據此部署，顧品珍所部於一月二日占榮昌，八日下隆昌，十五日占內江。
熊克武指揮之川省靖國軍於一日克渠縣，三日克遂寧，九日克順慶（今南充）、保寧（今閬中）。
黔軍王文華師占領了大足等地。
此後，趙又新所部於十四日占富順，敘南趙鐘奇進占屏山、筠連。靖國聯軍的強大攻勢，不僅打破了劉存厚反攻瀘州、重慶的計劃，而且進一步削弱了他的實力。
劉存厚各部被壓縮在敘州、自流井、簡陽至成都的狹長地域內。麵對險惡形勢，一麵迭電北京政府，請速接濟槍支彈藥，並請轉令陝、甘、鄂三省督軍迅速抽調勁旅增援。同時再次調整兵力，準備對聯軍實行局部反攻，企圖奪回部分失地，穩住陣腳，堅守待援。
一九一八年一月十六日，劉存厚軍北路司令楊肇錫反攻遂寧獲得成功。
二十日，南線之舒榮衢旅打退趙又新部的進攻，奪回富順。中路鐘體道師也擊敗進攻安嶽之黔軍，推進到永清。
劉存厚軍的反擊，給滇軍造成較大損失，但其所屬部隊亦因數月激戰，已成強弩之末。局部反攻雖獲小勝，終因兵力不敷，無法擺脫被動態勢。
一月二十三日，北京政府任命劉存厚兼北洋陸軍第二十一師師長，舒榮衢為該師第四十一旅旅長，陳洪範為第四十二旅旅長，劉成勳為陸軍第二十二混成旅旅長，汪可權為第二十三混成旅旅長。試圖用將劉存厚所統之川軍納入北洋軍序列的作法，把劉存厚牢牢拴在“武力統一”的戰車上。
北京政府這一招果然見效，劉存厚在接到命令的當天，即致電北京政府，聲稱要作戰到底，“決不與滇黔議和”。
然而，這種堅定態度，並未給川軍帶來任何希望。
一月二十五日起，川南滇軍分兵四路向敘州、富順、內江和資中等地發起猛烈進攻。劉軍因傷亡慘重，彈藥匱乏，後援不繼，戰力銳減，整個防線呈瓦解之勢。
三十日，劉存厚急電段祺瑞，謂“餉械全罄，各軍退卻，敘州、遂寧相繼失陷，維持力竭，乞速援救”。
但此時北軍在湖南新敗，嶽州失守，北軍正急於改變湖南戰場的被動態勢，無力顧及四川方向。對劉存厚的告急電，未予回音。
一月三十一日，滇軍攻占敘州，二月二日攻占內江、富順，六日攻占自流井。
劉存厚軍一、二、三師龜縮於樂山、簡陽至成都間狹小的地域內。
為了保存實力，應付危局，劉存厚於一月三十一日通電宣稱將四川督軍一職讓給熊克武，“自己解甲歸田，以明素誌”，要求與聯軍停戰議和。
這一緩兵之計當即被聯軍識破，認為“所雲停戰，實係緩兵”。
唐繼堯、熊克武要求劉存厚率部撤出四川，退往陝西。劉存厚默而不答。於是，各路靖國軍繼續揮兵前進。
緩兵之計落空後，劉存厚決心以所餘兵力固守成都外圍要點，等待北京政府救援。
他分析戰場形勢，認為滇軍在南路，黔軍及熊克武所部在北路，“兩相比較，實南強而北弱”，因而決心對南路之滇軍取守勢，對北路之黔軍取攻勢。為此，決定抽調防守資中的部分兵力至簡陽方向，準備伺機反擊。
二月上旬，防守簡陽的川軍第三師未等資陽之援兵趕到，就倉促協同第二師之第三混成旅，對樂至之黔軍發動進攻，攻占該鎮後，又繼續進攻安嶽。
中途遭到黔川聯軍迎頭痛擊，旋即放棄樂至，回守簡陽。聯軍乘勢追擊，在樂至以西之施家壩遭到由資中和樂山赴援之劉存厚軍猛烈阻擊。
正當簡陽劉存厚軍頑抗聯軍進攻之際，第二師所屬之劉成勳、陳洪範兩旅於二月十六日在樂山宣布參加護法。十八日，第一、三兩師全體軍官和第二師之汪可權、舒榮衢旅，也宣布與西南靖國軍一致行動，並推熊克武主持四川軍政事務。
劉存厚軍紛紛參加護法，滇黔軍得以長驅直入，於二月十八日占領簡陽，進逼成都。熊克武所部也乘勢攻占淮鎮，向成都挺進。
劉存厚見所屬部隊分崩離析，無法再戰，遂於二月十九日夥同城防司令田頌堯等撤離成都，退往川北。
三月八日，孫中山任命熊克武為四川督軍。曆時八個月的四川護法戰爭，至此告一段落。
與此同時，其它各省的護法勢力也有很大發展，“獨立”、“自主”的通電接連不斷。
在湖北，石星川、黎天才的靖國軍雖遭挫損，但尚有革命黨人蔡濟民率領的民軍在廣濟等地活動。
在陝西，陝軍團長郭堅在鳳翔宣告自主，革命黨人於右任、胡景翼在三原宣布獨立，陝西靖國軍一度攻占了西安。
在浙江，駐寧波的旅長葉煥華宣告獨立，溫州、處州（今麗水）、紹興等地的軍隊一度響應。
在河南，原京津總稽查長王天縱在臨汝宣告獨立；在山東，部分陸軍起義，一度攻占了東平。
在福建、安徽，也出現“靖國軍”、“討倪軍”，響應護法。
短短幾個月內，護法烽火遍及十幾個省，形勢十分有利。這時，如果參加護法的各種勢力能夠團結一致，在護法軍政府統一領導下，協同作戰，共同對敵，未嘗不能發展大好形勢。