除了禁止鹽商直接下場收鹽，朱載坖還和重臣們一道商量對策，對於吳家所供出來的商人和官員，要予以分門彆類的處理，朱載坖很清楚，現在的鹽政官員，沒有不貪墨受賄的，對於一些貪墨數量不大，而且隻是收受陋規的官員，可以予以從輕處理，但是對於這些放縱鹽商拖欠國課，甚至為他們走私食鹽提供庇護的官員，一定是要嚴懲的。
所以要對這些官員們進行審查，情節輕微的由都察院、吏部和三法司處理，情節嚴重的，不好意思，詔獄大酒店雅座一位，對於這些鹽商，也要予以懲治，首先自然是追繳拖欠的稅銀，膽敢欠稅的，不僅僅要追繳鹽稅，還有予以懲罰的罰款，朱載坖指令戶部，欠一年翻一倍，交不出來就充軍發配，不管是去緬甸砍樹還是去哈密放羊，總之朝廷的鹽稅，是一分也不能少的。
還有就是這些為鹽商充當打手的地痞流氓，這些人直接欺壓百姓，甚至販運私鹽，罪大惡極，朱載坖命令各屬地巡撫、大理寺分司、按察使司和各鎮官軍、巡檢一道，將這些地痞流氓收係，民憤大的直接就地正法，剩餘的一律流放緬甸，現在朝廷在造戰艦，需要大量的木料，緬甸很缺乏勞動力砍樹，這些人正好去乾活。
然後朱載坖命令各運司和地方官府，統計和鹽場的灶戶數量，以保證朝廷對於鹽政的基本情況的了解。朱載坖突然采取行動，懲治這些鹽商和貪墨的官員，雖然在官員們意料之中，但是所波及的麵之廣，還有朱載坖這次的決心之大，是他們沒有想到的，朱載坖不僅是對兩淮鹽政痛下殺手，對於大明的其他鹽場，也同時采取行動，一時之間，緹騎四出，人心惶惶。
不少官員上疏認為朱載坖以廠衛辦理此案，過於殘酷，但是朱載坖對於這些奏疏，一概禦批道：“當高皇帝在時，爾輩敢如此狺狺乎？”
不過相比於懲治這些人，朱載坖更加關心的是重新理順朝廷的鹽政，所以朱載坖召集閣部重臣們商量此事，之前朱載坖已經和張居正等人溝通過了，這次對於鹽政的整頓，主要是急於兩個方麵，第一就是保證朝廷的鹽稅不流失，第二就是保持百姓的食鹽供應和鹽價的穩定，這兩點都是要兼顧的。
朱載坖很清楚，食鹽是的重要性，對於百姓來說，食鹽是重要的生活物資，一旦短缺，是會影響到百姓的生計的，一頭是朝廷的鹽稅，另一頭是百姓的生計，這兩頭都是不能放棄的，那麼隻有壓縮鹽商的利潤空間和整個官僚集團所貪墨的銀兩才行，這點朱載坖是很清楚的。
大明的鹽價一直在漲，朱載坖查閱了曆年的舊檔之後發現，鹽價最便宜時的景泰年才1.79文，平時不過六、七文左右，嘉靖初年胡廣大荒鹽價才漲到二十八文到三十二文，然後鹽價就一發不可收拾了，現在南京等處，鹽價基本上是在三十文左右，就是鹽價便宜的地方，也在十文一斤左右，朱載坖認為還是要執行限價製度，將鹽價控製在一個合理的水平，這樣才能夠保證百姓的生計。
降低鹽價的最好辦法就是提高食鹽產量，關鍵在於刺激灶戶的生產，現在灶戶們生計艱難，謀生尚且困難，談何為朝廷辦鹽呢？所以朱載坖召集重臣們首先討論的就是恤灶的問題，而左都禦史海瑞認為，恤灶莫過於祖宗之法，洪武時期，灶戶生計尚且不錯，所以能夠為朝廷提供足夠的食鹽，而永宣之後，灶戶的生計日益艱難，不僅無法完成朝廷的鹽課，甚至要通過製販私鹽才能夠為生，鹽政由此敗壞。
而恤灶的首要任務就是保證這些灶戶們的蕩地等生產資料，否則的話，灶戶們根本無法為朝廷辦鹽，蕩地主要包括能為灶丁煎鹽提供必要燃料的草蕩地，還包括製鹵所需的亭場、灶房、灘地及儲鹽的倉庫用地，對灶戶的重要性不言而喻。本來按照朝廷定例，這些都是由朝廷掌握的，朝廷將這些土地和生產資料按丁分配。每丁所分的蕩地都有明確的界限和畝數，定為四至，各立封界，不許越界采伐，嚴禁私自買賣和兼並。
而且為了保證灶戶能夠實際控製這些生產資料，從而為朝廷辦鹽，朝廷還製定了嚴密的措施，按照大明初年所製定的辦法：“運司在五年一次清審灶丁的同時，也會對各場草蕩進行核查，其主要目的是保證草蕩能均分到灶丁手中，嚴厲打擊典當、買賣、私吞蕩地。運司官吏踏勘各場草蕩，無論遠近，俱登記在冊。根據蕩地多寡進行分配，蕩多，則每丁多分；蕩少，則每丁少分。著撥於少者，有著發於無者，變通處置，使丁皆有蕩。若有變賣、兼並者，即行處置，務必要追查明白。若有出價典當者，賣地之人所得錢財上繳官府，買地之人將地退還原主，並銷毀典當時所立一切契據。”
但是現在蕩地儘為鹽商之私有，灶戶之生計操弄於鹽商手中，鹽政烏得不敗壞？所以海瑞的建議就是依照大明初年的製度，將這些土地全部收歸國有，然後查實灶戶的數量，重新分配給灶戶用作辦鹽的生產資料，還有各種工具，都要有朝廷提供才行。
除此之外，還要按照朝廷之前的定例，給灶戶工本，洪武年間規定：國家不欲損民，故鹽課給工本。張居正等人也認為“灶戶所承擔的鹽課關係朝廷的經濟命脈，出於優恤之目的，國家在鹽課征收時支給灶戶一定的工本費。”
這些本來都是大明初年所規定好了的，但是現在由於法度廢弛，無法執行，才導致鹽政敗壞，所以海瑞認為隻要能夠恢複洪武舊製，鹽政就能夠得到改善，不是朱載坖顯然沒有這麼樂觀。
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