九州告急的烽火，迅速燒到了本州。
江戶城天守閣內，德川家康看著黑田長政的急報和關於明軍在九州恐怖戰力的密探詳述，麵色凝重如水。
肥後陷落、加藤清正戰死，損失遠超預期。他深知明軍背後是整個大明帝國的戰爭潛力，絕非尋常“倭寇”可比。
強硬派以本多正信等為首主張立刻動員西國大名，組建大軍渡海支援九州，將明軍趕下海—“否則幕府威信掃地，天下動搖！”
穩健派以酒井忠世等為首則憂心忡忡：“明軍火器犀利，戰法凶悍，九州地形複雜，勞師遠征，勝算幾何？若主力有失，關東空虛，豐臣遺孽或西國雄藩趁機作亂，如之奈何？”
更有甚者，私下認為九州諸侯尤其島津、加藤過去桀驁不馴，消耗一下也未嘗不可。
老謀深算的家康最終采取了折衷且更具控製力的策略：
正式任命黑田長政為“征夷總大將”討伐明軍，授予其調動九州及本州西部部分大名兵力的權力。同時，象征性地從直屬旗本中抽調三千精銳由心腹大將率領，並調撥一批火藥、鐵炮火繩槍運往小倉，以示幕府支持。
嚴令本州西部所有大名特彆是中國地區的毛利家、四國的蜂須賀家等進入戰備狀態，整飭軍備，隨時聽候調遣。但強調，未得幕府明令，不得擅自渡海進入九州。
其核心意圖是讓九州諸侯尤其是非嫡係與明軍先血拚消耗，幕府力量則作為最後底牌和仲裁者。
秘密遣使通過琉球或朝鮮渠道儘管希望渺茫，試圖了解明朝此次遠征的真實意圖和底線，有無和談可能。
…………
廣島城的毛利輝元，作為西日本最強大的外樣大名，同樣收到了黑田長政的求援和幕府的備戰令。他的心情極為複雜。一方麵，明軍入侵威脅到整個日本，唇亡齒寒。另一方麵，他對德川幕府深懷戒心，擔心被當槍使，消耗自身實力。同時，九州若被明軍或幕府徹底控製，對處於本州與九州之間的毛利家也非好事。
他采取的策略是：大規模動員領內軍隊，修繕戰船，囤積糧草，做出隨時可以出兵的姿態，既回應幕府，也威懾明軍和潛在的對手包括幕府。
嚴令前線部隊不得輕舉妄動，密切關注九州戰局和幕府後續動作。他需要看清明軍的真正實力和幕府的決心，才會決定是全力支援九州，還是趁機與各方討價還價，攫取更大利益。毛利家的水軍村上水軍餘脈開始加強在關門海峽和瀨戶內海西口的巡邏。
長州毛利、土佐山內、伊予加藤等本州西部和四國的大名，雖未直接受敵，但恐慌情緒蔓延。
征召令下，農兵被集結，市場物價飛漲尤其是鐵、硝石、糧食，領內氣氛緊張。一些小藩主則惶惶不可終日，四處打探消息，尋求強大鄰居的庇護。
在黑田長政的強力召集和幕府“征夷總大將”名分的加持下，昭武三年1601二月初，九州抗明聯盟的雛形在小倉城艱難成型。與會者皆是各方重量級代表。
黑田長政主持者：代表幕府意誌，態度最強硬。他力主組建一支以九州諸藩為核心，幕府軍為後盾的聯合大軍，趁明軍在肥後立足未穩，發動大規模反攻，一舉將其擊潰或趕回薩摩。
立宗茂柳川藩主：被譽為“西國無雙”的名將，性格剛烈勇猛。他對明軍的暴行尤其加藤清正之死義憤填膺，主戰最力。他帶來了柳川藩最精銳的部隊，並以其威望吸引了眾多浪人和小豪族加入。他主張發揮日軍熟悉地形、擅長近戰夜襲的優勢，以精銳部隊進行機動靈活的打擊。
鍋島勝茂佐賀藩主：代表肥前龍造寺鍋島勢力。態度較為務實謹慎。他擔憂明軍水師對佐賀沿海的威脅，更擔心與明軍硬拚消耗自身實力。他強調穩紮穩打，依托築後川等天險建立穩固防線，消耗明軍銳氣，等待幕府大軍或本州援軍。
大友義統的代表表達了豐後藩抵抗的決心，但反複強調自身力量薄弱，亟需盟友，特彆是立家和黑田家的直接支援。
島津忠恒的秘密代表偽裝成商人：傳遞了島津家“身在曹營心在漢”的立場，承諾提供明軍在薩摩、肥後部分駐軍、工事、糧道的情報真偽需甄彆，並暗示在關鍵時刻，島津舊部可在敵後發動襲擾。
其他還有馬晴信島原、相良賴房人吉等較小勢力的代表，多依附於幾大勢力，表達同仇敵愾之意，但能提供的兵力有限。
經過激烈的爭吵、妥協和黑田長政的強力斡旋甚至隱含幕府的威脅，聯盟勉強達成以下決議：
組建聯合軍，以立宗茂為總大將前線指揮，黑田長政總督後勤及聯絡幕府。第一期集結兵力：立家：3500人含精銳武士800；黑田家：3000人含旗本精銳1000；鍋島家：2500人；大友家：2000人；其他九州諸藩及浪人眾：約3000人。
總計：約一萬四千人宣稱三萬，實則遠不足。幕府承諾的3000旗本作為戰略預備隊，暫駐小倉。
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聯軍以“收複肥後，屏障築前築後”為首要目標。主力由立宗茂統率，沿築後川向肥後境內主要是北部未被明軍完全控製的區域推進，尋求與明軍野戰。
鍋島勝茂部負責保障側翼尤其是對可能從有明海方向登陸的明軍水師的警戒和後勤線。大友軍負責牽製可能從日向方向北上的明軍偏師。黑田長政坐鎮小倉，統籌後勤糧秣主要從本州西部征調和聯絡各方。
黑田強調利用九州多山多河的地形，避免在開闊地與明軍火器硬撼。多采用夜襲、伏擊、騷擾糧道、利用鐵炮火繩槍三段擊戰術在複雜地形對抗明軍火銃兵等戰法。立宗茂尤其強調“以正合，以奇勝”，將親自率領精銳武士隊，作為“奇兵”使用。
各方共享關於明軍動向的情報島津方麵提供的情報被單獨處理，謹慎使用。組織忍者尤其黑田、立家豢養的“亂波”、“夜襲”深入敵後，刺探軍情，破壞糧道，甚至刺殺明軍軍官。