甲辰科金榜題名，賜進士出身，沈驚鴻的人生軌跡再次發生了關鍵的偏轉。按照慣例，新科進士除一甲三名直接入翰林院為修撰、編修外，二甲、三甲進士則需經過“館選”，優者入翰林院為庶吉士，繼續深造，被視為“儲相”；其餘則分發各部觀政，或外放州縣。
沈驚鴻以二甲進士的身份，毫無懸念地通過了館選，被選為翰林院庶吉士。這固然有他自身才學紮實、策論切中時弊的因素，但明眼人都知道，這其中也少不了太子朱常洛和座師徐光啟的暗中推動。翰林院清貴，是積累資曆、結交清流、窺探朝局的最佳起點，將沈驚鴻放在這個位置，顯然是對他寄予了更高的期望。
於是，年僅十四歲的沈驚鴻，換上了淺青色的七品翰林院編修常服庶吉士品級等同編修），成為了大明帝國最高文化學術機構——翰林院中，有史以來最年輕的一員。
翰林院位於皇城之內，左順門之北，環境清幽，古木參天。這裡彙聚了天下最頂尖的文人學士，日常職責包括起草詔書、修纂國史、講解經筵、以及充當皇帝的文學侍從。對於新進的庶吉士而言，主要任務則是學習深造，在翰林院教習學士的指導下，研習朝廷典章製度、曆代政治得失，並參與一些文史編纂工作。
沈驚鴻的到來，在這座古老的衙門裡引起了一陣不大不小的波瀾。同科的庶吉士大多已是二三十歲的年紀，麵對這個身材尚未完全長開、麵容猶帶稚氣，卻已是名滿京華的“小同年”，心情頗為複雜。有好奇，有審視，有因其年紀和背景匠作、軍務）而產生的隱隱輕視，也有對其連番際遇的暗自羨慕。
“沈年兄，久仰大名，今日得見，果然少年英才！”一位來自江南、年約二十五六的庶吉士拱手寒暄，語氣雖客氣，眼神卻帶著探究。
“王年兄過譽，驚鴻僥幸登第，日後還需向諸位年兄多多請教。”沈驚鴻態度謙和，舉止沉穩，並無少年得誌的驕矜之氣。他深知，在這裡，資曆和學問同樣重要。
翰林院的日常生活，對沈驚鴻而言，是全新的體驗。每日需點卯，參與集體修書他被分派參與《萬曆起居注》的部分整理工作），聆聽教習學士講解《大明會典》或前朝實錄，偶爾也會有經筵講座，由翰林學士為皇帝或太子）講解經史。雖然萬曆皇帝早已怠政，經筵時常廢止，但翰林院內部的學術氛圍依舊濃厚。
沈驚鴻並未因環境的改變而放棄自己的堅持。他利用翰林院藏書豐富的便利，繼續深入研讀典章製度，尤其關注兵部、工部的相關則例，以及曆代經濟政策的演變。同時，他也將在製造局和神機營的實踐經驗，以一種更為學術化、理論化的方式融入自己的思考。
在一次關於《周禮·考工記》的研討中，當其他庶吉士大多圍繞著“百工之事，皆聖人之作也”進行道德闡發時，沈驚鴻卻提出了不同的見解：
“諸位年兄，學生以為，《考工記》所言‘知者創物，巧者述之守之’，不僅在於尊崇聖人，更揭示了‘創物’與‘述守’相輔相成之理。譬如當今之火器，若無名匠‘創物’改良其法，則射程精度無以提升；若無良工‘述守’標準化其製，則量產列裝無以保障。格物之精微，實與治國之大道相通，皆需‘創’與‘守’並重，方能固本培元，應對時艱。”
這番議論，將“奇技淫巧”的匠作之事，提升到了與治國理政相通的高度，引經據典，卻又彆開生麵，讓在場的教習學士和部分庶吉士為之側目。有人暗自點頭，認為其見識不凡；也有人不以為然，覺得他終究脫不了“匠氣”。
除了學術活動，翰林院也是消息靈通、人際關係微妙之地。沈驚鴻在這裡，能更清晰地感受到朝堂之上的暗流湧動。關於國本太子地位）、關於礦監稅使、關於遼東邊患、關於日益空虛的國庫……各種信息和爭論，都會以各種形式滲透到這座清貴的衙門裡。
他謹慎地處理著與同僚的關係，不結黨，不妄議，多數時間沉心於書卷和自己的思考。但他“格物致知”的名聲，以及他與太子、徐光啟的密切關係，還是讓他無法完全置身事外。偶爾會有不同派係的官員，試圖通過同科或同鄉的關係與他接觸、試探。
這一日，沈驚鴻散衙回府，臉上帶著一絲疲憊。蘇卿卿敏銳地察覺到了，遞上一杯熱茶，輕聲問道：“可是翰林院中事務繁瑣？”
沈驚鴻搖搖頭，接過茶盞：“事務倒還尋常。隻是……身處其中，方知清議之重，亦知做事之難。”他將今日聽聞的，關於有禦史再次抨擊“蕩寇銃”及其後續研發“靡費甚巨，於國無補”的言論告訴了蘇卿卿。
蘇卿卿靜靜聽完，沉吟道：“木秀於林，風必摧之。夫君如今身在翰林，已是清流，所言所行，更易引人注目。那些非議，或許並非針對器物本身，而是……”她頓了頓，沒有明說，但意思很明顯，是針對他這個人，以及他背後的支持力量。
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沈驚鴻歎了口氣：“我明白。所以更需謹言慎行，但該做之事，亦不能因噎廢食。”他看向蘇卿卿，“製造局那邊，張匠頭他們按計劃進行的預研，沒有動用正項錢糧吧？”
“夫君放心，賬目我都仔細核對過，所用皆是從前殿下賞賜以及製造局自身結餘的研發款項，每一筆都有據可查。”蘇卿卿肯定地回答，她的細心和管理能力，讓沈驚鴻在公務纏身時，對“後方”無比安心。
有了妻子的支持，沈驚鴻的心緒平複了許多。他深知，翰林院的生涯是他積累政治資本和學識的重要階段，他必須充分利用這裡的環境和資源，同時也要頂住壓力，堅持自己的方向。
隨著時間的推移，沈驚鴻憑借其紮實的學問、務實的風格以及超越年齡的沉穩，漸漸在翰林院站穩了腳跟。他參與編纂的《萬曆起居注》部分，條理清晰，秉筆直書，獲得了教習學士的好評。他在一些非正式討論中發表的關於邊備、財政的見解，雖然偶爾顯得“激進”，但其數據支撐和邏輯推演，也讓一些開明的同僚開始認真思考。
他就像一顆投入平靜湖麵的石子，雖然年輕，卻已在翰林院這潭深水中，激起了屬於自己的漣漪。所有人都清楚，這位史上最年輕的庶吉士，他的未來，絕不會僅僅局限於這清貴的翰林院。他的目光，始終注視著那遙遠的邊關，以及那關乎大明國運的技術革新之路。而在那條路上，金屬的冷光，似乎正穿透時間的迷霧，隱隱閃爍。
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