其攻粵部署是龍軍直取欽（州）、廉（州）、高（州）、雷（州）地區，東圖廣州，並切斷粵桂通路。
福建派兩混成旅沿汀江入粵，進占嘉應州（治今梅州市）、惠州（今惠州市）地區，西攻廣州。
江西派一混成旅逾大庾嶺，入韶州（治今韶關市）地區，南攻廣州，形成三麵夾擊之勢。
前邊提到過。十月月二十三日，北洋係收買廣東潮梅鎮守使莫擎宇，宣告“對省獨立”。與廣東省政府脫離關係，直接聽命於北京政府，並立即派兵攻打惠州。
莫擎宇發難興兵，為段祺瑞大舉圖粵製造了契機。
十月二十四日，閩督李厚基在段政府授意下通電支持莫擎宇，並令汀漳鎮守使兼北洋第十四混成旅旅長臧致平率兵十營進援。
此後不久，龍濟光也由瓊州出兵，抄襲粵省側背。於是，段係軍隊攻粵之戰全麵展開。
前邊也曾提到，一九一七年十一月十日，陸榮廷在梧州召開軍事會議，討論粵省守防作戰計劃。會議推舉陸榮廷為兩廣巡閱使兼廣東督軍。陸自稱“年老多脖”，派其親信、原廣惠鎮守使莫榮新代理廣東督軍。
莫榮新上任後，鑒於莫擎宇盤踞潮汕，李厚基出兵援潮，在陸榮廷的授意下，決定在進剿莫擎宇部之同時，實施大規模攻閩作戰，以策應湘省軍事。
十一月二十七日，由程璧光出麵，召集滇軍總司令李烈鈞、粵軍總司令陳炯明、督軍署參謀長郭椿森以及胡漢民、汪精衛等，在廣州海珠開軍事會議，商訂攻閩方略。
決定成立“征閩海陸聯合軍”，以程璧光為總司令，指揮海軍、滇軍、粵軍三支部隊，分五路攻閩。兵力包括駐粵海軍全部，陳炯明之粵軍二十營，駐粵滇軍全部，和粵省地方軍八營，桂軍一支隊。
具體部署是以陳炯明部二十營進攻漳州，為第一路。
李烈鈞統率滇軍兩個師進攻汀州（今長汀），為第二路。
沈鴻英率“平潮軍”十二營進攻上杭，為第三路。
劉誌陸率“平潮軍”十五營進攻詔安，為第四路。
程璧光率海軍艦隊襲擊福州，為第五路。
計劃確定不久，得悉龍濟光於十二月十一日由瓊州出兵攻粵，遂重新調整部署由攻閩粵軍總司令陳炯明繼續率所部進攻閩省；以駐粵滇軍第六軍軍長方聲濤為征閩靖國軍總指揮，率所部第八旅（旅長伍毓瑞）、第九旅（旅長夏述唐）進駐潮、汕，策應陳炯明部作戰；以李烈鈞為討龍軍總指揮，率沈鴻英、林虎兩支部隊赴粵東南抵禦龍濟光部；海軍則全部參加討龍作戰。
陳炯明於一九一七年十二月八日就任攻閩粵軍總司令職後，便著手進行作戰準備。
由於原二十營粵軍裝備低劣，每營僅有槍二三百支，莫榮新又從中掣肘，除撥少量開拔費外，餉彈方麵概不負責。
陳炯明等深感實力單薄，出兵困難，在征得孫中山同意後，施行一項擴充實力的方案一麵向地方士紳借槍，一麵向海外革命人士募捐餉款。
其中規定，能募到人槍二百者為營長，人槍六十者為連長，人槍二十者為排長，不願擔任軍職的按槍付錢。
經過一番努力，共籌集到各種槍二千餘支，子彈數萬發。這樣，加上滇軍方聲濤部，攻閩軍總數達二萬人左右。
陳炯明將攻閩軍編為若乾個支隊，每支隊轄二至四個營不等，命鄧鏗為參謀長。
一九一八年一月二十五日，陳炯明在廣州誓師攻閩。二十七日，率主力部隊離開廣州，開赴汕頭。
這時，閩省全部軍隊約有三個師的兵力，其中有福建第一旅（旅長姚建屏）駐福州；北洋第十混成旅（旅長唐國謨）駐廈門；北洋第十四混成旅（旅長臧致平）駐詔安；閩省清鄉隊（總司令張清汝）駐延平（今南平市）。另有巡防隊約四個團分駐各地。總計二萬二千餘人。
閩督李厚基得到粵軍將要攻閩的情報後，一麵調唐國謨等部開赴永定、上杭一帶趕築工事，準備抗擊粵軍，一麵迭電北京政府派兵援閩。
段祺瑞命童葆暄率浙軍第一師緊急赴閩。
一九一八年二月中旬，攻閩粵軍進抵潮州（今潮安）、汕頭一帶。但是，陳炯明對攻閩作戰並不熱心，部隊進抵潮汕地區後，忙於招兵索餉，遲遲不向閩省發動進攻，致使北軍得以從容調遣兵力，擴充力量，加強並完善了在閩西南的防禦部署。
三月二十二日，孫中山致電陳炯明，指出“若乘敵軍初到，地形未諳，利用內應，猶可先發製人”，宜“速下攻擊命令”。但陳炯明以“布置未周”為借口，對孫中山之電令置若罔聞。