二十日後，各科考試全部進行完畢。
戊辰年之前的科舉會試是分三日、每日三場進行，結束後的七天內揭榜，然後在次月進行殿試廷對。
而戊辰科考試改革時，在朱由校的要求下，從會試到最後殿試放榜，總共隻用了五天，武舉和五科考試更是隻用了三天，真的差點沒把禮部、翰林院、國子監這些官員給累死。
於是，這一年將辛未科考試時間延長到一個月，每天隻進行一科，使所有考生都有機會可以嘗試參加所有九科的考試，這也使得考生有機會可以同時兼得幾科進士的名頭。
四月一日，殿試在皇極殿進行。
這次朱由校沒有像戊辰年時那樣缺席，而是命孫慎行和徐光啟主持，自己到場觀禮。
文科殿試時，全程由孫慎行主持進行，朱由校從眾考官早就擬好的考題中選出一個，在廷對時讓考生作答，最後確定進士排名。
武舉殿試就更簡單了，采取淘汰製打擂台比武，最後勝出一人便是武狀元。有趣的是，早已被朱由校在默默無聞中提拔起來，到宣大軍任職的王來聘依然從宣府邊關回來參加了武舉考試，並一舉奪得武舉狀元。
朱由校問他“王卿家已是邊軍大將，為何還執著於參加武舉呢？”
王來聘答道“稟陛下，末將自幼習武，立誌以武入仕，建功報國！承蒙陛下知遇之恩，破格拔擢於微末之間，然末將身無功名，寸功未立，實無顏久居師長之職！今蒙天恩，幸運奪魁，末將可安心戍邊報國矣！”
朱由校聞言，也隻能好生安慰一番這位忠心為國、也爭強好勝的邊軍大將了。
其餘七科因為全都是分數製，所以隻要是及格的就全部錄取為進士，所以壓根就不需要再進行殿試廷對，隻是讓錄取之人前來參見皇帝。
但當輪到地科的進士參見時，朱由校卻始終沒有從中看到李寄的身影，便命魏忠賢取來進士名單，結果名單中還真沒有李寄的名字。
朱由校喚來孫慎行，問道“孫卿家，你確定進士名單沒有出錯嗎？確實是以分數錄取的？”
孫慎行心頭一凜，接過名單查看起來，又不斷回憶會試以來的所有細節，確認沒有問題後，便道“稟皇上，臣確定沒有出差錯，這就是最終名單。”
朱由校眉頭大皺“把所有考生答卷都帶到禦書房。”
說完立刻起身，頭也不回就離開了，留下一眾大臣和考生麵麵相覷。
朱由校回到禦書房後一陣子，孫慎行帶著禮部官員把所有考卷都搬了過來。
“朕要查卷，把地科考試答卷找出來。”
孫慎行汗流浹背，快速從一堆紙卷中找出地科答卷，呈給皇帝。
張全幫忙將答卷攤開在桌案上，小心翼翼撕開紙封。
朱由校一張張翻開，才翻到第四份就停了下來，他一眼就認出了那天李寄的答卷，那是他親自挑選的地名，李寄的字跡他也記得清清楚楚。當時李寄的答案全部正確，就算不是狀元，那也絕對不至於連及格都達不到！
於是，朱由校一把撕開考生姓名的紙封。
果然！
映入眼簾的赫然是一個叫做孔連珠（虛構）的名字，而不是李寄。
“啪——”朱由校勃然大怒，重重一掌拍在桌上“竟然有人徇私舞弊！”
“皇上息怒！臣絕沒有徇私舞弊之舉啊！”
孫慎行驚慌失措，急忙全身跪伏在地。
“哼哼——好得很呐！好得很——”
朱由校怒目圓睜，沉默了一陣，又冷笑道“孫卿家你起來吧，朕相信你不會做此徇私舞弊之事。但你要記住，今晚之事你要全當沒有發生過，後日照常放榜，你懂了嗎？”
孫慎行冷汗涔涔，急忙道“臣遵旨！臣誓死……不！臣就是在禦書房與皇上閱卷，商定三甲人選。”