中國古代五大玄學秘術體係山、醫、命、卜、相中，茅山法術屬於仙之一脈的秘術，是將自然力量儀式化和神秘化之後的產物，是道教所衍生出的一種實用性的方法。祝由術則是醫道的一種秘術，這種秘術據說也有念咒做法治病救人的功效。
但祝由術和茅山法術在治病救人的方法論上，有著根本性的不同。
關於祝由術的由來，據說起源於遠古三皇五帝時期，當年軒轅黃帝見百姓受到疾病困擾，而那些妖氣與邪氣趁著人虛弱之際，蠶食人們的魂魄與血肉，使得人類無法走出疾病的困擾，於是，黃帝命手下大臣設“祝由”這一官職。
擔任這個官職的人，是一群精通玄學和醫術的人，這群人搜集百病的起源，並歸納總結出一套治病救人的方案。
當年黃帝與蚩尤大戰之時，九天玄女曾經賜予天地運行的奧秘，這些擔任祝由的官員們，就憑借著對於天地大道的體悟與觀察，創造出了一套基於玄學理論，並通過實踐與推理得到的醫道秘術。
據說這種秘術可以通過文字化為符咒，來達到驅除疾病，安神招魂的目的，這種文字符咒，據說當時有一百七十道，這種秘術流傳下來，就被稱之為祝由術。
後來，中醫體係逐漸的建立，實踐之中得到的經驗又由張仲景、陶弘景、孫思邈、華佗、扁鵲等中國古代醫師不斷的總結歸納，優化之後，形成了中醫理論體係。而祝由術的內容，也被拆開，融入了中醫理論體係，其中神秘的秘術在流傳之中也就失傳了。
直到宋朝之時有節度使受命治理黃河，在清理黃河河道之時，發現了一個刻印著奇異文字的石碑。
這石碑以巨石整體打造，上麵刻有五十八個奇異的文字，這些文字雖然字形像是古體漢字，但識字的人卻無法理解文字的含義。
眾人好奇，於是爭相來觀看石碑上的古文字，有的人看完之後，神清氣爽，精神百倍，身上的一些頑疾和暗傷竟然慢慢的痊愈了。
而有的人看完之後反而一蹶不振，精神萎靡，不久健康的身體也生出了各式各樣的怪病。
於是人們嘖嘖稱奇，將這則傳聞傳給彆人聽，正巧這有一個深諳玄門數術的張道士外出遊曆，聽聞了此事便冥冥中心有所感，於是來到黃河邊上的巨大石碑之前觀摩。
看完之後，張道士對一旁的眾人說道，
“此上記載的乃是祝由之術，是當年黃帝一百七十個符咒中的五十八種秘術符咒，有移精變氣的功效。但用法若不當，反而會產生疾病，待老道我記下來，諸位再將這石碑埋入這黃河之中，以免誤傷好人，或被奸詐之人利用。”
於是這張道士就記載下這五十八個文字，又指引眾人，將這石碑重新埋入黃河之中。