建武十八年公元42年壬寅年）
二月，蜀郡的守將史歆造反，攻打太守張穆，張穆翻牆逃走；宕渠的楊偉等人也起兵響應史歆。劉秀派吳漢等率領一萬多人去討伐他們。
甲寅日，劉秀前往長安；三月，到蒲阪，祭祀後土神。
馬援沿著海邊進軍，開山辟路一千多裡，到達浪泊，與征側等人交戰，把他們打得大敗，一直追到禁谿，賊軍於是四處逃散。
夏天，四月甲戌日，劉秀回到宮中。
戊申日，劉秀前往河內；戊子日，回到宮中。
五月，發生旱災。
盧芳從昌平回去後，心裡又疑懼不安，於是再次造反，和閔堪互相攻打了好幾個月，匈奴派幾百名騎兵把盧芳接到塞外。盧芳在匈奴待了十多年後，生病去世。
吳漢征調廣漢、巴、蜀三郡的兵力，圍攻成都一百多天，秋天，七月，攻下成都，斬殺了史歆等人。吳漢接著乘坐木筏順江而下到巴郡，楊偉等人驚慌害怕，紛紛解散。吳漢誅殺了他們的首領，把他們的幾百家黨羽遷徙到南郡、長沙，然後才返回。
冬天，十月庚辰日，劉秀前往宜城；返回途中，祭祀章陵；十二月，回到宮中。
這一年，撤銷州牧，設置刺史。
五宮中郎將線純和太仆朱浮上奏建議：“按照禮法，作為人子，侍奉宗族嫡係大宗，要降低對自己親生父母的尊奉。應當廢除現在的四座親廟，用先帝的四座廟來代替。”大司徒戴涉等人上奏“建立元帝、成帝、哀帝、平帝四座廟”。劉秀認為按照宗廟昭穆的順序，自己應該是元帝的後代。
建武十九年公元43年癸卯年）
春天，正月庚子日，劉秀追尊宣帝為中宗。開始在太廟祭祀昭帝、元帝，在長安祭祀成帝、哀帝、平帝，在章陵祭祀舂陵節侯以下的祖先；在長安和章陵祭祀時，都由當地的太守、縣令、縣長侍奉祭祀。
馬援斬殺了征側和征貳。
妖賊單臣、傅鎮等人聚集起來進入原武城，自稱將軍。劉秀下詔讓太中大夫臧宮帶兵圍攻他們，多次攻打都沒能攻下，還死傷了不少士兵。劉秀召集公卿、諸侯王詢問計策，大家都說：“應該提高懸賞。”隻有東海王劉陽說：“這些妖巫是互相挾持，勢必不能長久，他們當中肯定有後悔想逃跑的，隻是外麵包圍得太緊，跑不掉罷了。應該稍微放鬆包圍，讓他們能夠逃亡，他們一逃亡，一個亭長就足以把他們抓住了。”劉秀覺得他說得對，馬上命令臧宮撤除包圍，放鬆對賊軍的圍困，賊眾果然分散開來。夏天四月，攻下原武城，斬殺了單臣、傅鎮等人。
馬援繼續進擊征側的殘餘黨羽都陽等人，到居風後，都陽等人投降；嶠南地區全部平定。馬援和越人重新申明過去的製度來約束他們，從此以後駱越地區都遵循馬將軍製定的規矩。
閏四月戊申日，劉秀將趙、齊、魯三公的爵位都晉升為王。
郭皇後被廢後，太子劉強心裡很不安。郅惲勸說太子：“你長時間處在容易被猜疑的位置，對上違背孝道，對下接近危險，不如辭去太子之位，去奉養母親。”太子聽從了他的建議，多次通過身邊的人和各位諸侯王，表達自己誠懇的心意，希望能去藩國。劉秀不忍心，猶豫了好幾年。六月戊申日，劉秀下詔說：“按照《春秋》的大義，立太子要立尊貴的兒子。東海王劉陽是皇後的兒子，應該繼承皇位。皇太子劉強，堅守謙遜退讓，希望去藩國，父子之間的感情深厚，實在不忍心違背他的意願太久。就封劉強為東海王，立劉陽為皇太子，改名為劉莊。”
袁宏評論說：設立太子，是為了重視宗族傳承，統一民心，除非太子對天下犯下大錯，否則不應該更換。世祖中興漢朝大業，應該遵循正道，為後世樹立典範。如今太子的品德在外麵並沒有缺失，隻是因為皇帝內宮寵愛的人多了，就更換嫡子的位置，這可以說是失誤。然而東海王回到藩國後，謙恭的心意更加明顯；明帝繼承皇位後，對兄弟的情誼愈發深厚。雖然長幼位置互換，興衰情況不同，但父子兄弟之間，真摯的感情沒有隔閡。用夏商周三代的道德標準來衡量，又有什麼能超過他們的呢！
劉秀任命太子的舅舅陰識代理執金吾，陰興為衛尉，讓他們輔導太子。陰識性格忠厚，在宮裡雖然直言正諫，但和賓客交談時，從來沒提過國家大事。劉秀很敬重他，常常指著陰識來告誡皇親國戚，激勵身邊的人。陰興雖然禮賢下士，喜歡施舍，但家中沒有結交遊俠。他和同郡的張宗、上穀的鮮於裒關係不好，但知道他們有才能，還是稱讚他們的長處並推薦他們做官；他的朋友張汜、杜禽，和他交情深厚，但他認為兩人華而不實，隻是私下給他們錢財，始終不替他們說話。因此世人都稱讚他忠誠。劉秀任命沛國的桓榮為議郎，讓他教授太子經書。劉秀到太學，召集各位博士在麵前辯論經義，桓榮辨析經義明確清晰，每次都用禮義謙讓使人信服，而不是靠言辭冗長壓過彆人，儒者們都比不上他，劉秀特彆給予他賞賜。又下詔讓儒生們唱雅歌、擊磬，一整天才結束。劉秀讓左中郎將汝南人鐘興教授皇太子和宗室諸侯學習《春秋》，賜給鐘興關內侯的爵位。鐘興以自己沒有功勞為由推辭，劉秀說：“你教導太子和諸王侯，這不是大功嗎？”鐘興說：“我的老師是少府丁恭。”於是劉秀又封丁恭，而鐘興堅決推辭不接受。
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陳留人董宣擔任洛陽令。湖陽公主的家奴白天殺了人，因為藏在公主家裡，官吏沒法抓到他。等到公主出門，讓這個家奴陪乘。董宣在夏門亭等候，攔住公主的車，拉住馬韁繩，用刀在地上比畫著，大聲數落公主的過錯。嗬斥家奴下車，接著當場把他打死。公主立刻回宮向劉秀告狀，劉秀大怒，召來董宣，想要用鞭子打死他。董宣磕頭說：“希望讓我說一句話再死。”劉秀問：“你想說什麼？”董宣說：“陛下以聖明的德行中興漢朝，卻放縱家奴殺人，這樣還怎麼治理天下呢？我不需要鞭子打，請讓我自殺！”說完就用頭撞柱子，血流滿麵。劉秀讓小黃門抓住他，讓董宣向公主磕頭謝罪，董宣不聽從。小黃門強行讓他磕頭，董宣兩手撐地，始終不肯低頭。公主說：“文叔你做平民的時候，敢窩藏逃亡犯和死刑犯，官吏都不敢上門；現在當了天子，威嚴竟然不能施加給一個縣令嗎？”劉秀笑著說：“天子和老百姓可不一樣。”於是下令：“硬脖子縣令出去吧。”還賞賜給他三十萬錢，董宣把這些錢全部分給了手下的官吏。從此董宣能夠打擊豪強，京城的人沒有不震動害怕的。
九月壬申日，劉秀前往南陽；又到汝南南頓縣的官舍，擺酒設宴，賞賜給官吏和百姓，免除南頓縣一年的田租。父老們上前磕頭說：“陛下的父親在這裡住了很久，陛下也熟悉這裡的官舍，每次來都給予厚恩，希望能再免除十年田租。”劉秀說：“皇位是天下最貴重的東西，我常常擔心自己承擔不起，過一天算一天，哪敢承諾這麼長遠的十年呢！”官吏和百姓又說：“陛下其實是舍不得，何必這麼謙虛呢！”劉秀大笑，又增加免除一年田租。接著劉秀前往淮陽、梁、沛等地。
西南夷的棟蠶造反，殺死了當地的長官；劉秀下詔讓武威將軍劉尚去討伐。軍隊路過越巂，邛穀王任貴擔心劉尚平定南邊後，會嚴格執行法律，自己不能再肆意妄為，就聚集兵力，修建營地，釀造了很多毒酒，想先犒勞軍隊，趁機襲擊劉尚。劉尚得知他的陰謀，馬上分兵先占據邛都，於是突然襲擊任貴，把他殺了。
評論
建武十八年至十九年，劉秀政權在政治、軍事、宮廷等方麵都經曆了一係列重要事件，展現出政權鞏固過程中的諸多方麵。
軍事上，內部有蜀郡史歆造反，劉秀派吳漢成功平叛，維護了地方穩定；外部馬援在平定交趾征側、征貳之亂中取得重大成果，不僅斬殺叛軍首領，還進一步肅清餘黨，穩定嶠南地區，並通過申明舊製規範當地秩序，彰顯了東漢軍事力量在邊疆地區的有效管控。同時，針對西南夷棟蠶造反，劉秀也及時派劉尚前往征討，反映出對各地叛亂的積極應對。
政治製度方麵，這一時期進行了州牧與刺史的製度調整，體現了劉秀對地方行政製度的探索與完善，旨在更好地管理地方事務。
宮廷事務上，太子的廢立是一大焦點。劉秀因郭皇後失寵，最終廢後並改立太子，雖引發一些爭議，但從後續發展看，各方關係處理相對得當，太子劉強與新太子劉莊在身份轉變後，都展現出良好品德，維持了皇室內部的和諧。劉秀對太子的教育頗為重視，選拔如陰識、陰興、桓榮、鐘興等品德與才學兼備之人輔導太子，為未來皇位傳承培養人才。
社會治理層麵，董宣擔任洛陽令時，不畏權貴，敢於當街斬殺湖陽公主家奴，體現了法律的公正執行，儘管引發了一些衝突，但劉秀最終認可董宣做法，反映出劉秀政權對公正執法的支持，有利於樹立政府權威，穩定社會秩序。而劉秀在巡遊過程中，與地方百姓互動，對南頓縣田租的處置，既體現出皇帝對百姓的關懷，也在一定程度上展示了統治策略，平衡國家稅收與百姓訴求。
總之，這兩年劉秀政權在各方麵積極作為，不斷鞏固統治基礎，推動國家走向穩定發展。
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