智四人找了一條看上去還算結實的軌道順著進入了終結洞窟中。莎莉娜拿著電子地圖介紹道：“終結洞窟在好幾年前就已經廢棄了，現在已經成為了許多野生寶可夢的居住地，有很多的訓練家也會來這裡哦！”
柚麗嘉道：“確實有好多寶可夢啊！阿利多斯、壺壺還有可多拉！”
終結洞窟中野生寶可夢的數量和種類確實不少，這也就是翔太推薦來的原因。隻是小智一進入終結洞窟就感覺波導之力的波動，監測器的數量還真是不少，閃焰隊的人還真是從自己這邊沒有辦法，就將目標放在終結洞窟。
岩壁上的光苔將終結洞窟裝點的像是星空一般，不需要手電筒也可以看清這裡生活的野生寶可夢們。
突然小軟跳下了柚麗嘉的背包，朝洞窟深處而去。小智三人跟上了小軟，在小軟的帶領下眾人來到了終結洞窟的中心最深處的地方，這裡有一個小池塘，池塘中泛著綠色的光芒，小軟跳進池塘裡，它頭頂的岩壁上就開始閃爍起了一個紅色的光點。
小軟跳到池塘裡之後，一道道綠色的光環開始自小軟的身體發散了出去。
紅色光點就是閃焰隊的信號，在終結洞窟外監測的閃焰隊成員，將這個消息傳回了總部的庫瑟洛斯奇那邊。
庫瑟洛斯奇道：“z1嗎？”他知道z1跟在小智的身邊，所以閃焰隊的所有人都不會輕易就去找小智的麻煩，於是他們就將目光落在了終結洞窟中的z2身上。
現在z1出現，那麼也就意味著小智他們也在。但這次可是一個千載難逢的機會，z1出現肯定會呼喚z2，趁著小智不備進行捕捉一事也不是不可行。
庫瑟洛斯奇趕緊下命令道：“茉蜜姬、阿可碧鎖定z2的位置進行捕獲！”
阿可碧道：“了解！被譽為傳說中的存在竟然會這麼愚蠢，自己暴露自己的位置。”
茉蜜姬道：“隻能說我們的偵測係統實在是太優秀了！”
庫瑟洛斯奇道：“希望你們能將z2抓住，那位搜查官隻要拖到，等到抓住z2就可以了！”
閃焰隊的四名乾部，同時趕往了終結洞窟。
小智道：“這水能夠讓小軟恢複，我們先等一下吧！”
隨著小軟身上發出的綠光，心電感應也隨之擴散了出去，彆人聽不到，但是小智卻聽的很清楚。小智的波導之力也隨著釋放了出去，z2在不遠處回應著小軟。
小智道：“閃焰隊的人來了！”
突然間，幾道飛彈針就朝著池塘中的小軟射了過來，皮卡丘一躍而起用鐵尾儘數擊碎，小智道：“柚麗嘉你帶著小軟躲到一邊去，這裡就交給我們了！”
小智道：“我還以為你們還要一段時間才能來呢！”
隻見黑暗中出現了閃焰隊的成員，帶隊的就是克蕾兒和另外一個綠色頭發的女人。那人自我介紹道：“小智搜查官，初次見麵，我的名字叫做芭菈，久仰大名了！雖然一開始這麼說很失禮，但是我們還是希望你能將那個小妹妹手裡的那孩子交給我們！”
小智道：“直接動手吧！看看你們能不能將它帶走！”
小智的皮卡丘和甲賀忍蛙對上了克蕾兒和芭菈的龍王蠍和劈斬司令，剩下的閃焰隊成員的寶可夢，小智派出了黏美龍和戰鬥飛鳥幫忙希特隆和柚麗嘉。
“十字毒藥！”
“鐵頭！”
“皮卡丘，嬉鬨！甲賀忍蛙，水手裡劍！”
皮卡丘撲向了劈斬司令，嬉鬨直接就將劈斬司令給解決了。龍王蠍交叉鉗子，紫色的十字光芒與水手裡劍碰撞在一起。皮卡丘從煙霧中衝了出來，迎麵一擊鐵尾就讓龍王蠍失去了戰鬥能力！
小智道：“還要繼續嗎？另一邊想來也失敗了吧！”
小智在知道了z2的存在後，已經讓瑪夏多過去了。芭菈道：“撤退！再繼續下去，我們也得栽在這裡了！”
克蕾兒上次就差點被小智抓住，小智的能力她很清楚，達克萊伊神出鬼沒的，還不是小心就能避免的程度，點了點頭道：“撤退！”
閃焰隊這次撤離的很是果斷，許多煙霧彈釋放後閃焰隊就完全撤離了終結洞窟！
小智道：“他們隻是來牽製我們的，現在要趕去小軟的另一邊分身的那裡，瑪夏多位置！”小智用心電感應聯係上了瑪夏多，眾人眼前的景物再次清晰的時候已經離開了終結洞窟。
瑪夏多一隻對戰閃焰隊的所有人的寶可夢，雖然不落下風但視線卻不能時時關注到z2的身上，瑪狃拉的破壞死光將z2給擊飛了出去，但z2沒有摔在地上，而是落入了一個溫暖的懷抱中。
小智他們在千鈞一發的時候出現了！
柚麗嘉道：“跟小軟長得一樣啊！隻是這裡得顏色不一樣，小軟是紅色你是藍色！”
小智道：“你們兩個現在走還是留下？”
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