《金匱要略》這本書，由於年代久遠，存在不少缺漏和錯誤，和《傷寒論》的情況類似。比如其中“漀飥”的“漀”字，以及“緩中補虛用大黃?蟲丸主之”這類表述，都不能當作規範的內容。於是對其進行仔細考量，采用了諸如改易、移動、刪除、補充等方式進行修訂。至於存疑的二十八條內容，全部仿照《傷寒論》的順序進行編排。
臟腑經絡先後第一
師曰：病人語聲寂然，喜驚呼者，骨節間病；語聲喑喑然，不徹者，心膈間病；語聲啾啾然，細而長者，「頭」腹）中病。
【按語】此處提到“頭中病”裡的“頭”字，應當是“腹”字。因為經典著作中從來沒有“頭中病”這樣的表述，而且從上下文的文義來看也不連貫，所以應當把“頭”字改成“腹”字。
師曰：吸而微數，其病在中焦，實也，當下之即愈，虛者不治。在上焦者，其吸「促」遠）；在下焦者，其吸「遠」促），此皆難治。呼吸動搖振振者，不治。
【按語】這裡所說“吸促”的“促”字，應該是“遠”字；而“吸遠”的“遠”字，應該是“促”字。這樣改動後才符合病症的含義，應當對這兩個字進行調換。
問曰：「寸脈沉大而滑，沉則為實，滑則為氣，實氣相摶，」「血」厥）氣入臟即死，入腑即愈，此為卒厥，何謂也？師曰：唇口青，身冷，為入臟，即死；如身和，汗自出，為入腑，即愈。
【按語】“寸脈沉大而滑，沉則為實，滑則為氣，實氣相摶”這十八個字，文辭條理不通順，屬於多出來的文字，應當刪去。“血氣入臟”中的“血”字，應當是“厥”字，這樣才與“卒厥”的病症相契合，應當加以改正。
問曰：陽病十八，何謂也？師曰：頭痛，項、腰、脊、臂、腳掣痛。陰病十八，何謂也？師曰：欬，上氣，喘，噦，咽，腸鳴，脹滿，心痛，拘急。五臟病各有十八，合為九十病；人又有六微，微有十八病，合為一百八病。五勞、七傷、六極，婦人三十六病，不在其中。清邪居上，濁邪居下，大邪中表，小邪中裡，「?」漀）飥之邪，從口入者，宿食也。五邪中人，各有法度，風中於前，寒中於暮，濕傷於下，霧傷於上，風令脈浮，寒令脈急，霧傷皮腠，濕流關節，食傷脾胃，極寒傷經，極熱傷絡。
【按語】在字典中沒有“?”這個字，此處應當是“漀”字。“漀”讀音為“傾”，意思是側水。後麵積聚門中，“?氣”的“?”字，同樣也是用錯了。
問曰：病有急當救裡救表者，何謂也？師曰：病，醫下之，續得下利清穀不止，身體疼痛者，急當救裡；後身體疼痛，清便自調者，急當救表也。
【按語】關於這一條的注釋，在《傷寒論·太陰篇》裡已有詳儘說明，所以在此不再重複解釋。
夫諸病在臟，欲攻之，當隨其所得而攻之，如渴者小便不利，與豬苓湯，餘皆仿此。
【按語】在“如渴者”之後，應當有“小便不利”這四個字，必定是在流傳過程中有所遺失，應當補上這四個字。
痙濕暍第二
病者，身熱足寒，頸項強急，惡寒，時頭熱，麵赤，目赤，獨頭動搖，卒口噤，背反張者，痙病也。「若發其汗者，寒濕相摶，其表益虛，即惡寒甚，發其汗已，其脈如蛇」。
【按語】“痙病也”之後的各句話，與上文的文意不連貫。而後文“為欲解，脈如故”等語句，與這些話文意連貫，所以“痙病也”之後的這些句子應該劃分到後麵那條內容裡。
太陽病，發熱無汗，「反」惡寒者，名曰剛痙。
【按語】“反惡寒”中的“反”字，是多餘的文字。研讀痙病相關的條文就能明白，本來就應當惡寒，所以這個“反”字應該刪掉。
若發其汗者，寒濕相摶，其表益虛，即惡寒甚，發其汗已，其脈如蛇，「暴腹脹大者，」為欲解，脈如故，反伏弦者，痙。
【按語】“暴腹脹大者”這五個字，屬於多餘的文字，應當刪去。
瘧病第四
師曰：瘧脈自弦，弦數者多熱，弦遲者多寒，弦「小」沉）緊者下之瘥，弦遲者可溫之，弦浮）緊者，可發汗針灸也，弦「浮」滑）大者，可吐之，弦數者，風發也，以飲食消息止之。
【按語】“弦小緊者”中的“小”字，應當是“沉”字，這樣才具備可以用攻下之法的醫理。“弦緊者”，應當是“弦浮緊”，如此便有能夠用發汗之法的依據。“弦浮大者”，應當是“弦滑大”，才有可以用湧吐之法的道理。而且這樣修改補充後，也不會遺漏原文“瘧脈自弦”所表達的含義，所以應當對這些文字進行改正和補充。
師曰：陰氣孤絕，陽氣獨發，則熱而少氣煩冤，手足熱而欲嘔，名曰癉瘧；若但熱不寒者，邪氣內藏於心，外舍分肉之間，令人消鑠肌肉。
【按語】這裡講的是癉瘧，相關文字有脫漏簡略之處，《內經》中對此已有詳細闡述，所以在此不再另行解釋。
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溫瘧者，其脈如平，身無寒，但熱，骨節疼煩，時嘔，白虎加桂枝湯主之。
【按語】此處論述的是溫瘧，這段文字存在脫漏簡略的情況，《黃帝內經》裡已經有詳儘的解說，故而在此不再重複闡釋。
瘧多寒者，名曰牝瘧，蜀漆散主之。