建武九年公元33年癸巳年）
春天，正月，潁陽成侯祭遵在軍中去世，劉秀下詔讓馮異一並統領他的軍隊。祭遵這人，廉潔簡約，做事小心，克己奉公，得到的賞賜都分給了士兵。他帶兵紀律嚴明，所到之處，當地的官吏和百姓都感覺不到軍隊的侵擾。他選拔人才都用儒家的標準，喝酒作樂的時候，一定是高雅地唱歌、玩投壺遊戲。臨終前，他留下遺言要薄葬；彆人問他家裡的事，他始終沒說什麼。劉秀對他的去世格外悲痛，祭遵的靈柩運到河南時，劉秀穿著素服親臨吊唁，望著靈柩痛哭，十分哀傷。回宮途中，劉秀到城門前，看著運喪的車經過，眼淚止不住地流。喪禮結束後，劉秀又親自用太牢的禮儀祭祀他。還下詔讓大長秋、謁者、河南尹負責辦理喪事，大司農提供費用。到下葬時，劉秀又親臨；安葬之後，還到他的墳前，慰問他的夫人和家人。之後朝會的時候，劉秀常常感歎說：“到哪兒能再找到像祭遵這樣為國分憂、奉公守法的人呢！”衛尉銚期說：“陛下您太仁愛了，一直不停地哀悼祭遵，讓群臣都感到又慚愧又敬畏。”劉秀這才不再提。
隗囂又病又餓，隻能吃乾糧，又氣又恨，最後去世了。王元、周宗擁立隗囂的小兒子隗純為王，聚集兵力據守冀縣。公孫述派將領趙匡、田弇去幫助隗純。劉秀派馮異去攻打他們。
公孫述派他的翼江王田戎、大司徒任滿、南郡太守程泛率領幾萬人從江關出發，打敗了馮駿等人的軍隊，接著攻下巫縣以及夷道、夷陵，趁機占據荊門、虎牙。他們在長江上橫著拉起浮橋、建起關樓，樹立起木柱阻斷水道，又在山上紮營，堵塞陸路，以此來抵擋漢軍。
夏天，六月丙戌日，劉秀到緱氏縣，登上轘轅山。
吳漢率領王常等四位將軍，帶著五萬多人的兵力，在高柳攻打盧芳的將領賈覽和閔堪；匈奴派兵救援，漢軍作戰不利。從這以後，匈奴勢力越來越強盛，侵擾掠奪日益增多。劉秀下詔讓朱祜駐軍常山，王常駐軍涿郡，破奸將軍侯進駐軍漁陽，任命討虜將軍王霸為上穀太守，來防備匈奴。
劉秀派來歙全麵監督駐紮在長安的各位將領，太中大夫馬援做他的副手。來歙上書說：“公孫述把隴西、天水當作屏障，所以才能多撐些日子。現在這兩個郡要是平定了，公孫述也就沒什麼辦法了。應該多挑選兵馬，儲備物資糧食。現在西州剛經曆戰亂，士兵百姓又疲憊又饑餓，如果用錢財糧食去招撫，他們的人就能夠聚集起來。我知道國家需要供給的地方不止一處，費用可能不足，但這也是沒辦法的事啊！”劉秀覺得他說得對。於是下詔在汧縣儲備了六萬斛糧食。秋天，八月，來歙率領馮異等五位將軍到天水討伐隗純。
驃騎將軍杜茂和賈覽在繁畤交戰，杜茂的軍隊打了敗仗。
從王莽末年開始，各個羌族部落就進入塞內居住，金城的屬縣大多被他們占據。隗囂沒辦法征討，就隻能安撫接納他們，征調他們的人馬來和漢軍對抗。司徒掾班彪上書說：“現在涼州各郡都有投降的羌人，羌人披散著頭發，衣襟向左開，和漢人雜居在一起。他們習俗不同，語言也不通，經常被一些狡猾的小官吏欺負掠奪，走投無路又氣憤無奈，所以才會反叛。蠻夷引發的戰亂，大多是這個原因。按照舊製，益州部設置蠻夷騎都尉，幽州部設置領烏桓校尉，涼州部設置護羌校尉，他們都拿著符節，負責安撫這些少數民族，處理他們的矛盾，每年按時巡查，詢問他們的疾苦。還經常派翻譯去溝通，了解他們的動靜，讓塞外的羌人成為官吏的耳目，這樣州郡就能提前做好防備。現在應該恢複舊製，以此來顯示威嚴，加強防範。”劉秀聽從了他的建議，任命牛邯為護羌校尉。
有盜賊殺害了陰貴人的母親鄧氏和她的弟弟陰欣。劉秀非常傷心，封陰貴人的弟弟陰就為宣恩侯，又把陰就的哥哥侍中陰興召來，想要封他，把印綬都擺在麵前了。陰興堅決推辭說：“我沒有衝鋒陷陣的功勞，可一家人好幾個人都承蒙封爵賜土，這會讓天下人失望，我實在不願意這樣！”劉秀很讚賞他，沒有強行改變他的想法。陰貴人問他為什麼，陰興說：“外戚家族就怕不知道謙虛退讓，嫁女兒就想許配給王侯，娶媳婦就盯著公主，我心裡實在不安。富貴是有儘頭的，人應當知足，過於誇耀奢侈隻會被人譏諷。”陰貴人聽了他的話很有感觸，深深自我克製，始終沒有為宗親謀求官職。
劉秀把寇恂召回，任命漁陽太守郭汲為潁川太守。郭汲招降了山賊趙宏、召吳等幾百人，讓他們都回家務農，然後自己上書彈劾自己擅自做主。劉秀沒有怪罪他。後來趙宏、吳等山賊的黨羽聽說了郭汲的威望，有的從江南，有的從幽州、冀州遠道而來，不約而同地前來投降，絡繹不絕。
莎車王康去世，他的弟弟賢繼位，賢攻打並殺死了拘彌、西夜的國王，然後讓康的兩個兒子分彆去做這兩個國家的國王。
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建武十年公元34年甲午年）
春天，正月，吳漢又率領捕虜將軍王霸等四位將軍，帶著六萬人從高柳出發攻打賈覽，匈奴派幾千騎兵來救援。雙方在平城下接連交戰，漢軍把匈奴和賈覽的軍隊打敗，他們逃走了。
夏陽節侯馮異等人和趙匡、田弇交戰將近一年，最後把趙匡、田弇都斬殺了。但隗純還沒被打敗，將領們想暫且撤回去讓士兵休息，馮異堅持不撤，大家一起攻打落門，卻沒有攻下。夏天，馮異在軍中去世。
秋天，八月己亥日，劉秀到長安。
當初，隗囂的將領安定人高峻帶兵占據高平第一城，建威大將軍耿弇等人圍攻，一年都沒攻下來。劉秀打算親自去征討，寇恂勸諫說：“長安處於中心位置，對周圍的接應很方便，安定、隴西的人一定會因此感到震驚恐懼。您坐鎮長安，就可以控製四方。現在士兵和馬匹都很疲倦，還要去跋涉險阻之地，這對陛下您不安全啊。前年潁川的事，就是個深刻的教訓。”劉秀不聽。戊戌日，劉秀到了汧縣。高峻還是不投降，劉秀就派寇恂去勸降他。寇恂帶著璽書到了高平第一城，高峻派軍師皇甫文出來拜見，言辭禮節都很傲慢。寇恂很生氣，要殺了他。將領們勸諫說：“高峻有一萬精兵，大多都是強弩手，西邊擋住了隴道，多年都沒被攻下。現在咱們想勸他投降，卻反倒殺他的使者，這恐怕不行吧？”寇恂沒回應，還是把皇甫文殺了，然後派他的副手回去告訴高峻：“你的軍師無禮，已經被我殺了！你要是想投降，就趕緊降；不想降，就繼續固守！”高峻非常害怕，當天就打開城門投降了。將領們都來祝賀，接著問：“請問您殺了他的使者，卻能讓他的城投降，這是為什麼呢？”寇恂說：“皇甫文是高峻的心腹，是給他出謀劃策的人。他這次來，言辭毫不屈服，肯定沒有投降的打算。留著他，他就能繼續給高峻出主意；殺了他，高峻就沒了膽子，所以就投降了。”將領們都說：“這可不是我們能想到的啊！”冬天，十月，來歙和各位將領攻破落門，周宗、行巡、苟宇、趙恢等人帶著隗純投降，王元逃到蜀地。劉秀把隗囂的族人都遷到京城以東。後來隗純和賓客逃到匈奴，到武威的時候被抓住，然後被處死。
先零羌和其他部落侵犯金城、隴西，來歙率領蓋延等人迎擊，把他們打得大敗，斬殺和俘虜了幾千人。然後打開糧倉賑濟饑餓困乏的百姓，隴右地區於是安定下來，涼州的交通也恢複暢通。
庚寅日，劉秀回到宮中。
評論
建武九年到十年，劉秀政權在軍事、政治及民族事務等方麵持續發展並麵臨諸多挑戰。
軍事上，祭遵的離世是一大損失，他廉潔奉公、治軍有方，其作風深受劉秀讚賞與群臣敬重，他的去世引發劉秀深深的悲痛與追念，也從側麵反映出劉秀對優秀將領的重視與依賴。在對隗囂勢力的征伐上，雖隗囂本人去世，但殘餘勢力仍在抵抗，馮異等將領持續作戰，展現出堅韌不拔的軍事精神。然而，戰事進展並非一帆風順，如吳漢與匈奴作戰不利，杜茂戰敗等，體現出當時局勢的複雜性與軍事鬥爭的艱難。
政治方麵，劉秀在應對各方事務時展現出一定的決策能力。他聽從來歙建議儲備軍糧，為後續作戰做準備；對寇恂、郭汲等地方官員的任用也較為得當，郭汲在潁川成功招降山賊，穩定地方。在處理陰氏家族事務上，陰興的謙遜退讓以及陰貴人的克製，體現出劉秀時期外戚家族相對良好的風氣，這也有助於維護政權的穩定。
民族事務上，羌族問題凸顯，他們從王莽末年入居塞內後，常因受欺引發叛亂。班彪建議恢複舊製設置護羌校尉，劉秀采納，這一舉措對安撫羌族、穩定邊疆意義重大。而在對高峻的勸降事件中，寇恂果斷斬殺其使者從而成功勸降，展現出非凡的謀略與決斷力，也反映出劉秀用人不疑，給予將領充分的信任與自主權。
總體而言，這兩年劉秀政權在艱難中穩步推進統一進程，在軍事、政治、民族關係等方麵不斷調整策略，逐步鞏固統治基礎，為國家的穩定與發展奠定了重要基礎。
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