他身邊幾位高能物理組的研究員也紛紛附和：
“劉院士說得對，我們的希格斯粒子性質研究也受到了影響。”
“是啊，‘神威’的架構本來就更適合我們這種大規模數值計算，生物信息學的很多算法在上麵跑，優化起來事倍功半，何必呢？”
“他們這是吃著碗裡的，看著鍋裡的。有了定製大餐，還來搶我們的工作餐，太過分了！”
會議室裡的目光都聚焦在科技部協調員和超算中心負責人身上。
負責人麵露難色，看向協調員。
協調員是一位沉穩的中年人，他清了清嗓子，開口道：“劉院士，各位專家，請息怒。”
“情況是這樣的。首先，國家特批給繁縷研究院使用‘神威’，是在‘方舟’建成之前，為了搶抓科研機遇窗口期，避免因計算瓶頸導致重大科研成果流失的緊急舉措。這一點，是經過最高層麵權衡的。”
他頓了頓，繼續解釋：“其次，關於‘方舟’建成後是否還需要‘神威’的問題。根據我們與陸時羨院士團隊的溝通和評估，主要有兩個考量。”
“第一，‘方舟’是生物專用超算，其架構針對生命科學的多模態、非結構化數據和高通量動態模擬進行了深度定製。”
“但在一些基礎的、大規模的通用科學計算任務上，‘神威’經過多年優化，其穩定性和效率在短期內仍然是不可替代的。兩者是互補，而非替代關係。”
“第二，也是更關鍵的一點，‘方舟’一期工程預計需要至少1214個月才能交付使用。而科學研究，尤其是競爭如此激烈的領域，等不起這整整一年。”
“陸院士團隊目前在‘神威’上進行的，正是基於他們最新發現、最可能產生突破的關鍵驗證性計算。如果現在中斷，不僅前功儘棄，也可能錯失良機。”
劉院士的臉色並沒有因此緩和，他追問道：“那總有個時限吧？不能無限期地讓他們獨占優質資源！我們的項目就不是國家項目了嗎？”
協調員點了點頭：“這一點請放心。特批是有時限的。我們與繁縷研究院有明確的約定，在‘方舟’一期原型係統交付並穩定運行之後，他們在‘神威’上的獨占性高優先級權限將自動解除，轉為常規排隊。這個時間點，預計在十個月之後。同時，我們也在積極協調，為受影響的各組爭取在其他國家級超算中心補償計算資源，儘力減少大家的損失。”
聽到有明確的退出機製和補償方案，會議室裡的不滿情緒稍微平息了一些。但劉院士依舊歎了口氣，語氣複雜：
“我不是不支持交叉學科，也不是不認可陸院士的成就。隻是……這種資源傾斜的力度，在我幾十年的科研生涯中，實屬罕見。希望他們真的能拿出配得上這份投入的成果，否則，難以服眾啊。”
消息傳到繁縷研究院，陸時羨隻是淡淡地對羅伯特教授說：“聽到了嗎？羅伯特。我們不僅是在和國際同行賽跑，也是在和國家內部的其他重要領域賽跑，在用掉本該屬於他們的資源。我們拿出的成果，必須十倍、百倍於我們消耗的這些算力，才能對得起這份壓力和期待。”
羅伯特教授聞言，神色也凝重了許多，他望向機房的方向，喃喃道：“我現在感覺，這些計算周期，每一個都重若千鈞。”
攻關小組的成員們幾乎住在了機房，靠著濃咖啡和一股不服輸的勁頭，一個又一個地攻克技術難關。
陸時羨雖然沒有親自編寫每一行代碼，但他始終坐鎮指揮。
他對計算機科學的了解的確沒有其他學科深入，但擁有的深厚交叉學科背景，能夠幫助團隊理解生物學問題的本質，確保計算優化的方向始終服務於最終的科學目標，而不是陷入純粹追求計算性能的誤區。
比如他會指著某個模擬結果問：“這個構象的能壘是否合理？”或者看著網絡模型的輸出說：“這個節點的連接度異常偏高，是需要優化的計算偽影，還是它真的提示了一個我們忽略的生物學關鍵點？”
辛勤的汗水終於換來了回報。
當經過深度優化的程序開始在“神威”上穩定運行，海量的計算任務以前所未有的速度完成時，驚喜開始不斷湧現。
第一個發現是sfr1的“雙麵人格”。
在之前基於“鴻蒙”的、時間尺度較短的模擬中，sfr1被認為主要與激活狀態的gpcr相互作用。
但在“神威”上進行的、長達微秒級的高精度分子動力學模擬中，團隊驚訝地發現，sfr1的某個特定結構域，在特定的膜脂環境和小分子配體，可能是細胞內未知的第二信使存在的條件下，會表現出一種奇特的“雙麵性”。
即它既能與激活態的gpcr結合，也能以一種不同的構象，與某些處於“預備”或“失活”狀態的gpcr發生弱相互作用。
“這暗示sfr1可能不僅僅是一個被動的‘連接器’，它本身可能參與了對gpcr狀態的‘感知’和‘選擇’，就像一個智能開關，能判斷哪些信號值得放大和傳遞。”羅伯特教授看到這個結果時，激動地指著屏幕上的動態軌跡說道。ain”的潛在功能。
埃琳娜團隊提供的更高分辨率的冷凍電鏡結構，結合“神威”上運行的、更複雜的柔性擬合和分子動力學模擬，為那個功能未知的“孤兒doain”提供了全新的線索。ain並非剛性結構，而是一個高度動態的、富含帶電氨基酸的“觸手”。在模擬中，它表現出與多種不同snare蛋白組分相互作用的傾向，但其結合強度和特異性，似乎受到sfr1其他區域構象的變構調控。
當sfr1與gpcr結合後，這個‘觸手’的構象熵明顯降低了，變得更加有序，這很可能增強了它與特定snare蛋白的結合能力！
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