朱載坖嚴厲的申斥了石星，同時要求兵部和吏部推選合適的人選赴廣西任職，以穩定廣西的局勢，朱載坖很清楚，石星不是能夠率兵平叛的人選，徐渭向朱載坖密疏推薦了李化龍，朱載坖也認為李化龍是知兵之臣，同時在貴州處置土司也算是得力，所以朱載坖親自下旨，任命李化龍為巡撫廣西都禦史同時加南京兵部左侍郎銜，迅速趕赴廣西，將石星調任南京都察院右僉都禦史。
同時朱載坖還在積極準備南巡的事宜，準備在天氣稍微轉暖之後，就和李皇後以及兩位貴妃和公主一道南下南京，朱載坖在準備各種南巡的事務，戶部已經將隆慶二十年的財政決算報表送到了朱載坖的案頭，隆慶二十年財政出現了巨大的赤字。
這點朱載坖是很清楚的，對北虜用兵，同時又要屯墾吉林，同時在國內還有大量的基礎設施營建，對於大明來說，今年出現財政赤字是很正常的事情，朱載坖對此也是早有準備，並沒有感到意外，朱載坖在收到有關奏疏之後，也召見了相關的臣子，商量朝廷明年的用度問題。
對於出現赤字，朱載坖並不擔心，一來是內帑還有部分儲蓄，太倉盈餘十多年，也還是有部分儲蓄的，但是朱載坖真正關心的是各種物資的儲備問題，雖然這麼多年以來朱載坖很重視農田水利工程的營建，大明也修建了大量的農田水利，但是大明這麼大，每年的各種天災人禍仍舊是不少的，尤其是在西北，乾旱是很常見的災害，朝廷每年都要在賑濟上花費不少。
但是朱載坖仍舊認為，賑濟是必須的，通過賑濟，朝廷能夠將百姓安定下來，這點是朱載坖的最為關心的事情，一旦百姓得不到及時的賑濟，就容易產生流民，進而產生流寇，這是朱載坖一直在防範的問題，而閣部重臣們則是勸說朱載坖要節省用度，保證朝廷財政相對健康，今年的用度確實是太大了。
戶部尚書王國光向朱載坖奏報了，朝廷二十年以來，所儲積的盈餘不是二千二百餘萬元，去年一年就超支七百萬，而且廣西的叛亂要用多少年尚且不知，再這麼用下去，朝廷很快就會府庫空虛的，這點朱載坖當然是很清楚的，不過現在朝廷很多事情都是做到了一半，不能輕易放棄，朱載坖也對於王國光加以安慰，要求王國光實心用事，好生理財，同時朱載坖也向重臣們保證明年除了討平廣西的叛亂之外，朱載坖不會主動掀起戰事的。
朱載坖還命令總督倉場戶部尚書兼司農寺卿楊俊民審查朝廷的倉儲事宜，朝廷今年大規模用兵，動支了北直隸和京通倉的倉儲，朱載坖要求楊俊民要想辦法補足倉儲，保證朝廷的儲備，同時不僅僅是北直隸、河南和京通倉，大明全國的倉儲都要進行檢查，在河南、陝西、甘肅等災害頻發的地方，還要專門加強倉儲，以保障朝廷應對各種天災的能力。
不過楊俊民也向朱載坖陳述了自己的看法，大明現在雖然建立起來看似比較完備的倉儲設施，但是在儲備倉庫和倉儲能力的建設上，朝廷一直是偏重於北方的，朱載坖最關注的就是遼東、河北、河南、陝西、甘肅等省份的倉儲，因為這些地方土地貧瘠，糧食產量低，各種水旱災害也非常之頻繁，在這種情況下，朱載坖對於這些省份的物資儲備重視也是很正常的，像遼東則是因為朝廷要用兵，同時接下來要開墾吉林等地的土地，朝廷會大規模移民過去，這都是需要糧食支持的，所以朱載坖在此地囤積了大量的糧秣。
但是楊俊民向朱載坖指出，朝廷在南方各省的儲備不足，尤其是東南南直和浙江，這裡人口稠密，經濟發達，但是朝廷並沒有建立相應的倉儲，而且命令地方官府負責倉儲事宜，而地方官府財力畢竟不足，再加上這些地方的糧食價格不低，地方官府一向不願意多儲備糧食，導致朝廷在這些地方的儲備不足。
楊俊民認為，現在蘇鬆等地已經不是大明的糧食產區了，相反蘇鬆每年還要依賴湖廣等地的所出產的糧食，況且蘇鬆、杭州府等地現在是大明的經濟重心，人口眾多，工場繁盛，每天都需要大量的糧食，而蘇鬆本地所出產的糧食是遠遠不足以供應本地日漸繁盛的人口的，況且蘇鬆每年糧食的種植麵積都在減少，這就使得蘇鬆、杭州府等地的糧食供應更加緊張。
而朝廷在這裡的儲備不足，是極為要命的，一旦這裡的糧食供應出現問題，糧價飛漲，是很容易的激起民變的，所以朝廷要在東南加強儲備，不僅僅是應急之用，還要在平時作為平抑糧價，安定民心之用，楊俊民的話得到了朱載坖的認同，之前朝廷財力不足，而且朱載坖更加擔心北方的流民問題，所以朱載坖所建立倉儲常平體係重點在北方，尤其是在西北和遼東等地，對於蘇鬆的關注不足，這確實是一個問題。
但是現在朝廷的財政已經有所改善了，對於整個南方，尤其是蘇鬆等地的糧食儲備和物價調控確實是要注意了，這點朱載坖也是認同的，蘇鬆等地人口稠密，一旦發生民變可不是開玩笑的，朝廷必須有所準備，朱載坖同意了楊俊民的意見，在南方增加投入，加強儲備，以平抑物價。
朱載坖很清楚，明年的財政肯定也會是赤字，大量的工程營建仍在繼續，朝廷還要在北方支持吉林和河套的屯墾，在廣西平定叛亂，但是朱載坖也給王國光吃了一顆定心丸，朱載坖同意從內帑中調撥一部分錢糧，支應太倉，減輕太倉的負擔，但是朱載坖也明確了自己的態度，各項大型工程等，尤其是道路的營建不能停止，吉林等處的屯墾也要加以支持。
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