張煌言立即著手肅清湖域。他將龐大的艦隊化整為零，以威力強大的“武昌級”戰艦為核心，配屬若乾機動靈活的小型炮艇和運載陸戰隊的運兵船，組成數個具備獨立作戰能力的特混編隊，分片包乾，對湖域進行拉網式清理。
君山島，作為洞庭湖中最大的島嶼，山勢險峻，林木蔥鬱，易守難攻，盤踞著一股實力頗為強勁的水匪，其頭領凶悍，號稱“翻江龍”，已被清廷招安，賜予官職。張煌言親率“定遠號”及兩支精銳編隊前來清剿。
“翻江龍”自恃熟悉湖中每一處暗流淺灘，船小靈活，企圖利用縱橫交錯的蘆葦蕩和複雜水道與龐大的華夏艦隊周旋，打一場遊擊戰。
然而，他嚴重低估了驚濤營肅清湖區的決心和所擁有的壓倒性火力。
張煌言洞悉其意圖，並不派兵貿然進入危機四伏的蘆葦蕩深處。
他果斷命令隨行的炮艇在外圍水域一字排開，用猛烈的炮火對蘆葦蕩進行覆蓋性轟擊，炮彈呼嘯著炸開，將大片大片的蘆葦攔腰炸斷，清除可能的藏身伏擊點。
同時，派出裝備精良線膛槍的陸戰隊精銳，乘坐堅固的小艇，在炮火的有力掩護下，強行搶灘登陸，迅速搶占灘頭有利地形，建立穩固的前進陣地，向島內步步為營推進。
“定遠號”則利用其高大的船體和射程驚人的重炮，對島上匪巢的核心區域進行持續而精確的打擊，將匪徒的巢穴和工事一一摧毀。
匪徒的弓箭和落後的土炮在專業海軍強大炮火麵前，如同螳臂當車，毫無還手之力。一場激烈而短促的戰鬥後，“翻江龍”在頑抗中被擊斃，餘眾或死或降，君山島宣告光複。
在清理湖西沅江入口時，一股清軍殘部憑借兩岸高地上的堅固炮台和橫亙江麵的粗大鐵索，負隅頑抗，企圖封鎖航道。
負責此區域的編隊指揮是一名從武昌軍校畢業的年輕軍官，名叫陳永澤。
他觀察戰場後發現，清軍炮台因射角限製，存在火力盲區，且那看似不可逾越的鐵索，其與岸邊固定的連接點並非堅不可摧。
他精心挑選了數十名水性極佳、膽大心細的士兵，攜帶炸藥包，趁夜色掩護潛泳過去，成功將炸藥安置在一處關鍵連接點並引爆。
隨著一聲巨響，一段沉重的鐵索轟然墜入江中。
隨後，他派出幾艘吃水最淺、速度最快的快船，冒著岸上殘餘炮火的威脅，從炸開的缺口處如離弦之箭般衝入沅江。
這些快船目標明確，並不與兩岸炮台過多糾纏，而是直撲清軍後方的小型碼頭和囤積糧草的倉庫，製造混亂。清軍腹背受敵，又見賴以憑恃的鐵索已破，後路堪憂，軍心登時大亂。
陳永澤抓住這稍縱即逝的戰機，果斷指揮主力艦隊發起全麵總攻。驚濤營戰艦集中火力摧毀炮台，陸戰隊迅速登陸肅清殘敵，沅江航道宣告打通。
在驚濤營水師強大的武力震懾和靈活多變的戰術打擊下，洞庭湖內外的抵抗力量被迅速肅清。
浩渺的湖麵重現安寧，航道暢通無阻，成為了華夏護國軍運輸兵員和物資的黃金水道，其效率遠勝陸路。
就在張煌言橫掃洞庭的同時，李定國率領的龍虎營在陸地上也高歌猛進，勢如破竹。
攻克軍事重鎮嶽州後，李定國審時度勢，兵分兩路：
一路由麾下驍勇善戰的大將馬寶率領，沿湘江南下，直搗湖南腹心之地長沙；
一路則由他親自指揮，揮師向西，掃蕩洞庭湖以南的常德、益陽等戰略要地。
水陸兩軍的緊密配合，此刻顯現出巨大的威力，相輔相成。
當馬寶部兵臨長沙城下，展開猛烈圍攻時，守城的清軍將領還寄希望於來自洞庭湖方向的水路援軍和糧草補給。
然而，他們翹首以盼等來的，卻是張煌言的驚濤營艦隊突然出現在湘江口，以強大艦炮徹底封鎖了江麵，切斷了長沙與北麵的一切聯係。
更令守軍絕望的是，艦隊上的重炮開始轟擊長沙北門城樓和城牆，炮彈呼嘯著落入城中，極大地支援了陸軍的攻城行動。
而當李定國親率主力進攻常德堅城時，張煌言派出的龐大運輸船隊，
滿載著攻城急需的火炮、彈藥和糧秣給養，溯沅江而上，直接運抵常德城下的碼頭，使得龍虎營的攻勢得以持續不斷，大大加快了攻城的進度。
龍虎營的士兵們甚至能吃到從武昌經水路快速運抵的新鮮魚蝦，後勤保障的充足讓前線將士士氣愈發高昂。
在水師強大而有力的支援下，龍虎營陸師如虎添翼，勢如破竹：
長沙守軍在內外交困、孤立無援的絕境下，堅守半月，最終糧儘援絕，無奈開城投降。
常德、益陽等湘北重鎮相繼被克複，守軍土崩瓦解。
湘南各地的清軍守備部隊及原明朝降軍，見大勢已去，或望風歸附，或稍作抵抗便一觸即潰。
至當年秋末，湖南全境基本平定（除西部少數偏遠苗疆土司地區，因其特殊情勢，尚需時間以政治手段進行招撫安撫）。
李定國與張煌言在收複後的長沙城下勝利會師。
站在奔流不息的湘江岸邊，李定國看著江麵上桅杆如林、旌旗蔽日、軍容鼎盛的驚濤營艦隊，再看看身後甲胄鮮明、刀槍閃亮、紀律嚴明的龍虎營將士，不禁感慨萬千。
他鄭重地向張煌言拱手道：“蒼水先生，若無貴水師鼎力相助，切斷糧道，封鎖江河，輸送軍資，炮擊堅城，我龍虎營平定三湘，斷無如此順利迅速！水師之功，當居首功！”
張煌言亦肅然回禮，謙遜而堅定地微笑道：“晉王過譽了！您運籌帷幄，陸師將士奮勇當先，方是克定全湘之根本。煌言不過儘了水師本分，協同作戰而已。
如今三湘已定，後方穩固，糧道暢通，我軍根基已牢。接下來，該是劍指江東，飲馬長江，光複舊都之時了！”
洞庭波撼，三湘底定。
這場漂亮的水陸協同作戰，不僅徹底解除了華夏護國軍南翼的巨大威脅，獲得了豐腴的湖南作為堅實的戰略基地和糧倉，
更極大地鍛煉和磨合了水陸兩軍的協同作戰能力，積累了寶貴的聯合作戰經驗。
這為後續更大規模的東征金陵和揮師北伐，奠定了極其堅實的基礎。湖南的平定，標誌著華夏護國軍已經從戰略防禦，全麵轉入了氣勢磅礴的戰略反攻新階段！