時間，在“新芽市”廢墟之上的重建與蟄伏中，悄然流逝。標準曆法翻過了沉重的一頁，幸存者們在這顆傷痕累累的星球上，度過了第一個充滿艱辛與希望的新年。沒有盛大的慶典，隻有簡單的緬懷儀式和更加堅定的工作誓言。
“未來規劃委員會”製定的藍圖，正一點一滴地從圖紙變為現實。
地下深處，規模宏大的避難所網絡已初具雛形，其結構采用了最新的生物複合裝甲技術，堅固且具備一定的自我修複能力，宛如為文明打造的地下堡壘。地表，依托山脈和峽穀修建的隱蔽防禦工事巧妙地和環境融為一體，黑洞洞的炮口隱藏在岩石偽裝之下，隻待一聲令下。
能源危機得到了初步緩解。地熱井鑽探到了更深的富集層，光合生物反應農場的效率在伊娃團隊的努力下提升了30，而那顆遙遠小行星上的超導礦物被命名為“希望晶石”）也開始了小規模、高風險的開采和運輸，其卓越的特性立刻被應用於新一代能量核心的試製中。
最大的變化來自軌道。
“探針號”的殘骸並未被廢棄，其完好的中部艙段被工程團隊奇跡般地修複並改造，安裝上新的引擎來自“遠航者號”的備用引擎）和強大的傳感器陣列，雖然不再具備強大的火力和遠航能力，卻成為了一個功能強大的近地軌道監視與通訊中繼站，被重新命名為“守望者號sentine）”。
而更令人振奮的是，利用回收材料、逆向科技和“希望晶石”，一艘全新的、更小的偵察艦正在船塢中逐漸成型。它被命名為“影梭號soo）”，設計理念極度強調隱蔽性和速度，其外殼覆蓋著最新型的生物複合裝甲和基於伊娃發現的諧波模式開發的“偽裝信號發生器”，旨在執行高風險的情報收集和滲透任務。傑克雖然還未完全康複，但已經迫不及待地開始參與模擬駕駛訓練。
然而，在所有公開的項目之外，委員會還批準了幾個高度機密的“暗影計劃”，由莉莉和伊娃直接負責，知情者寥寥無幾。indhisper）
核心是那塊來自母艦殘骸的綠色晶體。莉莉團隊建立了一個極度屏蔽的能量實驗室，嘗試用各種能量頻率，尤其是精細調製的“創世因子”頻率，去“喚醒”或“解讀”晶體深處可能殘留的信息碎片。
進展緩慢而危險。每一次嘗試都如同在懸崖邊行走。有時隻能得到一些毫無意義的能量噪聲；有時則會引發晶體的劇烈排斥反應，甚至釋放出小範圍的精神汙染，讓研究人員頭痛欲裂，產生幻覺。
但偶爾，也會有驚人的發現。
在一次中等強度的“創世因子”諧振刺激下，晶體再次活躍起來，投射出一段比之前更加清晰的動態影像：
那是一片無法用語言形容的、扭曲的綠色星河，無數類似母艦但形態各異的生物構造物在其中遊弋、彙聚。它們的運動並非雜亂無章，而是遵循著某種深奧的分形幾何規律，仿佛在進行一種永恒的、宏大的集體冥想或信息交換。影像的中央，是一個巨大無比的、如同恒星般的幽綠光團，所有構造物的能量似乎都與之相連，並向其輸送著什麼。
“蜂巢思維……它們的核心可能是一個巨大的集體意識……或者說……一個生物量子計算節點putingnode）？”莉莉看著記錄下的影像，震撼不已，“那個光團……就是它們的‘女王’？或者‘大腦’？”
這個發現至關重要。如果“低語者”的真正核心是這樣一個集體意識，那麼擊敗它們的關鍵，或許不是摧毀多少艦船，而是想辦法乾擾甚至摧毀這個核心節點。這為未來可能的戰略提供了顛覆性的思路。
暗影計劃二：星魂回響projectec）
伊娃團隊則專注於另一個方向：嘗試與沉眠的星球意識重建聯係。她們深知星球意識並未完全消散，隻是陷入了極度的虛弱和封閉。
她們不再試圖進行深層次溝通，而是在全球各個主要能量節點，安裝了極其敏感的能量諧波接收器，日夜不停地記錄星球最細微的能量波動，哪怕隻是地核的正常脈動或板塊的輕微摩擦。
海量的數據被輸入超級計算機進行分析，過濾掉所有自然背景噪音。這是一個枯燥至極的工作，如同大海撈針。
功夫不負有心人。經過數月的積累和分析，他們終於發現了一種極其微弱、卻並非自然產生的規律性脈衝！
這種脈衝非常非常慢，可能幾天甚至幾周才出現一次，強度也低到幾乎無法探測，但其波形卻呈現出一種奇特的、具有智能特征的簡潔美感。
“這……這像是……心跳？”伊娃對比著波形圖，激動得聲音發顫，“非常非常緩慢，非常虛弱……但它在跳！星球意識……它還活著！它正在以我們無法理解的方式，極其緩慢地自我修複！”
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這個消息被嚴格保密，僅限於委員會核心成員知曉。但它帶來了無與倫比的希望。他們守護的，並非一片死寂的土地，而隻是一位陷入漫長沉睡的巨人。他們需要做的，就是守護好這裡，等待或許百年、千年後，它的蘇醒。
暗影計劃三：基因鎖鑰projectgeneock）
這個計劃則更加禁忌，源自索恩博士逐漸恢複後提供的、關於“遠航者號”和舊聯盟的更多信息。他提到，聯盟後期的一些頂尖生物學家曾提出一個理論：“低語者”的生物技術雖然先進，但其基於一種與人類乃至新希望apha生命）截然不同的遺傳編碼體係。這或許是它們的優勢，但也可能是一個潛在的弱點。
如果能找到一種方式，製造出一種針對其獨特遺傳編碼的基因武器genedisruptor）——並非直接殺傷，而是乾擾其生物組件的功能，使其能量循環紊亂、裝甲失去活性、甚至內部共生關係崩潰——或許能在未來戰場上起到奇效。
這個計劃的研究處於最基礎的階段，主要集中在理論推導和從母艦殘骸中提取生物樣本進行測序分析上，但其潛在的戰略價值無法估量。
就在這些“暗影計劃”在絕密中穩步推進時，“影梭號”終於完工下水了。