楊遠航等人成功降落在被神秘光芒籠罩的星球。剛下飛船，一群身形巨大、力量驚人的生物便張牙舞爪地撲來。小棠趕忙釋放基因力量，試圖與這些生物的基因共鳴以化解攻擊。激烈交鋒中，他們發現這些生物基因裡藏著古老神秘力量，或許與基因起源緊密相關。
眾人一邊戰鬥一邊探索，很快發現了古老遺跡和神秘符號。星耀用探測設備分析，卻毫無頭緒。關鍵時刻，林婉婷回憶起古老文獻，和小棠發現的基因資料圖案一對照，竟真的開始解讀出部分信息。原來，這顆星球曾是宇宙基因力量的源頭之一，遠古文明在此進行禁忌基因實驗，引發了巨大災難，而這災難正是如今宇宙基因危機的根源。
正當他們深入遺跡時，能量場劇烈波動，生物再度瘋狂攻擊。混亂中，楊遠航意外觸動機關，一道暗門緩緩開啟，門後是散發詭異光芒的洞穴，似乎藏著驚天秘密。
眾人小心翼翼走進洞穴，裡麵滿是奇異晶體，不斷釋放能量波動。小棠觸摸晶體，瞬間接收大量古老畫麵：文明繁榮、基因實驗失控、星球陷入毀滅。還沒等他們消化這些信息，洞穴外傳來震動，一隻散發強大能量光芒、體型巨大的生物緩緩走來，它目光中透著智慧，死死盯著眾人。
星耀警惕道：“看來這就是星球的守護者。”小棠趕忙用基因力量與它溝通，一番努力後，守護者放鬆了攻擊姿態。通過心靈交流，小棠得知它一直守護星球基因秘密，防止危險技術被濫用。如今黑暗勢力崛起，它深感危機。守護者告訴眾人，要解決基因危機，必須找到藏在星球核心的“基因之源”，但前往核心的路充滿能量風暴和基因災難扭曲的恐怖生物。
在守護者幫助下，眾人獲得特殊能量護盾，向著核心進發。一路上，能量風暴如猛獸衝擊護盾，扭曲生物也不斷發起攻擊。一隻章魚狀生物突襲，觸手堅硬，瞬間擊裂護盾。楊遠航和林婉婷奮力抵擋，小棠集中精神進行精神對抗，終於控製住它，開辟出一條通道。可隨著深入，能量風暴愈發猛烈，護盾能量即將耗儘，眾人命懸一線。
就在眾人快要支撐不住時，終於抵達星球核心區域。光芒中，“基因之源”懸浮半空。還沒等他們靠近，黑暗勢力飛船突然出現。首領站在船上，冷冷下令：“把基因之源交出來，否則都得死！”
楊遠航等人毫不畏懼，雙方激烈對峙。黑暗勢力率先攻擊，能量炮傾瀉而來。眾人迅速躲避反擊，小棠想用基因力量乾擾飛船，卻被防禦係統擋住。戰鬥進入白熱化，林婉婷受傷，形勢危急。
楊遠航咬緊牙關，駕駛飛船穿梭尋找弱點，星耀全力發動宇宙能量牽製敵人。小棠強撐疲憊，鎖定飛船能量核心，成功侵入引發爆炸。黑暗飛船搖搖欲墜卻仍負隅頑抗，楊遠航準備駕駛飛船與其同歸於儘。
千鈞一發之際，守護者出現，擊飛黑暗飛船。眾人來到基因之源前，卻被排斥。小棠融入對宇宙和生命的理解，再次嘗試，終於成功握住基因之源。瞬間，強大純淨的能量傳遍全身，她不僅修複了林婉婷的傷勢，還將能量分享給同伴。利用基因之源的力量，他們開始修複宇宙基因平衡，黑暗勢力暫時不敢輕舉妄動。但眾人知道，戰鬥尚未結束，黑暗勢力仍在暗處，宇宙還有未知危險。不過此刻他們手握希望，將繼續守護宇宙和平，迎接新挑戰。
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