忠烈祠的公祭大典，在三名“通敵”大員血濺祠外的肅殺氛圍中，最終還是“順利”完成了。崇禎皇帝帶著百官，完成了祭拜英烈的儀式，也用最直接、最殘酷的方式，再次向所有人宣示了他的威權。
典禮結束，返回紫禁城的路上，崇禎坐在禦輦之中，並未立刻返回暖閣，心中卻在思索著另一件事。他想起了之前為了充實董琦的“甲子營”，曾下令從京師大獄中，挑選罪行較輕、尚有勇力的囚犯，赦免其罪，編入軍中。據說，這些亡命之徒在後來的固關血戰中，表現竟異常悍勇，立下了不少功勞。
“京師大獄……”他心中一動，“那裡關押著形形色色的人犯，或許……是該去親自看一看了。”這個念頭一旦升起，便揮之不去。他當即下令，臨時改變行程，前往京師大獄巡視！
京師大獄，位於刑部衙門附近，常年關押著從各地解送來的重刑犯、以及一些在京犯罪的官民。這裡是京城最陰暗、最汙穢的角落之一，常年彌漫著一股潮濕、腐臭、令人作嘔的氣味。
當崇禎皇帝的禦駕，在廠衛和少量京營士兵的護衛下，突然出現在大獄門前時，整個監獄的官吏、獄卒們都驚呆了！他們做夢也沒想到，九五之尊的天子，竟然會親臨這等醃臢之地！一時間，上下慌亂，連忙跪地迎接。
崇禎並未理會這些人的惶恐，在刑部一名聞訊趕來的侍郎和監獄主官的“陪同”下，徑直走入了陰暗的牢區。他皺著眉頭，忍受著撲麵而來的惡臭，目光掃過一間間肮臟的牢房，看著裡麵那些或麻木、或絕望、或帶著仇恨目光的囚犯。
就在他巡視到一處關押老弱病囚的區域時，一間牢房裡，一個須發皆白、身著破爛囚服、看起來卻依稀有幾分書卷氣的老者，突然激動地撲到牢門前，朝著崇禎的方向拚命磕頭，老淚縱橫地哭喊道：“陛下！陛下！草民冤枉啊！草民乃是前朝萬曆年間的舉人，隻因得罪了地方豪強，便被誣陷入獄，已在此暗無天日之地，苦捱了五年了啊！求陛下明察！求陛下為草民伸冤啊！”
他的哭喊聲淒厲而真切，充滿了絕望。
崇禎停下腳步，看向那老者，又轉向旁邊陪同的刑部侍郎，沉聲問道：“此人是何案情？為何喊冤？可曾複核？”
那刑部侍郎臉上閃過一絲慌亂，與旁邊的監獄主官對視一眼，才支支吾吾地回道：“回……回陛下，此……此人乃是因……涉及一樁地方上的謀逆大案，證據確鑿……早已定讞……恐……恐是其年老昏聵，胡言亂語……”他的言辭閃爍，眼神躲閃，顯然是在敷衍。
崇禎何等敏銳？立刻察覺到了其中的不對勁！一個“謀逆大案”的犯人，竟還能活五年？而且看起來並非凶悍之徒？這其中必有蹊蹺！他心中疑竇頓生。
他沒有當場發作，隻是深深地看了那刑部侍郎一眼，隨即不動聲色地對身旁的方正化內廠提督）使了個眼色，用極低的聲音吩咐道：“查！給朕暗中查查此案的卷宗！還有……這整個京師大獄！看看裡麵到底藏了多少貓膩！”
巡查草草結束，崇禎返回皇宮。那老者淒厲的哭喊和刑部官員閃爍的言辭，始終在他腦中揮之不去。他立刻召集了王承恩、曹化淳、方正化，將自己的懷疑告知三人，並嚴令：“東廠、西廠、內行廠！三廠聯動！給朕徹查京師大獄及刑部相關案卷！朕要知道，這裡麵到底有多少冤假錯案！有多少官吏徇私枉法！”
廠衛的效率是驚人的。僅僅過了兩天，一份份令人觸目驚心的調查結果，便擺在了崇禎的禦案之上！
調查結果顯示，京師大獄之中，確實存在著大量的問題！其中最令人發指的，便是由刑部內部兩名掌管囚犯檔案和調撥的官員——主事王方和郎中李可安——長期操控的“調換犯人”的黑色交易！
他們利用職權，收受巨額賄賂，將那些本該被處決或長期監禁的、有錢有勢的罪犯，與一些罪行較輕、甚至是被誣陷入獄的、無權無勢的囚犯進行“調包”！讓真正的罪犯得以用替死鬼的方式逍遙法外，或是大幅減刑！而那些無辜的替罪羊，則要麼枉死在法場之上，要麼便在這暗無天日的牢獄之中，苦熬終生！方才崇禎遇到的那位喊冤老者，極有可能便是這“調換犯人”交易的受害者之一！
更讓崇禎感到震怒的是，密報中還提到，就在他下令革職查辦原刑部尚書徐石麟之後，這王方、李可安二人，唯恐事情敗露、自己受到牽連，竟……竟還試圖威脅、拉攏徐石麟！他們找到徐石麟，暗示徐也曾對他們的“交易”有所耳聞甚至默許，要求徐石麟利用其殘存的影響力，幫助他們掩蓋罪行，否則便要將徐石麟也一同拖下水！
“好！好啊！”崇禎氣得渾身發抖，“爛透了！真是從根子上就爛透了！連掌管國家刑名的刑部，都成了藏汙納垢、官官相護之所！革職查辦都堵不住他們的嘴！還敢威脅攀咬！”
他眼中殺機畢露！原本他還想對徐石麟“停職反省”，看看後續情況再做處置。但現在看來，此人……留不得！而王方、李可安這兩個膽大包天、草菅人命的酷吏，更是死有餘辜！
一場針對刑部內部腐敗網絡的、更加嚴厲的清洗風暴，已然在皇帝的震怒之中，悄然醞釀！
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