元興二年癸卯年，也就是公元403年。
這年春天正月，盧循派司馬徐道覆去攻打東陽。到了二月辛醜這天，建武將軍劉裕打敗了徐道覆，而徐道覆是盧循的姐夫。
乙卯這天，朝廷任命太尉桓玄為大將軍。
丁巳這天，桓玄殺了冀州刺史孫無終。
桓玄上奏章請求率領各路軍隊平定關、洛地區，接著又暗示朝廷下詔書不同意，然後就說：“遵奉詔書所以停止行動。”桓玄起初想要整理行裝，先命令製作輕便的船，用來裝載服飾玩物、書法繪畫。有人問他原因，桓玄說：“打仗凶險，萬一有意外，應當讓這些東西容易搬運。”大家都嘲笑他。
夏天四月癸巳初一，發生了日食。
南燕君主慕容備德過去的官吏趙融從長安來，他才得知母親和哥哥的死訊，慕容備德痛哭得吐了血，因此臥病在床。
司隸校尉慕容達謀反，派牙門皇璯率領部眾攻打端門，殿中帥侯赤眉打開城門接應他們。中黃門孫進攙扶著慕容備德翻牆逃出，藏在孫進的住處。段宏等人聽說宮中有變故，率領軍隊駐守在四個城門。慕容備德回到宮中，誅殺了侯赤眉等人。慕容達出逃到北魏。
慕容備德優待遷徙來的百姓，讓他們長期免除徭役。百姓因此互相包庇隱瞞，有的上百戶合為一戶，有的上千個壯丁共在一個戶籍上，以此逃避賦稅徭役。尚書韓訁卓請求加以核查，慕容備德聽從了他的建議，派韓訁卓巡視各郡縣，查出被隱瞞的戶口五萬八千戶。
泰山的賊寇王始聚集了幾萬人，自稱太平皇帝，設置了公卿等官職。南燕桂林王慕容鎮討伐並擒獲了他。臨刑的時候，有人問他的父親和兄弟在哪裡，王始說：“太上皇在外流亡，征東將軍、征西將軍被亂兵殺害。”他的妻子生氣地說：“你正是因為這張嘴才獲罪，怎麼還這樣說！”王始說：“皇後不知道，自古以來哪有不滅亡的國家！我就要死了，但國號永遠不改！”
五月，後燕王熙修建龍騰苑，方圓十多裡，服役的徒役有兩萬人。在苑內修築景雲山，地基寬五百步，山峰高十七丈。
秋天七月戊子這天，北魏君主拓跋珪到北方巡視，在豺山建造離宮。
平原太守和跋奢侈豪強，喜歡名聲，拓跋珪厭惡他，殺了他，讓他的弟弟和毗等人去和他訣彆。和跋說：“北方土地貧瘠，可以遷到黃河以南，努力治理生計。”並且讓他們背對著自己，說：“你們怎麼忍心看著我死呢！”和毗等人明白了他的意思，假裝成使者，逃到了後秦。拓跋珪發怒，誅滅了和跋的家族。中壘將軍鄧淵的堂弟尚書鄧暉和和跋關係好，有人向拓跋珪誣陷說：“和毗出逃，實際上是鄧暉送他走的。”拓跋珪懷疑鄧淵知道他們的陰謀，賜鄧淵死。
南涼王禿發傉檀和沮渠蒙遜互相出兵攻打呂隆，呂隆對此很擔憂。後秦的謀臣對秦王姚興說：“呂隆憑借先代的基業，在黃河以西獨斷專行，現在雖然饑餓困窘，還能自我支撐，如果將來物資豐富，最終不會歸我們所有。涼州地勢險要，土地肥沃，不如趁著他處境危急奪取它。”姚興於是派使者征召呂超入朝侍奉。呂隆考慮到姑臧最終無法保全自己，就通過呂超請求歸降後秦。姚興派尚書左仆射齊難、鎮西將軍姚詰、左王乞伏乾歸、鎮遠將軍趙曜率領步兵騎兵四萬人到河西迎接呂隆，南涼王禿發傉檀撤出昌鬆、魏安兩個戍所來避讓他們。八月，齊難等人到達姑臧，呂隆乘著素車白馬在路邊迎接。呂隆勸說齊難攻打沮渠蒙遜，沮渠蒙遜派臧莫孩抵抗，打敗了齊難的前軍。齊難於是和沮渠蒙遜結盟，沮渠蒙遜派弟弟沮渠挐到後秦進貢。齊難讓司馬王尚代理涼州刺史，調配三千士兵鎮守姑臧，任命將軍閻鬆為倉鬆太守，郭將為番禾太守，分彆戍守兩個城池，把呂隆的宗族、僚屬以及一萬戶百姓遷到長安，姚興任命呂隆為散騎常侍，呂超為安定太守，其餘的文武官員都根據才能提拔任用。
當初，郭黴常常說“取代呂氏的是王氏”，所以他起兵時，先推舉王詳，後來推舉王乞基。等到呂隆向東遷徙，最終王尚取代了呂氏。郭黴跟隨乞伏乾歸投降後秦，又認為消滅後秦的是晉朝，於是就逃奔晉朝，後秦人追上並殺了他。
沮渠蒙遜的伯父中田護軍沮渠親信、臨鬆太守沮渠孔篤，都驕橫放縱，成為百姓的禍患。沮渠蒙遜說：“擾亂我的法令的，是這兩個伯父。”逼迫他們自殺了。
後秦派使者梁構到張掖，沮渠蒙遜問：“禿發傉檀是公爵，而我是侯爵，為什麼呢？”梁構說：“禿發傉檀凶惡狡猾，忠誠的心意還不明顯，所以朝廷用高貴的爵位和虛假的名聲籠絡他。將軍的忠誠可以像太陽一樣光明，應當入朝輔佐皇室，怎麼會用不誠信的態度對待你呢！聖朝的爵位一定和功勞相稱，比如尹緯、姚晃，是輔佐帝王創業的大臣，齊難、徐洛，是一時的猛將，爵位都不過是侯伯，將軍憑什麼要在他們之前呢！過去竇融懇切地堅決辭讓，不願意位居舊臣之上，沒想到將軍忽然有這樣的疑問！”沮渠蒙遜說：“朝廷為什麼不就近封我張掖，卻要遠封西海呢？”梁構說：“張掖，將軍已經自己占有了，之所以遠遠地授予你西海，是想擴大將軍的封國啊。”沮渠蒙遜很高興，就接受了任命。
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荊州刺史桓偉去世，大將軍桓玄讓桓修代替他。從事中郎曹靖之勸桓玄說：“桓謙、桓修兄弟獨自占據朝廷內外的要職，權勢太重了。”桓玄於是任命南郡相桓石康為荊州刺史。桓石康是桓豁的兒子。
劉裕在永嘉打敗盧循，追到晉安，多次打敗他，盧循乘船向南逃走。
何無忌暗中到劉裕那裡，勸劉裕在山陰起兵討伐桓玄。劉裕和當地土豪孔靖商量，孔靖說：“山陰距離京都路途遙遠，起兵難以成功；而且桓玄還沒有篡位，不如等他篡位後，在京口圖謀他。”劉裕聽從了他的建議，孔靖是孔愉的孫子。
九月，北魏君主拓跋珪前往南平城，規劃南方，將要修建新都。
侍中殷仲文、散騎常侍卞範之勸大將軍桓玄早點接受禪讓，暗中撰寫九錫文和冊命。任命桓謙為侍中、開府、錄尚書事，王謐為中書監、領司徒，桓胤為中書令，加授桓修撫軍大將軍。桓胤是桓衝的孫子。丙子這天，冊命桓玄為相國，總領百官，封給他十個郡，為楚王，加授九錫，楚國設置丞相以下的官職。
桓謙私下問彭城內史劉裕說：“楚王功勳德行盛大，朝廷的意思，都認為應當舉行禪讓，你認為怎麼樣？”劉裕說：“楚王是宣武公的兒子，功勳德行超過世人。晉朝皇室衰弱，百姓的期望早已轉移，趁著運勢禪讓取代，有什麼不可以的？”桓謙高興地說：“你說可以就可以了。”
新野人庾仄，是殷仲堪的同黨，聽說桓偉死了，桓石康還沒到任，就起兵在襄陽襲擊雍州刺史馮該，趕跑了他。庾仄有部眾七千人，設置祭壇，祭祀七廟，說要討伐桓玄，江陵震動。桓石康到了荊州，發兵攻打襄陽，庾仄失敗，逃到後秦。
高雅之上表南燕君主慕容備德，請求討伐桓玄，說：“即使不能平定吳、會地區，也可以收複長江以北的土地。”中書侍郎韓範也上奏疏說：“現在晉朝皇室衰敗混亂，長江、淮河南北地區，戶口沒多少，軍隊弱小。加上桓玄叛逆，上下離心離德。憑陛下的神威勇武，出動一萬步兵騎兵進逼他們，他們一定會土崩瓦解，軍隊不用停留就能前進。奪取並占有那些地方，後秦、北魏都不值得對抗了。開拓疆土成就功業，正在今天。錯過時機不奪取，要是他們的豪傑誅殺了桓玄，再修治德政，豈止是建康得不到，長江以北也沒希望了。”慕容備德說：“我因為舊國滅亡，想要先平定中原，再掃蕩荊、揚地區，所以沒有向南征伐。還是讓公卿們商議一下這件事吧。”於是在城西講習武事，有步兵三十七萬人，騎兵五萬三千匹，戰車一萬七千輛。公卿們都認為桓玄剛剛得勢，不能圖謀，於是就停止了。
冬天十月，楚王桓玄上奏章請求回到封地，卻讓皇帝親手寫詔書堅決挽留他。他又謊稱錢塘的臨平湖開通了，江州降下了甘露，讓百官聚集道賀，把這些當作自己接受天命的征兆。另外，因為前代都有隱士，他覺得自己所處的時代沒有隱士是件羞恥的事，就找到西晉隱士安定人皇甫謐的第六世孫皇甫希之，供給他費用，讓他隱居在山林裡；接著征召皇甫希之做著作郎，又讓他堅決推辭不接受，然後下詔書表彰禮遇他，稱他為“高士”。當時的人都稱皇甫希之為“充隱”意思是冒充的隱士）。桓玄還想廢除錢幣，改用穀物、布帛交易，並且恢複肉刑，各種製度變更層出不窮，他的想法沒個定準，改來改去，最終也沒實行成。他本性又貪婪鄙陋，要是有人有好的書法、繪畫作品以及好的宅院，他必定會通過賭博的方式把這些弄到手；他尤其喜愛珍珠寶玉，從來不離手。
乙卯這天，北魏君主拓跋珪立他的兒子拓跋嗣為齊王，加授相國之位；立拓跋紹為清河王，加授征南大將軍；立拓跋熙為陽平王；立拓跋曜為河南王。
丁巳這天，北魏將軍伊謂率領兩萬騎兵襲擊高車殘餘部落袁紇、烏頻；十一月庚午這天，把他們打得大敗。
朝廷下詔讓楚王桓玄使用天子的禮樂，他的妃子成為王後，世子成為太子。丁醜這天，卞範之寫好了禪讓的詔書，讓臨川王司馬寶逼迫皇帝抄寫。司馬寶是司馬曦的曾孫。庚辰這天，皇帝親臨前殿，派兼太保、領司徒王謐捧著玉璽綬帶，把皇位禪讓給楚國。壬午這天，皇帝搬出皇宮住在永安宮。癸未這天，把太廟的神主遷到琅邪國，穆章何皇後和琅邪王司馬德文都遷居到司徒府。百官到姑孰勸桓玄登基。十二月庚寅初一，桓玄在九井山北修築祭壇，壬辰這天，登上皇帝位。冊文中有很多貶低晉朝皇室的話，有人勸他彆這樣，桓玄說：“禪讓的文告，不過是講給百姓聽的，怎麼能欺騙上天呢！”他宣布大赦，改年號為永始。把南康郡的平固縣封給退位的皇帝，稱平固王；把何皇後降為零陵縣君；琅邪王司馬德文降為石陽縣公；武陵王司馬遵降為彭澤縣侯。追尊桓溫為宣武皇帝，廟號太祖，南康公主為宣皇後，封兒子桓昺為豫章王。任命會稽內史王愉為尚書仆射，王愉的兒子相國左長史王綏為中書令。王綏是桓氏的外甥。戊戌這天，桓玄進入建康皇宮，登上皇帝寶座，可寶座突然塌陷，大臣們都嚇得變了臉色。殷仲文說：“這是因為陛下的聖德太深厚，大地都承載不住了。”桓玄聽了特彆高興。梁王司馬珍之的屬臣孔樸護送司馬珍之逃到壽陽。司馬珍之是司馬曦的曾孫。
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戊申這天，後燕王熙尊奉後燕主慕容垂的貴嬪段氏為皇太後。段氏是王熙的養母。己酉這天，立苻貴嬪為皇後，宣布大赦。
辛亥這天，桓玄把退位的皇帝遷到尋陽。
後燕任命衛尉悅真為青州刺史，鎮守新城；任命光祿大夫衛駒為並州刺史，鎮守凡城。
癸醜這天，桓玄把桓溫的神主送入太廟。他親自到聽訟觀審查囚犯，無論罪行輕重，大多都被赦免釋放；有攔著車馬乞討的人，他有時也會體恤施舍。他就是這樣喜歡施行小恩小惠。
這一年，北魏君主拓跋珪開始命令有關部門製作官員的冠服，按照官階品級區分等級。但當時製度剛剛創立，很多都不遵循古代的規製。
元興三年甲辰年，也就是公元404年。
春天正月，桓玄立他的妻子劉氏為皇後。劉氏是劉喬的曾孫女。桓玄因為他的祖父桓彝以上祖先的名位不夠顯赫，就不再追尊他們並建立祖廟。散騎常侍徐廣說：“尊敬父親，兒子就會高興，請按照舊例建立七廟。”桓玄說：“按照禮儀，太祖的牌位麵朝東，左邊是昭，右邊是穆。晉朝建立七廟，宣帝卻不能處在正東的位置，有什麼值得效仿的！”秘書監卞承之對徐廣說：“如果宗廟祭祀真的連祖先都顧及不到，就可以知道楚國的國運不會長久了。”徐廣是徐邈的弟弟。
桓玄自從登上帝位後，心裡常常不安。二月己醜初一，夜裡，濤水湧入石頭城，淹死了很多人，喧嘩聲震天動地。桓玄聽到後，害怕地說：“奴才們要造反了！”
桓玄性情苛刻瑣碎，喜歡自誇。官員上奏事情，有時有一個字不規範，有時有一句話說錯了，他必定會加以指責，以此顯示自己聰明。尚書回答詔書時誤把“春蒷”寫成“春菟”，從左丞王納之往下，凡是參與簽署的官員，都被降職罷免。他有時親手批注任免官吏，有時自己任用令史，詔令繁多雜亂，官員們忙著應付答複都來不及，而朝廷的法度卻混亂不堪，奏章案卷堆積如山，他也不管。他又喜歡出遊打獵，有時一天出去好幾次。他遷居到東宮，又修繕宮殿，土木工程同時興起，督促進度非常嚴厲，朝廷內外騷動不安，很多人都想作亂。
桓玄派使者加封益州刺史毛璩為散騎常侍、左將軍。毛璩扣留了桓玄的使者，不接受他的任命。毛璩是毛寶的孫子。桓玄任命桓希為梁州刺史，分彆命令眾將戍守三巴地區來防備毛璩。毛璩向遠近地區傳布檄文，列舉桓玄的罪狀，派巴東太守柳約之、建平太守羅述、征虜司馬甄季之打敗了桓希等人，接著率領部眾進軍駐守白帝。
劉裕跟隨徐、兗二州刺史，安成王桓修入朝。桓玄對王謐說：“劉裕的風度氣質不一般，是個人中豪傑。”每次遊樂聚會，桓玄必定殷勤地接待他，賞賜非常豐厚。桓玄的皇後劉氏，有智慧和洞察力，對桓玄說：“劉裕走路像龍，步伐像虎，神態不凡，恐怕最終不會屈居人下，不如早點除掉他。”桓玄說：“我正要平定中原，除了劉裕沒有誰可以任用；等平定了關、河地區，再另外商議這件事吧。”
桓玄任命桓弘為青州刺史，鎮守廣陵；任命刁逵為豫州刺史，鎮守曆陽。桓弘是桓修的弟弟；刁逵是刁彝的兒子。
劉裕和何無忌同乘一條船回到京口，秘密謀劃恢複晉朝皇室。劉邁的弟弟劉毅住在京口，也和何無忌謀劃討伐桓玄。何無忌說：“桓氏勢力強大，能對付得了嗎？”劉毅說：“天下的事本來就有強有弱，如果行事不合道義，再強也會變弱，隻擔心找不到主持大事的人罷了。”何無忌說：“天下民間並非沒有英雄。”劉毅說：“我所看到的隻有劉下邳指劉裕）。”何無忌笑著不說話，回去後把這事告訴了劉裕，於是和劉毅定下了計謀。
當初，太原人王元德和他的弟弟王仲德為苻氏起兵攻打後燕主慕容垂，沒成功，逃奔到晉朝，朝廷任命王元德為弘農太守。王仲德見桓玄稱帝，對人說：“自古以來改朝換代確實不止一族，但現在起來反抗的人恐怕不足以成就大事。”
平昌人孟昶是青州主簿，桓弘派孟昶到建康，桓玄見到他後很喜歡，對劉邁說：“在出身寒微的讀書人中找到一個合適的尚書郎，你和他是同州人，難道不認識嗎？”劉邁向來和孟昶關係不好，回答說：“我在京口時，沒聽說孟昶有什麼特殊才能，隻聽說他們父子之間常常互相贈詩罷了。”桓玄笑了笑，就不再提這事了。孟昶聽說後很恨劉邁，回到京口後，劉裕對孟昶說：“民間應當會有英雄崛起，你聽說過嗎？”孟昶說：“如今的英雄還能有誰，正是你啊！”
於是劉裕、劉毅、何無忌、王元德、王仲德、孟昶以及劉裕的弟弟劉道規、任城人魏詠之、高平人檀憑之、琅邪人諸葛長民、河內太守隴西人辛扈興、振威將軍東莞人童厚之，一起合謀起兵。劉道規是桓弘的中兵參軍，劉裕派劉毅到江北和劉道規、孟昶會合，一起殺掉桓弘，占據廣陵；諸葛長民是刁逵的參軍，派諸葛長民殺掉刁逵，占據曆陽；王元德、辛扈興、童厚之在健康，讓他們聚集部眾攻打桓玄作為內應；約定時間一起行動。
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孟昶的妻子周氏家境富裕，孟昶對她說：“劉邁在桓玄麵前詆毀我，害得我一生都要沉淪，我決定要起兵反抗。你最好早點和我斷絕關係，要是將來我得了富貴，再迎接你回來也不晚。”周氏說：“你父母還在世，想要謀劃這樣非同尋常的大事，哪裡是我一個婦人能勸得了的！就算事情沒成，我也會在官府裡侍奉公婆，從道義上講，我沒有離開你的道理。”孟昶惆悵了很久才起身。周氏追上他讓他坐下，說：“看你的舉動，不是要和我商量什麼，不過是想要財物罷了。”接著指著懷裡的孩子給他看，說：“就算是賣了這個孩子，我也不會吝惜。”於是把家裡的錢財都拿出來給了孟昶。孟昶弟弟孟顗的妻子，是周氏的堂妹，周氏騙她說：“昨天夜裡做了個很不吉利的夢，家裡紅色的東西應該都拿出來鎮邪。”堂妹信了她的話，把紅色物品都給了她，周氏就把這些東西全都縫成了軍士的戰袍。
何無忌夜裡在屏風後起草檄文，他的母親是劉牢之的姐姐，登上梯子偷偷看他，哭著說：“我比不上東海的呂母，這是很明顯的了。你能有這樣的舉動，我還有什麼遺憾的！”她問和何無忌一起謀劃的人是誰，何無忌說：“是劉裕。”他母親更高興了，還給他講桓玄必定失敗、起兵必定成功的道理來鼓勵他。
乙卯這天，劉裕借口打獵，和何無忌召集了一百多個同夥。丙辰這天一早，京口城門打開，何無忌穿著傳詔官的衣服，謊稱是皇帝的使者，走在前麵，同夥們跟著一起進城，立刻斬殺了桓修並示眾。桓修的司馬刁弘率領文武官員趕來，劉裕登上城牆對他們說：“郭江州已經在尋陽侍奉皇帝複位了，我們都接到秘密詔書，要誅殺叛逆黨羽，現在逆賊桓玄的頭應該已經掛在大航了。各位難道不是大晉的臣子嗎？現在過來想做什麼？”刁弘等人相信了，就收兵退走了。
劉裕問何無忌：“現在急需一個府主簿，從哪裡能找到呢？”何無忌說：“沒人比劉道民更合適。”劉道民就是東莞人劉穆之。劉裕說：“我也認識他。”立刻派人騎馬去召見他。當時劉穆之聽到京口有喧嘩聲，一早就出門到路口，正好和使者遇上。劉穆之盯著使者看了很久沒說話，接著回到屋裡，把粗布衣服改成褲子，就去見劉裕了。劉裕說：“我們剛舉起大義的旗幟，正處在艱難的時候，急需一個軍吏，你覺得誰能勝任？”劉穆之說：“您的府署剛建立，軍吏確實需要有才能的人，倉促之間，大概沒有比我更合適的了。”劉裕笑著說：“你能屈就，我的大事就成了。”當即就任命他為主簿。
孟昶勸說桓弘當天出去打獵，天還沒亮，桓弘就打開城門讓獵人們出去；孟昶和劉毅、劉道規率領幾十個壯士直接衝進去，桓弘正在喝粥，立刻就被斬殺了。他們趁機召集部眾渡過長江。劉裕派劉毅誅殺了刁弘。
在此之前，劉裕派同謀周安穆進入建康報告劉邁，劉邁雖然答應了，但心裡很害怕。周安穆擔心事情泄露，就騎馬回去了。桓玄任命劉邁為竟陵太守，劉邁想趕緊去郡裡上任。當天夜裡，桓玄給劉邁寫信說：“北府那邊的人心怎麼樣？你最近見了劉裕，他說了些什麼？”劉邁以為桓玄已經知道了他們的謀劃，一早就去告訴了桓玄。桓玄大驚，封劉邁為重安侯。不久又嫌棄劉邁沒抓住周安穆，讓他跑了，就殺了劉邁，還把王元德、辛扈興、童厚之等人全都殺了。
大家推舉劉裕為盟主，總管徐州事務，任命孟昶為長史，鎮守京口，檀憑之為司馬。彭城來應募的人，劉裕都讓郡主簿劉鐘統領。丁巳這天，劉裕率領徐、兗二州的一千七百人馬，在竹裡駐軍，向遠近地區發布檄文，聲稱益州刺史毛璩已經平定了荊楚地區，江州刺史郭昶之在尋陽侍奉皇帝複位，鎮北參軍王元德等人都率領部眾占據了石頭城，揚武將軍諸葛長尼已經占據了曆陽。
桓玄把住處遷回皇宮，召集侍從官員都住進官署裡；加封揚州刺史新安王桓謙為征討都督，讓殷仲文代替桓修做徐、兗二州刺史。桓謙等人請求趕緊派兵攻打劉裕，桓玄說：“他們的士兵很精銳，抱著必死的決心，如果有什麼失誤，他們的士氣就會高漲而我的大事就完了；不如把大軍屯在覆舟山等著他們。他們空跑二百裡路，什麼也得不到，銳氣已經受挫，突然見到大軍，必定會驚慌失措；我們按兵不動列好陣勢，不和他們交鋒，他們求戰不成，自然就會潰散退走，這是最好的計策。”桓謙等人堅持請求攻打，桓玄才派頓丘太守吳甫之、右衛將軍皇甫敷先後北上。桓玄心裡特彆擔憂害怕。有人說：“劉裕等人是烏合之眾，勢力弱小，肯定成不了事，陛下何必這麼擔心！”桓玄說：“劉裕算得上是一代梟雄，劉毅家裡連一石糧食的儲備都沒有，卻敢在賭博時一擲百萬，何無忌很像他的舅舅劉牢之；他們一起舉事，怎麼能說成不了事呢！”
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南涼王禿發傉檀害怕後秦強大，就去掉年號，撤銷尚書丞郎等官職，派參軍關尚出使後秦。秦王姚興說：“車騎將軍指禿發傉檀）向我稱臣進貢，卻擅自興兵建造大城，這難道是做臣子的道理嗎？”關尚說：“王公設置險阻來守衛自己的國家，這是先王的製度。車騎將軍地處偏遠的藩國，靠近強大的敵人，這都是為國家加強邊防，沒想到陛下竟然會嫌棄。”姚興覺得他說得對。禿發傉檀請求兼任涼州刺史，姚興沒答應。
當初，袁真殺了朱憲，朱憲的弟弟朱綽逃投奔了桓溫。桓溫攻克壽陽後，朱綽就打開袁真的棺材，鞭屍泄憤。桓溫發怒，要殺朱綽，桓衝求情才免了他的死罪。朱綽像對待父親一樣侍奉桓衝，桓衝去世後，朱綽吐血而死。劉裕攻克京口後，任命朱綽的兒子朱齡石為建武參軍。三月戊午初一，劉裕的軍隊和吳甫之在江乘相遇。即將交戰時，朱齡石對劉裕說：“我家世代受桓氏的厚恩，不想和他們刀兵相向，請求讓我在軍隊後麵。”劉裕認為他有義氣，就答應了。吳甫之是桓玄的猛將，他的士兵很精銳。劉裕手持長刀，大喊著衝過去，敵軍紛紛潰敗，當即斬殺了吳甫之，進軍到羅落橋。皇甫敷率領幾千人迎戰，寧遠將軍檀憑之戰敗身亡。劉裕作戰更加勇猛，皇甫敷把他包圍了好幾層，劉裕靠著大樹頑強抵抗。皇甫敷說：“你想怎麼死！”拔出戟就要刺他，劉裕瞪著眼睛嗬斥他，皇甫敷嚇得後退。劉裕的同夥很快趕到，射中了皇甫敷的額頭，他倒下了，劉裕拔刀衝上去。皇甫敷說：“你有天命，我把子孫托付給你。”劉裕斬殺了他，還優厚地安撫了他的家人。劉裕把檀憑之率領的士兵交給參軍檀祗統領。檀祗是檀憑之的侄子。