李廷機自知時日無多，趁自己神智尚清，連忙以口述的方式，讓外孫女陳阮芷替自己寫下一封奏疏，算是給萬曆帝的遺奏。
奏疏中，李廷機言辭懇切地向皇帝建議了四件事。
一是說東宮仁孝，性行拘謹，並無大過，希望皇帝不要在儲君之事上，再產生動搖，以免人心不安；
二是說朝政紊亂、百官缺位，國家如今積弊已深，希望皇帝重新振作起來，及時刷新吏治，不要再拖延下去。
三是說群臣結黨，相互攻訐，門戶之爭愈演愈烈，過去皇帝對此視而不見，甚至故意縱容，希望皇帝能加以抑製，不要讓文武臣工們繼續胡鬨下去。
最後李廷機提到了程光陽，對此他沒有說太多，隻希望皇帝能看在自己這些年為國家操勞的份上，饒恕程光陽一命。
這份奏疏寫完，又過了幾日，李廷機的病越來越重，整個人徹底失去生機，眼看就要油儘燈枯了。
“恩師，您可還有什麼話要交代麼……”
得知李廷機病入膏肓，不少人相繼登門探望，包括泉州知府蔡善繼，晉江知縣吳牲，以及陳豐頊、陳阮芷兄妹，還有他們的母親陳李氏等等。
蔡善繼不久前剛從廣州調到泉州，他是當年李廷機主持浙江鄉試時錄用的舉人，與李廷機有師生之誼。
眼看恩師骨瘦如柴、氣息奄奄，蔡善繼心中酸楚不已，忙湊到對方身旁，開口詢問道。
李廷機氣息微弱道：“伯達，老夫死後，喪事從簡，不，不要鋪張浪費……程複甫的事，我，我已寫成奏疏，你替我送，送到通政司，交給皇上。”
伯達是蔡善繼的表字。
“恩師放心，學生一定從命。”蔡善繼哽咽道。
李廷機微微點頭，偏過眼，看了看陳豐頊和陳阮芷，低聲道：“豐頊，你以後要，要加倍努力，早日考中舉人……阮芷，複甫的事，你不必太過擔心。”
說罷這些，李廷機睜開眼睛，用儘最後的力氣，將床榻周邊的人全都看了一遍，最後目光落在了妻子林氏身上。
過了不知多久，終於依依不舍地合上了雙目。
現場立時哭聲一片。
…
萬曆四十四年正月，前禮部尚書、東閣大學士李廷機，病逝於泉州。
李廷機一生清廉，平日領取的俸祿，以及朝廷賜給的官田，全被他拿來贍養貧苦族人，去世之時，家中沒有多餘積蓄，僅剩四十四兩白銀。
這四十四兩白銀，遺孀林氏還得拿出大半來操辦喪事，剩下的部分，竟連買口上好的壽材都不夠。
最後還是泉州知府蔡善繼，出錢替恩師買了一副棺木，派人送到李家，李廷機這才得以順利下葬。
李廷機病故之前，寫給萬曆皇帝的遺奏，被他托付給了蔡善繼。
蔡善繼準備將這封奏疏，連同李廷機去世的訃告，由急遞鋪送到省塘，而後再送往京師，交給皇帝。
陳阮芷得知後，堅決不同意。
“明府老爺，賤妾有禮了。”